转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001111; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023725-RA_Salv SmilChr06G001111 MYB XP_057768512.1 MP00388 AAAGTTAGGTATAA

可能结合的靶基因

9774 个结合位点 6870 个候选靶基因 第 90 / 138 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002789 Chr01 NC_080387.1:46381399-46381412promoter 内 1400-1413 bp - 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46363649-46378811(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGATTAGGTATAC
SmilChr02G003754 Chr02 NC_080388.1:59171248-59171261promoter 内 1345-1358 bp + 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59173904-59174722(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAATTTAGGTACAT
SmilChr02G001544 Chr02 NC_080388.1:28696546-28696559promoter 内 1337-1350 bp + 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28690398-28693895(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCTGACCTAACGCC
SmilChr01G002940 Chr01 NC_080387.1:48179070-48179083promoter 内 1319-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48181752-48185923(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTGGTTTGGTATAA
SmilChr02G005361 Chr02 NC_080388.1:74326965-74326978promoter 内 1287-1300 bp - 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74329679-74332328(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAATACCTAATTAA
SmilChr02G004123 Chr02 NC_080388.1:63491098-63491111promoter 内 1250-1263 bp + 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63493849-63496261(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTTGTTAGGTTCTA
SmilChr03G000368 Chr03 NC_080389.1:4112644-4112657promoter 内 1237-1250 bp - 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4115408-4119854(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CATGACCTAACAAC
SmilChr01G000825 Chr01 NC_080387.1:17794813-17794826promoter 内 1227-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17789722-17792052(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTTAACCTAACGCA
SmilChr01G003571 Chr01 NC_080387.1:54287774-54287787promoter 内 1173-1186 bp + 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54283439-54284959(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGAAACCTAACAAG
SmilChr02G004624 Chr02 NC_080388.1:68738915-68738928promoter 内 1029-1042 bp + 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 68741887-68742788(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAGTTAGGCTCCT
SmilChr01G004141 Chr01 NC_080387.1:59914543-59914556promoter 内 997-1010 bp - 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59900126-59911552(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGGGTTAGGTCATT
SmilChr02G002376 Chr02 NC_080388.1:41646758-41646771promoter 内 954-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41649805-41652168(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGCGTTAGGTCAGA
SmilChr01G002265 Chr01 NC_080387.1:39441212-39441225promoter 内 925-938 bp + 3063 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39444288-39446912(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGAGTTAGGCAACC
SmilChr03G000888 Chr03 NC_080389.1:10130952-10130965promoter 内 893-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10134060-10138604(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTAGTTAGGCATTA
SmilChr02G000558 Chr02 NC_080388.1:7860779-7860792promoter 内 885-898 bp - 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7863895-7865043(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AATGACCTAACCCT
SmilChr01G004739 Chr01 NC_080387.1:65580352-65580365promoter 内 829-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 65583524-65588628(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TATGTTAGGTGTTT
SmilChr02G004551 Chr02 NC_080388.1:68047786-68047799promoter 内 805-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 68042315-68044603(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGTATTAGGTATCG
SmilChr01G004748 Chr01 NC_080387.1:65650564-65650577promoter 内 657-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 65644932-65647233(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCTACTCGA
SmilChr01G005121 Chr01 NC_080387.1:69014247-69014260promoter 内 630-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 69017618-69022027(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAGTTAGGCCACA
SmilChr03G001607 Chr03 NC_080389.1:20431728-20431741promoter 内 566-579 bp - 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20435163-20436275(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAATACCTAATCTC
SmilChr01G001011 Chr01 NC_080387.1:21233241-21233254promoter 内 446-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21236796-21236868(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AATTACCTAATTTT
SmilChr01G000674 Chr01 NC_080387.1:14952300-14952313promoter 内 441-454 bp - 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14946348-14948753(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTTAGTAGGTATGA
SmilChr01G004251 Chr01 NC_080387.1:60800579-60800592promoter 内 350-363 bp - 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60804230-60806045(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAGTGCCTAACTGA
SmilChr02G002469 Chr02 NC_080388.1:43080137-43080150promoter 内 343-356 bp - 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43075229-43076492(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGCGTTAGGTCAGA
SmilChr01G001763 Chr01 NC_080387.1:32411195-32411208promoter 内 341-354 bp + 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32414855-32420349(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGCGTTAGGTCAGA
SmilChr01G004246 Chr01 NC_080387.1:60771529-60771542promoter 内 326-339 bp + 3662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60765462-60767867(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAATACCTAATATT
SmilChr01G001686 Chr01 NC_080387.1:31093419-31093432promoter 内 138-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31086192-31089569(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACATACCTAATAGT
SmilChr01G005453 Chr01 NC_080387.1:71584816-71584829promoter 内 82-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71575679-71580910(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAATTTAGGTATAA
SmilChr02G000235 Chr02 NC_080388.1:3010516-3010529promoter 内 71-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3014446-3015135(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAGATTAGGTATTA
SmilChr02G003339 Chr02 NC_080388.1:54602858-54602871promoter 内 1033-1046 bp + 2955 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 54605826-54606361(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTAATTAGGTAGCT
SmilChr02G003601 Chr02 NC_080388.1:57247873-57247886promoter 内 2974-2987 bp + 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 57243195-57246859(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAAAACCTAACCGT
SmilChr02G004514 Chr02 NC_080388.1:67676557-67676570promoter 内 2892-2905 bp + 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 67677666-67680939(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTGTTAGGTGATA
SmilChr01G005264 Chr01 NC_080387.1:70105370-70105383promoter 内 2099-2112 bp + 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 70107272-70111578(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTAGTTAGGCATCC
SmilChr01G005281 Chr01 NC_080387.1:70202401-70202414promoter 内 2049-2062 bp + 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 70204353-70208629(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTAGTTAGGCATCC
SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60712420-60712433promoter 内 1127-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 60709018-60709559(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CATCACCTAACAAC
SmilChr01G004204 Chr01 NC_080387.1:60492763-60492776promoter 内 991-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 60495773-60497387(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGTTAGGTGAAT
SmilChr01G004236 Chr01 NC_080387.1:60712420-60712433promoter 内 673-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 60708292-60709105(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CATCACCTAACAAC
SmilChr01G003878 Chr01 NC_080387.1:57109407-57109420promoter 内 3407-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 57107397-57108826(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGATACCTAATTAA
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SmilChr01G001922 Chr01 NC_080387.1:34353471-34353484promoter 内 3271-3284 bp + 717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 34352275-34352754(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCGAATTCT
SmilChr01G003557 Chr01 NC_080387.1:54192032-54192045promoter 内 3022-3035 bp + 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 54188417-54191066(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GACAACCTAACCAA
SmilChr01G002375 Chr01 NC_080387.1:40962388-40962401promoter 内 3014-3027 bp + 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 40963375-40970669(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAAATTAGGTATTA
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SmilChr02G001278 Chr02 NC_080388.1:23473789-23473802promoter 内 2050-2063 bp - 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 23471456-23471851(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACGGTTAGGTCATA
SmilChr02G004073 Chr02 NC_080388.1:63014341-63014354promoter 内 1989-2002 bp + 1999 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 63016353-63020836(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAGTTAGGCTACA
SmilChr02G005247 Chr02 NC_080388.1:73614486-73614499promoter 内 1694-1707 bp - 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 73616793-73625585(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCCTACCTAAATTG
SmilChr02G001913 Chr02 NC_080388.1:34422455-34422468promoter 内 1630-1643 bp - 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 34424826-34426167(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACATACCTACTTGC