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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 99 / 137 下载 TSV

上一页 99 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003934 Chr07 NC_080393.1:49656916-49656930promoter 内 397-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49660520-49664238(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCGTTGACGTGGAA
SmilChr05G000424 Chr05 NC_080391.1:3203569-3203583promoter 内 389-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3197656-3199971(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr04G002533 Chr04 NC_080390.1:40425421-40425435promoter 内 336-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 40429086-40434077(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr02G003747 Chr02 NC_080388.1:59123932-59123946promoter 内 332-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 59127601-59130370(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGTATAT
SmilChr02G004181 Chr02 NC_080388.1:64131517-64131531promoter 内 317-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 64119947-64127847(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTGGGATACGTGGCG
SmilChr06G001166 Chr06 NC_080392.1:11882163-11882177promoter 内 311-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 11885853-11890169(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGACCAT
SmilChr04G000956 Chr04 NC_080390.1:12667006-12667020promoter 内 302-316 bp - 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 12659602-12663321(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCTTCCAT
SmilChr04G000356 Chr04 NC_080390.1:3417648-3417662promoter 内 294-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3413581-3413955(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr05G002190 Chr05 NC_080391.1:23392775-23392789promoter 内 276-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23383872-23389064(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr08G004960 Chr08 NC_080394.1:58415628-58415642promoter 内 275-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 58419354-58422915(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCCACGTCGGCCAA
SmilChr03G000737 Chr03 NC_080389.1:8346425-8346439promoter 内 273-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 8350153-8351648(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr04G000515 Chr04 NC_080390.1:5661141-5661155promoter 内 266-280 bp + 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5664876-5669272(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr07G000940 Chr07 NC_080393.1:6715302-6715316promoter 内 226-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6719077-6723103(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAG
SmilChr07G004508 Chr07 NC_080393.1:57748861-57748875promoter 内 211-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 57743332-57745085(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr05G003742 Chr05 NC_080391.1:50525405-50525419promoter 内 202-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50529204-50531256(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCG
SmilChr05G003055 Chr05 NC_080391.1:38345537-38345551promoter 内 88-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38349450-38350808(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACCGATGACGTGGAG
SmilChr08G001503 Chr08 NC_080394.1:12185336-12185350promoter 内 55-69 bp + 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 12180097-12181404(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAGTTGACGTGGAG
SmilChr07G003710 Chr07 NC_080393.1:44830963-44830977promoter 内 28-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 44820859-44827004(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGACCAT
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SmilChr04G003520 Chr04 NC_080390.1:51578948-51578962promoter 内 3246-3260 bp + 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 51576554-51578207(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAACGTGACGTGGCT
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SmilChr04G001896 Chr04 NC_080390.1:30983825-30983839promoter 内 1296-1310 bp - 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 30980469-30981134(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGATGTAG
SmilChr08G004101 Chr08 NC_080394.1:49790296-49790310promoter 内 734-748 bp + 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 49793563-49794995(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGACATG
SmilChr01G005685 Chr01 NC_080387.1:73117145-73117159promoter 内 80-94 bp + 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 73109795-73113238(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCTGTGACGTGGAA
SmilChr03G001536 Chr03 NC_080389.1:19265703-19265717promoter 内 3959-3973 bp + 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 19261872-19265675(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCGCTGACGTGTAA
SmilChr01G004860 Chr01 NC_080387.1:66750735-66750749promoter 内 3952-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 66750784-66757976(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAACTAAC
SmilChr04G004085 Chr04 NC_080390.1:55891130-55891144promoter 内 3934-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55887282-55891077(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCAGAT
SmilChr01G003085 Chr01 NC_080387.1:49689614-49689628promoter 内 3887-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 49689728-49693147(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCTTGTGACGTGTCC
SmilChr03G004094 Chr03 NC_080389.1:59821238-59821252promoter 内 3858-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59818187-59821109(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCAGATAT
SmilChr06G001122 Chr06 NC_080392.1:11290013-11290027promoter 内 3853-3867 bp + 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11288426-11289879(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAGATTGACGTGGCA
SmilChr06G001106 Chr06 NC_080392.1:11169895-11169909promoter 内 3847-3861 bp + 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11168014-11169755(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAGATTGACGTGGCA
SmilChr01G001649 Chr01 NC_080387.1:30551450-30551464promoter 内 3836-3850 bp - 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30549545-30551299(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCACTTAT
SmilChr08G002694 Chr08 NC_080394.1:26538510-26538524promoter 内 3815-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26538696-26541035(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAACGTGACGTGGCT
SmilChr04G002506 Chr04 NC_080390.1:40037468-40037482promoter 内 3774-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40037695-40044538(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCACGTTT
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SmilChr04G003554 Chr04 NC_080390.1:51933159-51933173promoter 内 3760-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51933400-51936993(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTCATACGTGGCG
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SmilChr05G004306 Chr05 NC_080391.1:56766064-56766078promoter 内 3502-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56766563-56768055(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAATATTT
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SmilChr07G003378 Chr07 NC_080393.1:36484242-36484256promoter 内 3282-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36481870-36483537(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTGCTAACGTGGCG