转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 117 / 149 下载 TSV

上一页 117 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003940 Chr04 NC_080390.1:55019024-55019034promoter 内 246-256 bp - 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55014641-55015279(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTGGCTGTCA
SmilChr01G000403 Chr01 NC_080387.1:8235146-8235156promoter 内 210-220 bp - 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8228936-8231365(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTGGCTGTCA
SmilChr02G004542 Chr02 NC_080388.1:67993626-67993636promoter 内 200-210 bp - 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 67988961-67989835(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCG
SmilChr06G001992 Chr06 NC_080392.1:25340938-25340948promoter 内 100-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25336064-25337047(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAT
SmilChr05G003628 Chr05 NC_080391.1:48574228-48574238promoter 内 3283-3293 bp + 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 48570019-48573520(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr01G000025 Chr01 NC_080387.1:458953-458963promoter 内 3158-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 452475-458120(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr04G002987 Chr04 NC_080390.1:46292688-46292698promoter 内 3806-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 46286743-46292503(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCC
SmilChr01G004579 Chr01 NC_080387.1:63845646-63845656promoter 内 3692-3702 bp - 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63843623-63845347(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCG
SmilChr05G003943 Chr05 NC_080391.1:53198082-53198092promoter 内 3478-3488 bp + 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53198605-53200335(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr02G002483 Chr02 NC_080388.1:43216179-43216189promoter 内 3337-3347 bp + 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 43216843-43218769(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCG
SmilChr02G000633 Chr02 NC_080388.1:9535583-9535593promoter 内 3262-3272 bp - 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9536322-9536798(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAG
SmilChr07G001979 Chr07 NC_080393.1:17395237-17395247promoter 内 2856-2866 bp + 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17396382-17401184(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTGAGCTGTCC
SmilChr04G003546 Chr04 NC_080390.1:51819028-51819038promoter 内 2839-2849 bp + 1152 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 51811688-51817876(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr03G003337 Chr03 NC_080389.1:51632569-51632579promoter 内 2831-2841 bp - 1160 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 51633739-51639024(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr06G000762 Chr06 NC_080392.1:7069144-7069154promoter 内 2824-2834 bp + 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 7058574-7067977(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr02G001960 Chr02 NC_080388.1:35388735-35388745promoter 内 2682-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 35386959-35387426(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr01G000987 Chr01 NC_080387.1:20873006-20873016promoter 内 2677-2687 bp - 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 20874330-20876202(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAG
SmilChr07G000728 Chr07 NC_080393.1:5068304-5068314promoter 内 2642-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5063637-5066955(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCC
SmilChr01G002402 Chr01 NC_080387.1:41379966-41379976promoter 内 2638-2648 bp - 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 41381329-41382443(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr02G002490 Chr02 NC_080388.1:43316222-43316232promoter 内 2528-2538 bp + 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 43317695-43323564(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr04G001292 Chr04 NC_080390.1:20580363-20580373promoter 内 2486-2496 bp + 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 20581878-20584922(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr01G004580 Chr01 NC_080387.1:63845646-63845656promoter 内 2161-2171 bp - 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63847486-63849430(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr05G002103 Chr05 NC_080391.1:22039075-22039085promoter 内 2120-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 22033520-22037204(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr05G000485 Chr05 NC_080391.1:3791366-3791376promoter 内 2110-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 3787799-3789485(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr01G001789 Chr01 NC_080387.1:32749966-32749976promoter 内 1982-1992 bp + 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 32751985-32754320(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCG
SmilChr05G003944 Chr05 NC_080391.1:53198082-53198092promoter 内 1796-1806 bp + 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53200287-53202113(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr01G001788 Chr01 NC_080387.1:32749966-32749976promoter 内 1704-1714 bp + 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 32747541-32747679(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr02G000698 Chr02 NC_080388.1:11121564-11121574promoter 内 1615-1625 bp + 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 11114974-11119188(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTA
SmilChr02G003069 Chr02 NC_080388.1:51552554-51552564promoter 内 1488-1498 bp - 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 51555067-51558637(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAG
SmilChr03G001263 Chr03 NC_080389.1:14603775-14603785promoter 内 1323-1333 bp - 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 14598107-14601107(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCG
SmilChr03G003527 Chr03 NC_080389.1:53887216-53887226promoter 内 999-1009 bp + 2992 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53878008-53884224(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr02G000529 Chr02 NC_080388.1:7287015-7287025promoter 内 985-995 bp - 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 7290031-7295241(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr07G001893 Chr07 NC_080393.1:16350458-16350468promoter 内 786-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16346138-16347253(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr03G004043 Chr03 NC_080389.1:59431177-59431187promoter 内 564-574 bp - 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 59424271-59427750(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCG
SmilChr01G000985 Chr01 NC_080387.1:20873006-20873016promoter 内 493-503 bp - 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 20868374-20869508(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTGAGCTGTCC
SmilChr02G004639 Chr02 NC_080388.1:68835968-68835978promoter 内 459-469 bp + 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 68839510-68851822(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCG
SmilChr05G003941 Chr05 NC_080391.1:53198082-53198092promoter 内 411-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53191783-53194502(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr01G001206 Chr01 NC_080387.1:24277579-24277589promoter 内 400-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 24281180-24282600(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8378835-8378845promoter 内 135-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATT
SmilChr03G002604 Chr03 NC_080389.1:41425735-41425745promoter 内 99-109 bp - 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 41429637-41432804(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGG
SmilChr02G000400 Chr02 NC_080388.1:4940917-4940927promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 4944912-4948191(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAG
SmilChr03G004512 Chr03 NC_080389.1:63192577-63192587promoter 内 3597-3607 bp - 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 63189498-63192183(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAC
SmilChr01G000168 Chr01 NC_080387.1:2741910-2741920promoter 内 1262-1272 bp + 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 2738603-2739181(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTG
SmilChr01G003142 Chr01 NC_080387.1:50249901-50249911promoter 内 1102-1112 bp + 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 50252800-50259192(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG
SmilChr04G000857 Chr04 NC_080390.1:10886198-10886208promoter 内 729-739 bp + 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 10880055-10882936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGA
SmilChr03G003621 Chr03 NC_080389.1:54864664-54864674promoter 内 378-388 bp + 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 54859913-54861051(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr01G000167 Chr01 NC_080387.1:2741910-2741920promoter 内 135-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 2737290-2738054(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTG
SmilChr02G004711 Chr02 NC_080388.1:69374154-69374164promoter 内 33-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 69365952-69370196(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAC
SmilChr05G000989 Chr05 NC_080391.1:8023133-8023143promoter 内 3867-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8023267-8024951(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCC
SmilChr05G002316 Chr05 NC_080391.1:24985053-24985063promoter 内 3867-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 24985187-24986854(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG