Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002075; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008328-RA_Salv SmilChr07G002075 C2H2 XP_057773918.1 MP00485 TTTTTTTTTGTCGTTTTCTG

可能结合的靶基因

8059 个结合位点 7130 个候选靶基因 第 120 / 143 下载 TSV

上一页 120 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G004057 Chr08 NC_080394.1:49201824-49201843promoter 内 2439-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49197000-49200281(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACTTTTTTTGTTTTTTTTCG
SmilChr01G005542 Chr01 NC_080387.1:72241241-72241260promoter 内 2438-2457 bp + 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 72239299-72239697(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GATGAAACGACAAAGAAAAC
SmilChr01G006142 Chr01 NC_080387.1:76923928-76923947promoter 内 2403-2422 bp - 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 76918324-76922349(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TGCTTTTTTGTTCTTTTCCA
SmilChr06G000186 Chr06 NC_080392.1:1281381-1281400promoter 内 2376-2395 bp - 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 1283006-1290762(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAAAAAAAAACAAAAAAAAA
SmilChr08G003203 Chr08 NC_080394.1:32843841-32843860promoter 内 2342-2361 bp + 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 32845500-32847405(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCCTTTTTGTCGTAATCAA
SmilChr03G003170 Chr03 NC_080389.1:49061822-49061841promoter 内 2326-2345 bp + 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49051056-49060166(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGTAACCGCCAAAAAATCA
SmilChr06G003027 Chr06 NC_080392.1:43103110-43103129promoter 内 2322-2341 bp + 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 43104789-43113473(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCATTTTTGTCTGGTTTTT
SmilChr07G002262 Chr07 NC_080393.1:20820555-20820574promoter 内 2269-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 20816555-20818842(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TATTTTTTTGTCATTTTTAT
SmilChr06G003026 Chr06 NC_080392.1:43103110-43103129promoter 内 2257-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 43100065-43101385(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAAAACCAGACAAAAATGAA
SmilChr04G003957 Chr04 NC_080390.1:55112819-55112838promoter 内 2209-2228 bp - 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 55108764-55111046(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACGTCTCTTGTCGTTTCTTG
SmilChr06G000042 Chr06 NC_080392.1:359012-359031promoter 内 2195-2214 bp - 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 356006-357225(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TCATTTTTTGTCATTTTTGA
SmilChr03G001574 Chr03 NC_080389.1:19867456-19867475promoter 内 2192-2211 bp + 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 19869265-19870366(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGTATTTTTGTCGTTATTAA
SmilChr03G002917 Chr03 NC_080389.1:45925602-45925621promoter 内 2175-2194 bp + 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 45927428-45931771(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCCTTTTTGTCGTAATCAA
SmilChr02G003906 Chr02 NC_080388.1:61122461-61122480promoter 内 2160-2179 bp - 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 61124302-61124374(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAAAAAAAAACAAAAAAAGA
SmilChr03G003315 Chr03 NC_080389.1:51395512-51395531promoter 内 2159-2178 bp - 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 51397354-51400647(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TGCATGAGGACAAAATGGAT
SmilChr06G002194 Chr06 NC_080392.1:30414759-30414778promoter 内 2155-2174 bp - 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 30416605-30418907(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CGAAAAAGAACAAAAAAAGG
SmilChr06G000223 Chr06 NC_080392.1:1490958-1490977promoter 内 2147-2166 bp - 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 1484076-1489123(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCCTTTTTGTCGTAATCAA
SmilChr08G002679 Chr08 NC_080394.1:26322733-26322752promoter 内 2132-2151 bp + 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 26318252-26320883(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAAATGAAGACAAAACCTAA
SmilChr02G003078 Chr02 NC_080388.1:51711010-51711029promoter 内 2123-2142 bp - 1859 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 51712888-51716962(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CATAAAAATACAAAAAAAAA
SmilChr05G000767 Chr05 NC_080391.1:5965620-5965639promoter 内 2106-2125 bp - 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 5962653-5963744(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTACATCTTGTCGTTTATTT
SmilChr02G003904 Chr02 NC_080388.1:61122461-61122480promoter 内 2060-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 61115982-61120539(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TCTTTTTTTGTTTTTTTTTT
SmilChr07G003514 Chr07 NC_080393.1:40142996-40143015promoter 内 2038-2057 bp - 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 40144959-40145064(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAAAACACAACAAAAACAAA
SmilChr07G000105 Chr07 NC_080393.1:574417-574436promoter 内 2010-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 576408-578856(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAAAAAAAAACAAAAAAAAA
SmilChr01G000076 Chr01 NC_080387.1:1328368-1328387promoter 内 2007-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 1330362-1331297(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGGATAACGACAACACCAAC
SmilChr07G001720 Chr07 NC_080393.1:14625808-14625827promoter 内 2007-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 14620812-14623833(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TGGATTTTCGTCGTTTAATG
SmilChr05G000753 Chr05 NC_080391.1:5824469-5824488promoter 内 2002-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 5826468-5830080(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTTGATCTTGTCGTGTCGTG
SmilChr03G001194 Chr03 NC_080389.1:13751168-13751187promoter 内 2000-2019 bp + 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 13753169-13757650(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GTTATGTTTGTCGTATTCAT
SmilChr02G002323 Chr02 NC_080388.1:40922427-40922446promoter 内 1971-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 40919547-40920416(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AATCCATTTGTCGTTTATTA
SmilChr02G003390 Chr02 NC_080388.1:55021723-55021742promoter 内 1944-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 55023780-55031918(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACTAGTTTTGTCATTTTTCA
SmilChr08G002105 Chr08 NC_080394.1:18904794-18904813promoter 内 1897-1916 bp - 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 18894008-18902709(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAATGTTTTGTCCTCATCAG
SmilChr05G004173 Chr05 NC_080391.1:55657786-55657805promoter 内 1878-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 55659909-55662451(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAGCAGAGGACAAAATAAGG
SmilChr01G001922 Chr01 NC_080387.1:34354870-34354889promoter 内 1866-1885 bp - 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 34352275-34352754(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCCTTTTTGTCGTAATCAA
SmilChr02G000679 Chr02 NC_080388.1:10632462-10632481promoter 内 1865-1884 bp + 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 10634598-10635767(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTCTCTTTTGTCTTCTCCGA
SmilChr01G001169 Chr01 NC_080387.1:23729070-23729089promoter 内 1842-1861 bp - 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 23731229-23732890(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGGCTGACGACAAAAATTAG
SmilChr04G002925 Chr04 NC_080390.1:45521854-45521873promoter 内 1827-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 45518617-45519699(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTCTCTTTTGTCTTCTCCGA
SmilChr03G003820 Chr03 NC_080389.1:57266834-57266853promoter 内 1818-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 57259763-57264670(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TACAAAAGAACAAAAAAGGT
SmilChr02G004880 Chr02 NC_080388.1:70885341-70885360promoter 内 1793-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 70887549-70898316(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAATTTTTTGTCATGTACTT
SmilChr08G004931 Chr08 NC_080394.1:58207010-58207029promoter 内 1793-1812 bp - 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 58209218-58211229(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TACAATATGACAAAACATTA
SmilChr01G003027 Chr01 NC_080387.1:49317077-49317096promoter 内 1790-1809 bp - 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49319288-49320826(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAGTTGAAGACAAAACTATG
SmilChr03G004042 Chr03 NC_080389.1:59424370-59424389promoter 内 1756-1775 bp - 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 59419441-59422144(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCTTTTTTGTCGTTAAAAT
SmilChr07G003910 Chr07 NC_080393.1:49300859-49300878promoter 内 1752-1771 bp + 2230 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49303108-49304703(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GAAATTTTTGTCGTTAAATA
SmilChr08G001167 Chr08 NC_080394.1:9351146-9351165promoter 内 1743-1762 bp + 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 9353404-9354635(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTTTTTTTTTA
SmilChr07G003115 Chr07 NC_080393.1:33054930-33054949promoter 内 1737-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 33057194-33061584(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GTTATGTTTGTCGTATTCAT
SmilChr03G004589 Chr03 NC_080389.1:63738180-63738199promoter 内 1734-1753 bp + 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 63731539-63735932(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGTATACGACAAATTTTCA
SmilChr07G001350 Chr07 NC_080393.1:10443364-10443383promoter 内 1713-1732 bp - 2269 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 10445652-10448495(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGTACCCGACAAAATTGTT
SmilChr07G003132 Chr07 NC_080393.1:33254130-33254149promoter 内 1711-1730 bp + 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 33256420-33260459(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GTTATGTTTGTCGTATTCAT
SmilChr02G000863 Chr02 NC_080388.1:14822237-14822256promoter 内 1681-1700 bp + 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 14819324-14819936(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAATAAGGGACAAAAAAGAA
SmilChr07G000854 Chr07 NC_080393.1:6080879-6080898promoter 内 1673-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 6083207-6091922(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GATATTTTTGTCTTCTGGTT
SmilChr05G000442 Chr05 NC_080391.1:3350701-3350720promoter 内 1655-1674 bp + 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 3353047-3359104(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TATTTTGTTGTCGTTTTTAT
SmilChr05G001340 Chr05 NC_080391.1:11813624-11813643promoter 内 1646-1665 bp + 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 11815979-11817212(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATATCCTTTGTCGATTTGTG