转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 102 / 134 下载 TSV

上一页 102 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002130 Chr02 NC_080388.1:38149629-38149641promoter 内 2096-2108 bp + 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38146714-38147736(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCCGC
SmilChr03G002397 Chr03 NC_080389.1:37986278-37986290promoter 内 2095-2107 bp - 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37983191-37984384(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TACAAGGATAAGC
SmilChr02G001480 Chr02 NC_080388.1:27685500-27685512promoter 内 2031-2043 bp + 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27683437-27683542(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCCTTTA
SmilChr02G000072 Chr02 NC_080388.1:907462-907474promoter 内 1991-2003 bp + 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 904943-905464(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCCTTTA
SmilChr01G004153 Chr01 NC_080387.1:60055279-60055291promoter 内 1984-1996 bp - 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 60051287-60053274(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGATTTGATAAGG
SmilChr03G002121 Chr03 NC_080389.1:32964040-32964052promoter 内 1983-1995 bp + 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32966058-32966610(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAAGGGATAAGT
SmilChr01G006059 Chr01 NC_080387.1:76040600-76040612promoter 内 1938-1950 bp + 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 76042663-76046903(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGATTTGATAAGG
SmilChr01G002201 Chr01 NC_080387.1:38289754-38289766promoter 内 1863-1875 bp - 2126 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38291892-38292689(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCAATCA
SmilChr03G000682 Chr03 NC_080389.1:7629012-7629024promoter 内 1718-1730 bp + 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7625512-7626741(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATGC
SmilChr01G001264 Chr01 NC_080387.1:25341390-25341402promoter 内 1688-1700 bp - 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 25338009-25339089(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGATTTGATAAGG
SmilChr01G000197 Chr01 NC_080387.1:3386920-3386932promoter 内 1496-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3383132-3384427(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTAGA
SmilChr02G000776 Chr02 NC_080388.1:12722524-12722536promoter 内 1444-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12725081-12726138(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTCTC
SmilChr03G000683 Chr03 NC_080389.1:7629012-7629024promoter 内 1411-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7631602-7633987(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCATGAGATAAGG
SmilChr02G001418 Chr02 NC_080388.1:26807145-26807157promoter 内 1382-1394 bp + 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26809764-26810826(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAACT
SmilChr02G000708 Chr02 NC_080388.1:11398697-11398709promoter 内 1330-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11393227-11396038(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTATCCAAACC
SmilChr02G004921 Chr02 NC_080388.1:71236605-71236617promoter 内 1277-1289 bp - 2712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 71239329-71241467(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTCTT
SmilChr01G000904 Chr01 NC_080387.1:19093644-19093656promoter 内 899-911 bp - 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 19086795-19090554(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAAGGGATAAGT
SmilChr03G001825 Chr03 NC_080389.1:25006637-25006649promoter 内 884-896 bp + 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 25000658-25003532(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGAGTT
SmilChr03G002191 Chr03 NC_080389.1:34395746-34395758promoter 内 869-881 bp - 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34398878-34408496(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTGGGC
SmilChr01G004666 Chr01 NC_080387.1:64784537-64784549promoter 内 827-839 bp - 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 64779154-64781375(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGTGGGATAAGA
SmilChr01G003150 Chr01 NC_080387.1:50300058-50300070promoter 内 777-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50303282-50306067(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCACTC
SmilChr01G004842 Chr01 NC_080387.1:66554104-66554116promoter 内 758-770 bp - 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 66548546-66550873(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAGACGGATAAGA
SmilChr02G003513 Chr02 NC_080388.1:56320818-56320830promoter 内 754-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56324065-56326253(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGATTTGATAAGG
SmilChr02G001571 Chr02 NC_080388.1:29129009-29129021promoter 内 737-749 bp + 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 29132273-29135783(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGAGAGATAAGG
SmilChr02G001892 Chr02 NC_080388.1:34224443-34224455promoter 内 716-728 bp - 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34227728-34230415(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGAGTT
SmilChr03G001147 Chr03 NC_080389.1:13227926-13227938promoter 内 629-641 bp + 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 13222908-13224566(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGAGTT
SmilChr03G002186 Chr03 NC_080389.1:34124799-34124811promoter 内 593-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34120726-34121403(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAAGGGATAAGT
SmilChr01G004205 Chr01 NC_080387.1:60504826-60504838promoter 内 445-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 60497417-60501282(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACCAC
SmilChr02G004847 Chr02 NC_080388.1:70606336-70606348promoter 内 425-437 bp + 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70609912-70613661(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTCCCGGATAAGG
SmilChr01G001354 Chr01 NC_080387.1:26806314-26806326promoter 内 324-336 bp - 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26809991-26810948(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAGTAAT
SmilChr01G004920 Chr01 NC_080387.1:67280945-67280957promoter 内 319-331 bp - 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67284627-67289060(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTCTC
SmilChr01G004997 Chr01 NC_080387.1:68010261-68010273promoter 内 259-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68014003-68018686(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCATGAGATAAGG
SmilChr01G002214 Chr01 NC_080387.1:38478080-38478092promoter 内 248-260 bp + 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38481833-38482558(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGTAAGATAAGG
SmilChr01G001946 Chr01 NC_080387.1:34679317-34679329promoter 内 112-124 bp + 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34683206-34685403(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTATGGATAACA
SmilChr02G000965 Chr02 NC_080388.1:16877171-16877183promoter 内 58-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 16870304-16873240(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTGGGATAAGC
SmilChr01G004133 Chr01 NC_080387.1:59846960-59846972promoter 内 29-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59842130-59843000(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTAGGA
SmilChr01G004810 Chr01 NC_080387.1:66306675-66306687promoter 内 3773-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 3 66306903-66311350(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAATTGGATAATA
SmilChr01G003417 Chr01 NC_080387.1:52802275-52802287promoter 内 2856-2868 bp + 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 3 52803420-52803491(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGTGGATAATA
SmilChr01G000323 Chr01 NC_080387.1:6380735-6380747promoter 内 667-679 bp - 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 3 6384069-6392414(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAATTCG
SmilChr01G005096 Chr01 NC_080387.1:68792687-68792699promoter 内 3273-3285 bp + 716 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 68793415-68797220(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAATTGGATAATA
SmilChr03G002465 Chr03 NC_080389.1:39104615-39104627promoter 内 3129-3141 bp - 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 39103129-39103755(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAACCGGATAAGT
SmilChr01G002992 Chr01 NC_080387.1:48836418-48836430promoter 内 3049-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 48837370-48838063(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGTGGATAATA
SmilChr02G004210 Chr02 NC_080388.1:64363465-64363477promoter 内 2971-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 64364495-64368110(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGTGGATAATA
SmilChr01G003483 Chr01 NC_080387.1:53378200-53378212promoter 内 2811-2823 bp + 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 53379390-53379461(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGTGGATAATA
SmilChr03G001043 Chr03 NC_080389.1:12150058-12150070promoter 内 2666-2678 bp + 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 12151393-12152825(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAAAG
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SmilChr01G003824 Chr01 NC_080387.1:56569049-56569061promoter 内 2009-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 56571041-56574573(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACTCA
SmilChr02G004255 Chr02 NC_080388.1:64751345-64751357promoter 内 1551-1563 bp + 2438 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 64753795-64759325(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGTGGATAATA
SmilChr01G002937 Chr01 NC_080387.1:48146943-48146955promoter 内 1396-1408 bp - 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 48149548-48151258(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTTATCCACTAC