转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 92 / 143 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005357 Chr02 NC_080388.1:74306997-74307008promoter 内 2151-2162 bp - 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 74302413-74305158(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAAG
SmilChr04G003860 Chr04 NC_080390.1:54549998-54550009promoter 内 2132-2143 bp - 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54544578-54548140(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGT
SmilChr07G001595 Chr07 NC_080393.1:13261481-13261492promoter 内 2053-2064 bp - 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13255764-13259544(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr08G000393 Chr08 NC_080394.1:2757878-2757889promoter 内 1930-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2755113-2755818(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCA
SmilChr08G000030 Chr08 NC_080394.1:237144-237155promoter 内 1869-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 192477-235023(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCTG
SmilChr03G004551 Chr03 NC_080389.1:63476509-63476520promoter 内 1854-1865 bp - 2136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 63478656-63481096(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCTG
SmilChr04G003631 Chr04 NC_080390.1:52816752-52816763promoter 内 1835-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 52818918-52822519(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCTT
SmilChr02G000498 Chr02 NC_080388.1:6861810-6861821promoter 内 1573-1584 bp + 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6864238-6867223(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTG
SmilChr03G001440 Chr03 NC_080389.1:17114665-17114676promoter 内 1563-1574 bp - 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 17117103-17118739(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAA
SmilChr05G002460 Chr05 NC_080391.1:27122212-27122223promoter 内 1347-1358 bp - 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 27124866-27127639(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCACCTGTCAA
SmilChr01G003894 Chr01 NC_080387.1:57232362-57232373promoter 内 1321-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57235042-57237492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAA
SmilChr01G003911 Chr01 NC_080387.1:57378284-57378295promoter 内 1317-1328 bp - 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57380968-57383344(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAA
SmilChr02G002509 Chr02 NC_080388.1:43562087-43562098promoter 内 1265-1276 bp + 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43564823-43564951(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr02G002506 Chr02 NC_080388.1:43541319-43541330promoter 内 1261-1272 bp + 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43544059-43544187(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr05G001454 Chr05 NC_080391.1:13289242-13289253promoter 内 1218-1229 bp + 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13284606-13286470(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCCC
SmilChr04G000916 Chr04 NC_080390.1:11921290-11921301promoter 内 1067-1078 bp - 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11914037-11918367(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGTG
SmilChr08G001250 Chr08 NC_080394.1:9928559-9928570promoter 内 840-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9922763-9925409(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGC
SmilChr02G001049 Chr02 NC_080388.1:18563219-18563230promoter 内 797-808 bp - 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18566423-18567151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCTG
SmilChr03G002931 Chr03 NC_080389.1:46055647-46055658promoter 内 783-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46058865-46062019(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGT
SmilChr07G004707 Chr07 NC_080393.1:59940693-59940704promoter 内 774-785 bp + 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59943920-59946744(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAG
SmilChr01G001768 Chr01 NC_080387.1:32510065-32510076promoter 内 745-756 bp + 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32513321-32516105(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTG
SmilChr03G003575 Chr03 NC_080389.1:54378124-54378135promoter 内 705-716 bp - 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54372195-54374839(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGGT
SmilChr07G003519 Chr07 NC_080393.1:40315257-40315268promoter 内 664-675 bp + 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 40309917-40311931(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTG
SmilChr06G000982 Chr06 NC_080392.1:9592646-9592657promoter 内 659-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9595988-9599731(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTACA
SmilChr01G005021 Chr01 NC_080387.1:68197550-68197561promoter 内 642-653 bp + 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68190795-68194202(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAA
SmilChr08G000093 Chr08 NC_080394.1:567657-567668promoter 内 575-586 bp + 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 571083-573394(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCGT
SmilChr02G002970 Chr02 NC_080388.1:50220344-50220355promoter 内 270-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50212510-50216624(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr07G002662 Chr07 NC_080393.1:25838143-25838154promoter 内 209-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25833700-25834362(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTACA
SmilChr08G002108 Chr08 NC_080394.1:18935658-18935669promoter 内 117-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18939542-18941969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATG
SmilChr02G002537 Chr02 NC_080388.1:44161077-44161088promoter 内 100-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 44154115-44157187(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCACCTGTCAA
SmilChr06G000843 Chr06 NC_080392.1:7964564-7964575promoter 内 89-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7957261-7960663(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAGG
SmilChr03G002741 Chr03 NC_080389.1:43557412-43557423promoter 内 68-79 bp + 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43551979-43553490(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGA
SmilChr06G003295 Chr06 NC_080392.1:45490120-45490131promoter 内 3863-3874 bp - 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 4 45490258-45491220(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr04G002824 Chr04 NC_080390.1:44311494-44311505promoter 内 3903-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 44311592-44311990(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAG
SmilChr04G001827 Chr04 NC_080390.1:29807705-29807716promoter 内 3667-3678 bp - 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 29808039-29808850(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAT
SmilChr01G004828 Chr01 NC_080387.1:66435110-66435121promoter 内 2358-2369 bp - 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 66432362-66433478(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr03G002002 Chr03 NC_080389.1:29854682-29854693promoter 内 2295-2306 bp - 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 29848727-29852987(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTT
SmilChr05G000719 Chr05 NC_080391.1:5498611-5498622promoter 内 937-948 bp - 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 5501675-5503387(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr05G000658 Chr05 NC_080391.1:4956650-4956661promoter 内 869-880 bp + 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 4951831-4953529(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr04G001828 Chr04 NC_080390.1:29807705-29807716promoter 内 38-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 29811668-29813842(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAT
SmilChr02G003562 Chr02 NC_080388.1:56800366-56800377promoter 内 3978-3989 bp + 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 56800389-56800970(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATACCAGCTGTT
SmilChr02G004290 Chr02 NC_080388.1:65224799-65224810promoter 内 3953-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 65223581-65224762(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr01G005650 Chr01 NC_080387.1:72888186-72888197promoter 内 3825-3836 bp - 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 72886878-72888021(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATACCAGCTGTT
SmilChr01G003940 Chr01 NC_080387.1:57742659-57742670promoter 内 3736-3747 bp + 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 57740197-57742405(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAC
SmilChr03G003026 Chr03 NC_080389.1:47161867-47161878promoter 内 3071-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 47158180-47160948(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTT
SmilChr07G001448 Chr07 NC_080393.1:11255332-11255343promoter 内 2998-3009 bp - 992 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 11256335-11259836(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGA
SmilChr01G005610 Chr01 NC_080387.1:72647660-72647671promoter 内 2967-2978 bp - 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 72648694-72652315(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTACA
SmilChr05G003678 Chr05 NC_080391.1:49830307-49830318promoter 内 2834-2845 bp - 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 49828501-49829151(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTT
SmilChr01G002064 Chr01 NC_080387.1:36499556-36499567promoter 内 2408-2419 bp - 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 36495443-36497974(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTT
SmilChr01G002095 Chr01 NC_080387.1:36959778-36959789promoter 内 2334-2345 bp + 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 36961445-36963873(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTT