转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 128 / 149 下载 TSV

上一页 128 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001032 Chr01 NC_080387.1:21480656-21480666promoter 内 543-553 bp - 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21476350-21477208(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr06G002020 Chr06 NC_080392.1:26036228-26036238promoter 内 538-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26029917-26032775(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr05G003256 Chr05 NC_080391.1:42072568-42072578promoter 内 532-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42076037-42077085(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr06G000808 Chr06 NC_080392.1:7595753-7595763promoter 内 474-484 bp + 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7588222-7592236(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA
SmilChr04G002612 Chr04 NC_080390.1:41546740-41546750promoter 内 462-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41542222-41543211(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCCGCTGTCA
SmilChr04G003483 Chr04 NC_080390.1:51278167-51278177promoter 内 461-471 bp + 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51281707-51292148(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCCGCTGTCA
SmilChr02G004999 Chr02 NC_080388.1:71816505-71816515promoter 内 445-455 bp + 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 71810471-71812959(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA
SmilChr06G001125 Chr06 NC_080392.1:11320237-11320247promoter 内 411-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11309276-11316657(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA
SmilChr04G001288 Chr04 NC_080390.1:20557619-20557629promoter 内 405-415 bp - 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 20552891-20554033(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr01G002630 Chr01 NC_080387.1:44604565-44604575promoter 内 382-392 bp - 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44600885-44600956(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCCGCTGTCA
SmilChr07G002662 Chr07 NC_080393.1:25838144-25838154promoter 内 209-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 25833700-25834362(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr03G001714 Chr03 NC_080389.1:22956258-22956268promoter 内 149-159 bp + 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 22949890-22952416(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr05G002129 Chr05 NC_080391.1:22382144-22382154promoter 内 104-114 bp - 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 22386041-22394554(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr03G002061 Chr03 NC_080389.1:31396298-31396308promoter 内 76-86 bp + 3915 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 31400223-31405967(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr06G001404 Chr06 NC_080392.1:14741381-14741391promoter 内 50-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14745332-14749619(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAT
SmilChr01G005225 Chr01 NC_080387.1:69794776-69794786promoter 内 18-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69786888-69790803(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr01G005226 Chr01 NC_080387.1:69805820-69805830promoter 内 12-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69797931-69801841(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr04G004029 Chr04 NC_080390.1:55556530-55556540promoter 内 3779-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 55553177-55556318(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr01G001453 Chr01 NC_080387.1:28214932-28214942promoter 内 1154-1164 bp + 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 28212024-28212095(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr01G001452 Chr01 NC_080387.1:28214932-28214942promoter 内 784-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 28209347-28211725(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr02G001497 Chr02 NC_080388.1:27903512-27903522promoter 内 3981-3991 bp - 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 27902189-27903502(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr02G004387 Chr02 NC_080388.1:66239648-66239658promoter 内 3853-3863 bp + 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66239796-66241119(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr06G002814 Chr06 NC_080392.1:40861752-40861762promoter 内 3763-3773 bp + 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40860680-40861524(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr02G003445 Chr02 NC_080388.1:55716296-55716306promoter 内 3685-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55713959-55715990(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr07G002491 Chr07 NC_080393.1:23588098-23588108promoter 内 3570-3580 bp + 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23581810-23587677(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr02G003499 Chr02 NC_080388.1:56206351-56206361promoter 内 3504-3514 bp + 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56202857-56205864(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr06G000211 Chr06 NC_080392.1:1422903-1422913promoter 内 3434-3444 bp + 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 1423470-1426365(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr01G002144 Chr01 NC_080387.1:37429635-37429645promoter 内 3362-3372 bp + 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 37430274-37436163(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr03G003053 Chr03 NC_080389.1:47418037-47418047promoter 内 3345-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 47413081-47417391(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCC
SmilChr04G000694 Chr04 NC_080390.1:8124748-8124758promoter 内 3338-3348 bp + 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8123065-8124095(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr05G002842 Chr05 NC_080391.1:33766324-33766334promoter 内 3278-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 33764585-33765611(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr05G000371 Chr05 NC_080391.1:2756368-2756378promoter 内 3258-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2757111-2759387(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCC
SmilChr07G002189 Chr07 NC_080393.1:20102889-20102899promoter 内 3253-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 20101201-20102151(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr02G004115 Chr02 NC_080388.1:63457948-63457958promoter 内 2972-2982 bp + 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 63455483-63456929(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr02G003446 Chr02 NC_080388.1:55716296-55716306promoter 内 2753-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55717544-55720811(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr02G003553 Chr02 NC_080388.1:56718122-56718132promoter 内 2653-2663 bp + 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56711296-56716784(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr02G001496 Chr02 NC_080388.1:27903512-27903522promoter 内 2619-2629 bp - 1372 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 27900496-27902140(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr04G004081 Chr04 NC_080390.1:55867108-55867118promoter 内 2567-2577 bp + 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55858332-55865684(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr06G000212 Chr06 NC_080392.1:1422903-1422913promoter 内 2527-2537 bp + 1464 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 1424377-1424479(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr06G000749 Chr06 NC_080392.1:6963917-6963927promoter 内 2457-2467 bp - 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 6960808-6962383(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr06G002813 Chr06 NC_080392.1:40861752-40861762promoter 内 2349-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40853513-40860110(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr05G001615 Chr05 NC_080391.1:14937823-14937833promoter 内 2085-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 14935162-14935917(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr04G002805 Chr04 NC_080390.1:43969901-43969911promoter 内 2049-2059 bp - 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 43967459-43967959(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr01G003615 Chr01 NC_080387.1:54687060-54687070promoter 内 2007-2017 bp + 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 54682165-54685076(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAA
SmilChr02G003996 Chr02 NC_080388.1:62284596-62284606promoter 内 1955-1965 bp + 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62286642-62291386(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr01G004188 Chr01 NC_080387.1:60305159-60305169promoter 内 1928-1938 bp + 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 60307232-60320496(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCC
SmilChr01G004829 Chr01 NC_080387.1:66438044-66438054promoter 内 1816-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66434750-66435869(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT
SmilChr05G004047 Chr05 NC_080391.1:54448888-54448898promoter 内 1486-1496 bp + 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 54442411-54446383(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr06G001380 Chr06 NC_080392.1:14461924-14461934promoter 内 1301-1311 bp + 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 14454599-14459234(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAT
SmilChr02G004444 Chr02 NC_080388.1:66787939-66787949promoter 内 1227-1237 bp + 2764 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66790713-66793924(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCT