转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 100 / 126 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001221 Chr06 NC_080392.1:12589941-12589955promoter 内 512-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12593430-12598286(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTAAACACGTGTCC
SmilChr03G003625 Chr03 NC_080389.1:54918940-54918954promoter 内 505-519 bp + 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54922436-54923545(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGTTTACGTGGCA
SmilChr02G002439 Chr02 NC_080388.1:42592923-42592937promoter 内 409-423 bp - 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42596515-42599981(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTATCATCT
SmilChr06G001209 Chr06 NC_080392.1:12389658-12389672promoter 内 391-405 bp - 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12380509-12386062(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATTCTCACGTGGAA
SmilChr05G000639 Chr05 NC_080391.1:4849160-4849174promoter 内 322-336 bp - 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 4843855-4845495(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATCGTACACGTGTCG
SmilChr02G000661 Chr02 NC_080388.1:10132101-10132115promoter 内 273-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10115954-10128387(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGATTCA
SmilChr08G000916 Chr08 NC_080394.1:6787465-6787479promoter 内 230-244 bp + 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6781406-6783708(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTCCACGTGTCATAC
SmilChr02G001411 Chr02 NC_080388.1:26745371-26745385promoter 内 217-231 bp + 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26749155-26752912(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAATCCACGTGGCG
SmilChr02G001818 Chr02 NC_080388.1:33063598-33063612promoter 内 210-224 bp - 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33058999-33059821(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCAGTGACGTGGCT
SmilChr01G002823 Chr01 NC_080387.1:46765690-46765704promoter 内 199-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46769492-46771782(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTTCCCGACGTGGCT
SmilChr05G002700 Chr05 NC_080391.1:30971941-30971955promoter 内 188-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30975754-30978266(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTAGAAT
SmilChr08G002851 Chr08 NC_080394.1:28360128-28360142promoter 内 157-171 bp - 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 28353625-28356298(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGTTTACGTGGCA
SmilChr05G001111 Chr05 NC_080391.1:9283256-9283270promoter 内 133-147 bp - 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9276532-9279402(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGTTTACGTGGCA
SmilChr07G004211 Chr07 NC_080393.1:54309221-54309235promoter 内 69-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54313153-54315808(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCATTTTT
SmilChr04G003036 Chr04 NC_080390.1:46841723-46841737promoter 内 54-68 bp + 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46845670-46846062(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGTTTACGTGGCA
SmilChr07G001062 Chr07 NC_080393.1:7821259-7821273promoter 内 34-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7825226-7828255(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGACACGTGTGTTAC
SmilChr01G004105 Chr01 NC_080387.1:59555968-59555982promoter 内 3910-3924 bp + 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 59556059-59559717(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AACTGCCACGTGGAA
SmilChr02G002874 Chr02 NC_080388.1:48997083-48997097promoter 内 3850-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 48993750-48996946(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTACGCTACGTGGCA
SmilChr08G004925 Chr08 NC_080394.1:58165899-58165913promoter 内 3223-3237 bp - 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 58166677-58171258(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTATTAA
SmilChr03G004247 Chr03 NC_080389.1:60963663-60963677promoter 内 2760-2774 bp + 1227 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 60964904-60965829(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATGCTACGTGGCG
SmilChr02G001906 Chr02 NC_080388.1:34355289-34355303promoter 内 2736-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 34356554-34360351(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATTATAC
SmilChr07G002438 Chr07 NC_080393.1:22803211-22803225promoter 内 2611-2625 bp + 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 22804601-22804707(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGGCCACGTGGAT
SmilChr06G002448 Chr06 NC_080392.1:35214572-35214586promoter 内 2200-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 35216373-35223519(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAAGACACGTGTCT
SmilChr04G000852 Chr04 NC_080390.1:10770456-10770470promoter 内 1868-1882 bp + 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 10772589-10778509(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCGAATACGTGGCA
SmilChr01G000022 Chr01 NC_080387.1:409311-409325promoter 内 1039-1053 bp - 2948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 404069-406363(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCTACGTGGCA
SmilChr01G000098 Chr01 NC_080387.1:1788484-1788498promoter 内 1038-1052 bp + 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 1791447-1793741(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCTACGTGGCA
SmilChr03G004245 Chr03 NC_080389.1:60963663-60963677promoter 内 377-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 60957313-60960053(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTAGCATAT
SmilChr01G004104 Chr01 NC_080387.1:59555968-59555982promoter 内 111-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 59542606-59552092(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGCAGTT
SmilChr01G005974 Chr01 NC_080387.1:75403651-75403665promoter 内 3945-3959 bp + 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 75403707-75413345(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CCGAGTGACGTGGCT
SmilChr07G000312 Chr07 NC_080393.1:2091637-2091651promoter 内 3905-3919 bp + 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2091733-2097108(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATATACACGTGTCA
SmilChr02G002986 Chr02 NC_080388.1:50476754-50476768promoter 内 3899-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 50476856-50479922(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTACGCTACGTGGCA
SmilChr08G001867 Chr08 NC_080394.1:16026559-16026573promoter 内 3886-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16026674-16028158(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTAGCACAT
SmilChr01G005973 Chr01 NC_080387.1:75403651-75403665promoter 内 3885-3899 bp + 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 75400437-75403549(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACTCGG
SmilChr03G004246 Chr03 NC_080389.1:60963663-60963677promoter 内 3876-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 60963097-60963552(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTAGCATAT
SmilChr01G005551 Chr01 NC_080387.1:72349812-72349826promoter 内 3844-3858 bp + 143 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 72349969-72353145(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCTACGTGGCA
SmilChr01G000799 Chr01 NC_080387.1:17281155-17281169promoter 内 3839-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17278698-17281007(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGTCTACGTGGCA
SmilChr02G001309 Chr02 NC_080388.1:24335773-24335787promoter 内 3805-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24321846-24335591(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCTACGTGGCA
SmilChr01G000754 Chr01 NC_080387.1:16623386-16623400promoter 内 3781-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16616861-16623180(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGACTCC
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SmilChr06G000332 Chr06 NC_080392.1:2481775-2481789promoter 内 3745-3759 bp - 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2482031-2484034(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGACTCAA
SmilChr08G001291 Chr08 NC_080394.1:10280858-10280872promoter 内 3722-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10276125-10280593(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAAGATACGTGGCG
SmilChr03G000754 Chr03 NC_080389.1:8625882-8625896promoter 内 3686-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8622387-8625581(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCTACGTGGCA
SmilChr01G005437 Chr01 NC_080387.1:71503942-71503956promoter 内 3624-3638 bp + 363 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 71504319-71509382(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGGTTTGACGTGGCG
SmilChr07G004124 Chr07 NC_080393.1:52927834-52927848promoter 内 3557-3571 bp - 430 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52928278-52931702(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGGGAGTT
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SmilChr01G000020 Chr01 NC_080387.1:385638-385652promoter 内 3233-3247 bp + 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 382559-384884(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGACCT
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SmilChr05G000887 Chr05 NC_080391.1:7013650-7013664promoter 内 3117-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7014534-7015857(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGAATTGC
SmilChr03G002486 Chr03 NC_080389.1:39525493-39525507promoter 内 3074-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 39521694-39524580(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGAAATTA
SmilChr04G000221 Chr04 NC_080390.1:1949662-1949676promoter 内 2994-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1947142-1948669(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCTACGTGGCA