转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 96 / 137 下载 TSV

上一页 96 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000322 Chr08 NC_080394.1:2250391-2250405promoter 内 317-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2244535-2246721(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGAAGACGTGGAG
SmilChr06G002810 Chr06 NC_080392.1:40800386-40800400promoter 内 211-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40804176-40804733(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACGAGACGTGGCA
SmilChr02G004114 Chr02 NC_080388.1:63436521-63436535promoter 内 177-191 bp - 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63440345-63441890(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTTACACGTGGCA
SmilChr08G002619 Chr08 NC_080394.1:25543827-25543841promoter 内 145-159 bp + 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25547683-25549884(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAGTCCT
SmilChr03G003423 Chr03 NC_080389.1:52551905-52551919promoter 内 105-119 bp - 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52555801-52557613(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTTACACGTGGCA
SmilChr06G000152 Chr06 NC_080392.1:1071677-1071691promoter 内 21-35 bp + 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1062496-1067711(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCGATCACGTGGCT
SmilChr03G001338 Chr03 NC_080389.1:15618331-15618345promoter 内 2539-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 15619793-15620859(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr04G000872 Chr04 NC_080390.1:11026865-11026879promoter 内 1812-1826 bp + 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 11029054-11030131(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr02G000397 Chr02 NC_080388.1:4912283-4912297promoter 内 920-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 4915364-4916889(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCCACGTCACCCTC
SmilChr01G004871 Chr01 NC_080387.1:66834891-66834905promoter 内 122-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 66828607-66831026(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCAGAATG
SmilChr08G001867 Chr08 NC_080394.1:16026559-16026573promoter 内 3886-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 16026674-16028158(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGCACAT
SmilChr05G002844 Chr05 NC_080391.1:33878035-33878049promoter 内 3865-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 33862136-33877913(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr01G000642 Chr01 NC_080387.1:14420229-14420243promoter 内 3834-3848 bp - 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 14420396-14424491(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr02G005384 Chr02 NC_080388.1:74496203-74496217promoter 内 3794-3808 bp - 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 74494794-74496010(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGGCGCCA
SmilChr03G002224 Chr03 NC_080389.1:35061895-35061909promoter 内 3763-3777 bp + 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 35062133-35067198(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAATTAA
SmilChr02G003873 Chr02 NC_080388.1:60773761-60773775promoter 内 3751-3765 bp + 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 60771051-60773525(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATATTGACGTGGCG
SmilChr01G005655 Chr01 NC_080387.1:72904801-72904815promoter 内 3720-3734 bp + 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 72905082-72906357(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr02G001512 Chr02 NC_080388.1:28144441-28144455promoter 内 3674-3688 bp + 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 28144768-28222538(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGACTTT
SmilChr01G002935 Chr01 NC_080387.1:48109522-48109536promoter 内 3611-3625 bp - 376 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 48106910-48109146(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr01G004895 Chr01 NC_080387.1:67034088-67034102promoter 内 3579-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 66999498-67033680(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGAGTGACGTGGAA
SmilChr01G000643 Chr01 NC_080387.1:14420229-14420243promoter 内 3492-3506 bp - 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 14420738-14422143(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr05G000636 Chr05 NC_080391.1:4805345-4805359promoter 内 3482-3496 bp + 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 4805864-4809650(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGATTTT
SmilChr04G000865 Chr04 NC_080390.1:10941489-10941503promoter 内 3390-3404 bp + 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 10937929-10940892(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGGGTGACGTGGGA
SmilChr04G003308 Chr04 NC_080390.1:49817923-49817937promoter 内 3366-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 49818558-49827362(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr04G000699 Chr04 NC_080390.1:8150946-8150960promoter 内 3342-3356 bp - 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8149885-8150301(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr01G004896 Chr01 NC_080387.1:67034088-67034102promoter 内 3322-3336 bp + 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 67034767-67037714(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCACTCTC
SmilChr04G000267 Chr04 NC_080390.1:2431254-2431268promoter 内 2801-2815 bp - 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 2426574-2430068(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr07G003149 Chr07 NC_080393.1:33400556-33400570promoter 内 2645-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 33389761-33399214(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAATTGACGTGGCA
SmilChr01G005654 Chr01 NC_080387.1:72904598-72904612promoter 内 2601-2615 bp + 1386 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 72902302-72903212(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr06G001716 Chr06 NC_080392.1:19775498-19775512promoter 内 2599-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 19776900-19777810(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr07G003130 Chr07 NC_080393.1:33219272-33219286promoter 内 2561-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 33208466-33217846(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAATTGACGTGGCA
SmilChr07G001865 Chr07 NC_080393.1:16166554-16166568promoter 内 2559-2573 bp - 1428 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 16161287-16165126(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr04G002583 Chr04 NC_080390.1:41217455-41217469promoter 内 2431-2445 bp - 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 41211800-41215899(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr07G001410 Chr07 NC_080393.1:10963244-10963258promoter 内 2383-2397 bp + 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 10964862-10974237(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr04G000010 Chr04 NC_080390.1:166587-166601promoter 内 1957-1971 bp + 2030 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 154530-164557(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGGGTGACGTGGGA
SmilChr05G001017 Chr05 NC_080391.1:8331224-8331238promoter 内 1749-1763 bp + 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8323661-8328986(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr04G001435 Chr04 NC_080390.1:23417656-23417670promoter 内 1658-1672 bp - 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 23411064-23415327(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr06G001086 Chr06 NC_080392.1:10866139-10866153promoter 内 1522-1536 bp + 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 10868618-10872009(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr05G002226 Chr05 NC_080391.1:23797124-23797138promoter 内 1493-1507 bp - 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 23789694-23794630(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGACCAT
SmilChr07G001866 Chr07 NC_080393.1:16167147-16167161promoter 内 1403-1417 bp - 2584 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 16169745-16171604(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr04G000871 Chr04 NC_080390.1:11026685-11026699promoter 内 1235-1249 bp + 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 11022968-11023933(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr07G001141 Chr07 NC_080393.1:8563220-8563234promoter 内 1054-1068 bp + 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8566167-8568946(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGTCAC
SmilChr05G001069 Chr05 NC_080391.1:8821110-8821124promoter 内 583-597 bp - 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8824528-8827292(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCGGATGACGTGGAG
SmilChr01G002936 Chr01 NC_080387.1:48109706-48109720promoter 内 409-423 bp - 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 48113298-48119428(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr07G003193 Chr07 NC_080393.1:34060918-34060932promoter 内 383-397 bp + 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 34064536-34064667(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCAGAATG
SmilChr01G005656 Chr01 NC_080387.1:72904801-72904815promoter 内 337-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 72908465-72910533(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr07G004670 Chr07 NC_080393.1:59628596-59628610promoter 内 144-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 59619483-59624753(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr01G000311 Chr01 NC_080387.1:6019306-6019320promoter 内 3984-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6017775-6019303(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr02G000798 Chr02 NC_080388.1:13265541-13265555promoter 内 3978-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13265564-13268160(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr04G001033 Chr04 NC_080390.1:14668838-14668852promoter 内 3974-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 14668865-14670340(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAGTACGACGTGGAA