转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004920; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021741-RA_Salv SmilChr01G004920 MYB_related XP_057788125.1 MP00607 TTTAGGTTG

可能结合的靶基因

9718 个结合位点 6362 个候选靶基因 第 123 / 128 下载 TSV

上一页 123 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004447 Chr01 NC_080387.1:62571526-62571534promoter 内 1470-1478 bp + 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 62574057-62578662(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G002506 Chr01 NC_080387.1:42942134-42942142promoter 内 1430-1438 bp + 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 42935463-42939571(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G000017 Chr01 NC_080387.1:365051-365059promoter 内 1414-1422 bp - 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 367638-370713(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G000092 Chr01 NC_080387.1:1656916-1656924promoter 内 1305-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1659612-1661243(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G004445 Chr01 NC_080387.1:62571526-62571534promoter 内 1275-1283 bp + 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 62564470-62568808(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G001014 Chr01 NC_080387.1:21310716-21310724promoter 内 1270-1278 bp - 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 21313447-21314616(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G000038 Chr01 NC_080387.1:615950-615958promoter 内 1232-1240 bp - 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 611818-613189(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G006126 Chr01 NC_080387.1:76766041-76766049promoter 内 1219-1227 bp + 2774 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 76768823-76770452(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G005047 Chr01 NC_080387.1:68407569-68407577promoter 内 1186-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 68401320-68404762(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G002117 Chr02 NC_080388.1:37919006-37919014promoter 内 1155-1163 bp - 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37914969-37916168(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G002803 Chr01 NC_080387.1:46567859-46567867promoter 内 1114-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46570746-46573227(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G002686 Chr01 NC_080387.1:45066036-45066044promoter 内 1104-1112 bp - 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45068933-45070075(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G000044 Chr01 NC_080387.1:715327-715335promoter 内 1076-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 710815-712410(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G002059 Chr02 NC_080388.1:37066397-37066405promoter 内 1069-1077 bp + 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37069329-37072610(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G003067 Chr01 NC_080387.1:49523249-49523257promoter 内 1052-1060 bp - 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49515952-49520308(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G001050 Chr02 NC_080388.1:18724035-18724043promoter 内 1047-1055 bp - 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 18726989-18730100(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G006054 Chr01 NC_080387.1:76018396-76018404promoter 内 1046-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 76021351-76024909(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G005550 Chr02 NC_080388.1:75473880-75473888promoter 内 1043-1051 bp - 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 75476838-75489011(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G005846 Chr01 NC_080387.1:74426919-74426927promoter 内 1023-1031 bp - 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 74429897-74432449(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G002218 Chr01 NC_080387.1:38505317-38505325promoter 内 951-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 38501470-38502275(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr02G001420 Chr02 NC_080388.1:26822916-26822924promoter 内 932-940 bp + 3061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 26818107-26819855(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G005536 Chr01 NC_080387.1:72207170-72207178promoter 内 916-924 bp - 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72201162-72204093(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G000799 Chr02 NC_080388.1:13384888-13384896promoter 内 896-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13379253-13381791(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G000050 Chr01 NC_080387.1:777216-777224promoter 内 892-900 bp - 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 772718-774115(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G003376 Chr01 NC_080387.1:52454171-52454179promoter 内 887-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52450397-52451065(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G000764 Chr02 NC_080388.1:12449280-12449288promoter 内 882-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12444913-12446169(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr02G004403 Chr02 NC_080388.1:66359182-66359190promoter 内 882-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 66362301-66364636(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G002536 Chr01 NC_080387.1:43431585-43431593promoter 内 824-832 bp - 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43424648-43428416(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G002233 Chr01 NC_080387.1:38811482-38811490promoter 内 805-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 38807842-38808294(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr02G004363 Chr02 NC_080388.1:65917435-65917443promoter 内 757-765 bp + 3236 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 65920679-65922154(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G004248 Chr02 NC_080388.1:64670360-64670368promoter 内 732-740 bp + 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 64661246-64667099(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr02G001659 Chr02 NC_080388.1:30781153-30781161promoter 内 639-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30775413-30777799(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G003470 Chr02 NC_080388.1:56019004-56019012promoter 内 613-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 56011015-56015624(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G004477 Chr01 NC_080387.1:62872684-62872692promoter 内 600-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 62876085-62878174(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G000469 Chr01 NC_080387.1:9582582-9582590promoter 内 561-569 bp + 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9586022-9587586(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G003496 Chr01 NC_080387.1:53572945-53572953promoter 内 532-540 bp + 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 53566328-53569484(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
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SmilChr02G000245 Chr02 NC_080388.1:3175574-3175582promoter 内 498-506 bp - 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3169047-3172079(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G005172 Chr02 NC_080388.1:73024336-73024344promoter 内 494-502 bp + 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 73027843-73038259(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G001409 Chr01 NC_080387.1:27676596-27676604promoter 内 479-487 bp + 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 27680118-27683052(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G002348 Chr02 NC_080388.1:41259840-41259848promoter 内 478-486 bp + 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 41255458-41256325(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr02G002481 Chr02 NC_080388.1:43203249-43203257promoter 内 450-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43206800-43209621(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr01G001581 Chr01 NC_080387.1:29821879-29821887promoter 内 449-457 bp - 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 29825431-29831603(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
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SmilChr02G005314 Chr02 NC_080388.1:74026344-74026352promoter 内 388-396 bp - 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 74029957-74031686(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr02G002349 Chr02 NC_080388.1:41259840-41259848promoter 内 373-381 bp + 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 41263468-41265907(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG
SmilChr02G004179 Chr02 NC_080388.1:64074703-64074711promoter 内 366-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 64078338-64090839(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTACA
SmilChr01G002004 Chr01 NC_080387.1:35548087-35548095promoter 内 333-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 35540745-35544427(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TGTAGGTTG