转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 11 / 149 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002200 Chr02 NC_080388.1:39233439-39233449promoter 内 756-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 39230132-39230204(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G000651 Chr01 NC_080387.1:14491456-14491466promoter 内 638-648 bp + 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 14494819-14495241(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGCT
SmilChr04G000323 Chr04 NC_080390.1:2940220-2940230promoter 内 578-588 bp - 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 2935453-2936807(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr04G000581 Chr04 NC_080390.1:6459478-6459488promoter 内 416-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 6463063-6464878(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr01G001010 Chr01 NC_080387.1:21236319-21236329promoter 内 326-336 bp - 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 21227796-21232654(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr07G001703 Chr07 NC_080393.1:14449708-14449718promoter 内 297-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 14441755-14446014(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr04G000108 Chr04 NC_080390.1:950977-950987promoter 内 22-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 954956-959804(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGCT
SmilChr01G005197 Chr01 NC_080387.1:69657474-69657484promoter 内 21-31 bp + 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 69652794-69653504(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G001496 Chr01 NC_080387.1:28809457-28809467promoter 内 3484-3494 bp + 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 28809974-28814378(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr01G001495 Chr01 NC_080387.1:28809457-28809467promoter 内 93-103 bp + 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 28804866-28805559(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTC
SmilChr01G002456 Chr01 NC_080387.1:42189307-42189317promoter 内 73-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 42184695-42185389(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCG
SmilChr07G000942 Chr07 NC_080393.1:6727652-6727662promoter 内 3764-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 6726625-6727425(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTC
SmilChr06G000578 Chr06 NC_080392.1:4964211-4964221promoter 内 3400-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 4957349-4963620(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr05G002133 Chr05 NC_080391.1:22421870-22421880promoter 内 3045-3055 bp + 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 22422826-22424163(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr07G001460 Chr07 NC_080393.1:11439749-11439759promoter 内 2702-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 11435569-11438460(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCG
SmilChr02G004082 Chr02 NC_080388.1:63102911-63102921promoter 内 337-347 bp - 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 63097722-63099257(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr07G000944 Chr07 NC_080393.1:6727652-6727662promoter 内 246-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 6731407-6733814(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr01G006028 Chr01 NC_080387.1:75838588-75838598promoter 内 3868-3878 bp + 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 75837700-75838465(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTC
SmilChr02G000145 Chr02 NC_080388.1:1937787-1937797promoter 内 3379-3389 bp + 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 1938409-1944296(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCG
SmilChr01G002447 Chr01 NC_080387.1:42064091-42064101promoter 内 3248-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 42058999-42063348(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr02G005138 Chr02 NC_080388.1:72816999-72817009promoter 内 2713-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 72811791-72815721(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCG
SmilChr05G003660 Chr05 NC_080391.1:49328982-49328992promoter 内 2588-2598 bp - 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 49314170-49327579(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCG
SmilChr01G006029 Chr01 NC_080387.1:75838588-75838598promoter 内 2225-2235 bp + 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 75840364-75843979(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr03G001540 Chr03 NC_080389.1:19311448-19311458promoter 内 794-804 bp - 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 19307128-19308251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr04G001586 Chr04 NC_080390.1:26359905-26359915promoter 内 660-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 26363246-26364595(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr02G001746 Chr02 NC_080388.1:32049438-32049448promoter 内 138-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 32044164-32045585(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCG
SmilChr06G002531 Chr06 NC_080392.1:36323009-36323019promoter 内 92-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 36316587-36319110(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACGGCTGTCA
SmilChr06G002566 Chr06 NC_080392.1:36855156-36855166promoter 内 3571-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 36855586-36866104(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G005682 Chr01 NC_080387.1:73087708-73087718promoter 内 3386-3396 bp + 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 73086236-73087103(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGC
SmilChr03G000658 Chr03 NC_080389.1:7342378-7342388promoter 内 3276-3286 bp + 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 7340706-7341663(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTG
SmilChr01G002045 Chr01 NC_080387.1:36193702-36193712promoter 内 2394-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 36195309-36197167(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCA
SmilChr07G002365 Chr07 NC_080393.1:21955004-21955014promoter 内 1896-1906 bp - 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 21950347-21952909(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G002607 Chr01 NC_080387.1:44253539-44253549promoter 内 858-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 44256682-44260723(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCA
SmilChr03G001958 Chr03 NC_080389.1:27996743-27996753promoter 内 482-492 bp - 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 27992014-27993234(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCA
SmilChr05G003423 Chr05 NC_080391.1:45475224-45475234promoter 内 3326-3336 bp + 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 45475899-45479829(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G005291 Chr01 NC_080387.1:70231172-70231182promoter 内 3292-3302 bp + 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 70231881-70234315(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCC
SmilChr02G005248 Chr02 NC_080388.1:73632256-73632266promoter 内 2873-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 73633384-73638666(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTG
SmilChr02G002365 Chr02 NC_080388.1:41450232-41450242promoter 内 2825-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 41451408-41452333(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTG
SmilChr01G000307 Chr01 NC_080387.1:6000952-6000962promoter 内 2794-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 5996885-5999755(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr06G001863 Chr06 NC_080392.1:22060546-22060556promoter 内 2717-2727 bp + 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22061830-22062988(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr04G000840 Chr04 NC_080390.1:10615271-10615281promoter 内 1886-1896 bp - 2105 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 10612622-10613166(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCC
SmilChr03G003042 Chr03 NC_080389.1:47320795-47320805promoter 内 1840-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 47322956-47324529(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCA
SmilChr07G001836 Chr07 NC_080393.1:15833834-15833844promoter 内 1693-1703 bp - 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 15824506-15831536(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr01G004372 Chr01 NC_080387.1:61922860-61922870promoter 内 1328-1338 bp - 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 61925533-61927324(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTG
SmilChr06G001864 Chr06 NC_080392.1:22060546-22060556promoter 内 1107-1117 bp + 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22063440-22065926(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr06G002448 Chr06 NC_080392.1:35213416-35213426promoter 内 1044-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35216373-35223519(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr04G003472 Chr04 NC_080390.1:51193813-51193823promoter 内 973-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 51186651-51190795(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGC
SmilChr02G000197 Chr02 NC_080388.1:2494801-2494811promoter 内 958-968 bp - 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 2490229-2491768(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACGGCTGTCA
SmilChr03G001691 Chr03 NC_080389.1:22425835-22425845promoter 内 903-913 bp - 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22428933-22429433(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTG
SmilChr03G002919 Chr03 NC_080389.1:45949687-45949697promoter 内 860-870 bp + 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 45940882-45946556(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCGG