转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00015812-RA_Salv SmilChr04G000094 YABBY XP_057807365.1 MP00620 CAATCATAAT

可能结合的靶基因

9844 个结合位点 6504 个候选靶基因 第 10 / 131 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002588 Chr01 NC_080387.1:44010587-44010596promoter 内 1741-1750 bp + 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 44012847-44012918(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G002377 Chr01 NC_080387.1:40973994-40974003promoter 内 1574-1583 bp + 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 40976421-40977429(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G002379 Chr01 NC_080387.1:40980399-40980408promoter 内 1574-1583 bp + 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 40982826-40983834(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr02G002289 Chr02 NC_080388.1:40434508-40434517promoter 内 1519-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 40431150-40432035(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr03G000555 Chr03 NC_080389.1:6012568-6012577promoter 内 1440-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 6006474-6010016(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G004940 Chr02 NC_080388.1:71368557-71368566promoter 内 1342-1351 bp + 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 71362767-71365907(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G003284 Chr02 NC_080388.1:54145963-54145972promoter 内 1220-1229 bp - 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 54140444-54143191(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G002958 Chr01 NC_080387.1:48449018-48449027promoter 内 1149-1158 bp - 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 48451870-48455831(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G002222 Chr01 NC_080387.1:38656846-38656855promoter 内 1143-1152 bp + 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 38659704-38661064(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G000707 Chr01 NC_080387.1:15844412-15844421promoter 内 1126-1135 bp + 2866 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 15847287-15848716(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G005378 Chr01 NC_080387.1:71008221-71008230promoter 内 1084-1093 bp - 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 70999770-71005313(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G005253 Chr01 NC_080387.1:70035477-70035486promoter 内 1009-1018 bp - 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 70038469-70041225(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G002204 Chr01 NC_080387.1:38366824-38366833promoter 内 920-929 bp - 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 38362829-38363752(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr02G002560 Chr02 NC_080388.1:44532268-44532277promoter 内 877-886 bp + 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 44525291-44529153(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G000622 Chr01 NC_080387.1:13929665-13929674promoter 内 765-774 bp - 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 13932901-13935849(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G002376 Chr01 NC_080387.1:40980399-40980408promoter 内 746-755 bp + 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 40975636-40977153(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G001562 Chr02 NC_080388.1:28889758-28889767promoter 内 726-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 28893033-28895362(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr02G005188 Chr02 NC_080388.1:73190621-73190630promoter 内 573-582 bp - 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 73184495-73187202(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr02G001527 Chr02 NC_080388.1:28397422-28397431promoter 内 524-533 bp - 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 28400899-28404000(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G002572 Chr02 NC_080388.1:44725624-44725633promoter 内 490-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 44729135-44729890(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G003635 Chr02 NC_080388.1:57696591-57696600promoter 内 490-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 57700102-57700797(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G002366 Chr02 NC_080388.1:41451194-41451203promoter 内 475-484 bp - 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 41454720-41456010(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G004630 Chr01 NC_080387.1:64352542-64352551promoter 内 377-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 64342412-64348927(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G004594 Chr02 NC_080388.1:68438196-68438205promoter 内 323-332 bp + 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 68441874-68453109(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr02G002320 Chr02 NC_080388.1:40867136-40867145promoter 内 304-313 bp + 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 40870833-40873277(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G001345 Chr01 NC_080387.1:26701757-26701766promoter 内 190-199 bp - 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 26705568-26708801(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G004256 Chr01 NC_080387.1:60830825-60830834promoter 内 151-160 bp - 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 60834675-60835611(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr01G005159 Chr01 NC_080387.1:69350857-69350866promoter 内 98-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 69354760-69355445(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 GTTATGATTG
SmilChr02G004757 Chr02 NC_080388.1:69760128-69760137promoter 内 17-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 69749881-69756153(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATAAC
SmilChr01G003238 Chr01 NC_080387.1:51130082-51130091promoter 内 3901-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 5 51127601-51129991(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G005177 Chr02 NC_080388.1:73066207-73066216promoter 内 2305-2314 bp + 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 5 73062182-73064520(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G003239 Chr01 NC_080387.1:51130082-51130091promoter 内 1663-1672 bp + 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 5 51132420-51135151(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9012445-9012454promoter 内 181-190 bp - 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 5 9016265-9021580(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G003327 Chr02 NC_080388.1:54525459-54525468promoter 内 3244-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 54526216-54528126(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G004638 Chr01 NC_080387.1:64410110-64410119promoter 内 3131-3140 bp + 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 64407362-64409249(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G000006 Chr02 NC_080388.1:56473-56482promoter 内 3788-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 56686-58534(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G002857 Chr01 NC_080387.1:47157180-47157189promoter 内 3714-3723 bp + 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 47154333-47156902(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G002861 Chr01 NC_080387.1:47193338-47193347promoter 内 3591-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 47189925-47192937(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G002710 Chr02 NC_080388.1:46958304-46958313promoter 内 3552-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 46957781-46957864(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G002846 Chr01 NC_080387.1:47036102-47036111promoter 内 3528-3537 bp + 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 47030507-47035638(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G004748 Chr02 NC_080388.1:69690199-69690208promoter 内 3305-3314 bp + 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 69684844-69689512(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G002500 Chr01 NC_080387.1:42833488-42833497promoter 内 3125-3134 bp - 867 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 42834364-42835534(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G002709 Chr02 NC_080388.1:46958304-46958313promoter 内 3009-3018 bp + 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 46957238-46957321(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G003196 Chr02 NC_080388.1:53125355-53125364promoter 内 2946-2955 bp + 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 53120288-53124309(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G003577 Chr01 NC_080387.1:54362560-54362569promoter 内 2919-2928 bp + 1073 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 54360728-54361487(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G001460 Chr01 NC_080387.1:28363537-28363546promoter 内 2878-2887 bp + 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 28360104-28362423(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G004240 Chr02 NC_080388.1:64587836-64587845promoter 内 2508-2517 bp + 1484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 64589329-64596205(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G005489 Chr01 NC_080387.1:71831513-71831522promoter 内 2390-2399 bp - 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 71825897-71829911(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G003093 Chr02 NC_080388.1:51794029-51794038promoter 内 2361-2370 bp - 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 51789092-51792398(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G002645 Chr02 NC_080388.1:45844583-45844592promoter 内 2346-2355 bp - 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 45839201-45842937(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT