转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 13 / 137 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000552 Chr08 NC_080394.1:4002769-4002783promoter 内 2064-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 4004706-4011493(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATATGTGACGTGGCA
SmilChr07G002507 Chr07 NC_080393.1:23778452-23778466promoter 内 1876-1890 bp - 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 23780577-23781203(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGTGCCGACGTGGCC
SmilChr02G002447 Chr02 NC_080388.1:42702088-42702102promoter 内 1808-1822 bp - 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 42698713-42699909(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGATCACG
SmilChr04G003887 Chr04 NC_080390.1:54690455-54690469promoter 内 1735-1749 bp + 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 54684630-54688203(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCTTGTGACGTGGCA
SmilChr01G000635 Chr01 NC_080387.1:14274898-14274912promoter 内 1670-1684 bp - 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 14277229-14280357(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCTTGTGACGTGGCA
SmilChr04G003889 Chr04 NC_080390.1:54690455-54690469promoter 内 1193-1207 bp + 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 54693263-54697665(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCACAAGA
SmilChr02G001725 Chr02 NC_080388.1:31759333-31759347promoter 内 815-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 31762519-31763588(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGAGCTCG
SmilChr01G003431 Chr01 NC_080387.1:52954817-52954831promoter 内 682-696 bp - 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52949833-52951512(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCAGCAAT
SmilChr04G000138 Chr04 NC_080390.1:1189630-1189644promoter 内 75-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 1179164-1185718(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATATCCGACGTGGCA
SmilChr03G002837 Chr03 NC_080389.1:44912305-44912319promoter 内 3935-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 6 44912371-44919831(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTGGGCACT
SmilChr03G004704 Chr03 NC_080389.1:64333297-64333311promoter 内 3843-3857 bp + 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 64333455-64336742(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCACATCC
SmilChr06G000451 Chr06 NC_080392.1:3659438-3659452promoter 内 3745-3759 bp + 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 3651918-3659196(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGTTCCGACGTGGCG
SmilChr03G001346 Chr03 NC_080389.1:15712134-15712148promoter 内 3042-3056 bp + 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 15709870-15711189(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCAGGCGACGTGGCG
SmilChr03G004703 Chr03 NC_080389.1:64333297-64333311promoter 内 2998-3012 bp + 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 64328867-64332308(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGATGTGACGTGGCG
SmilChr04G001540 Chr04 NC_080390.1:25369654-25369668promoter 内 3901-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 25364426-25369568(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGGCCTT
SmilChr01G005526 Chr01 NC_080387.1:72131329-72131343promoter 内 3857-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 72128404-72131199(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAATCCGACGTGGCG
SmilChr02G003765 Chr02 NC_080388.1:59351524-59351538promoter 内 3016-3030 bp - 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 59352509-59353943(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGGGGTCACGTGGCG
SmilChr02G002661 Chr02 NC_080388.1:46082967-46082981promoter 内 2525-2539 bp - 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46070906-46081505(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCACCCAG
SmilChr04G000065 Chr04 NC_080390.1:587652-587666promoter 内 2447-2461 bp + 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 589206-590540(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGACCCCT
SmilChr01G002777 Chr01 NC_080387.1:46211288-46211302promoter 内 2363-2377 bp - 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46205267-46209664(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGCAAC
SmilChr01G005728 Chr01 NC_080387.1:73424176-73424190promoter 内 1846-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73419687-73422035(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCACCATC
SmilChr02G002976 Chr02 NC_080388.1:50304443-50304457promoter 内 1810-1824 bp - 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50306634-50308362(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTGACGACGTGGCC
SmilChr02G002884 Chr02 NC_080388.1:49130750-49130764promoter 内 1804-1818 bp + 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 49126854-49128567(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTGACGACGTGGCC
SmilChr07G004324 Chr07 NC_080393.1:55798528-55798542promoter 内 1577-1591 bp - 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 55795193-55796118(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAGTATC
SmilChr04G000674 Chr04 NC_080390.1:7648554-7648568promoter 内 772-786 bp + 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 7651783-7655599(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCTGCCTC
SmilChr05G002492 Chr05 NC_080391.1:27605862-27605876promoter 内 58-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 27597530-27601933(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAGGGTCACGTGGCG
SmilChr01G001580 Chr01 NC_080387.1:29816992-29817006promoter 内 2323-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 7 29813831-29815328(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGGATAA
SmilChr01G003988 Chr01 NC_080387.1:58307564-58307578promoter 内 3174-3188 bp + 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 6 58308391-58311924(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAGCACT
SmilChr07G001008 Chr07 NC_080393.1:7336392-7336406promoter 内 2442-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 6 7337951-7341534(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGGATAA
SmilChr02G003822 Chr02 NC_080388.1:59837116-59837130promoter 内 3742-3756 bp - 245 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 59837375-59843116(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGATGACGTGGCG
SmilChr04G000460 Chr04 NC_080390.1:4902761-4902775promoter 内 2642-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 4896849-4901416(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGCTGACGTGGAA
SmilChr01G004818 Chr01 NC_080387.1:66352838-66352852promoter 内 2614-2628 bp + 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 66354225-66356865(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCATCGCC
SmilChr01G001537 Chr01 NC_080387.1:29396446-29396460promoter 内 3519-3533 bp - 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 29394965-29395978(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAGCATT
SmilChr03G003620 Chr03 NC_080389.1:54861211-54861225promoter 内 2548-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 54858763-54859772(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCACCGCC
SmilChr06G000855 Chr06 NC_080392.1:8096040-8096054promoter 内 1928-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 8086665-8093981(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTAGTTGACGTGGCA
SmilChr07G003355 Chr07 NC_080393.1:36039215-36039229promoter 内 1755-1769 bp + 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 36041461-36041949(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAGATCT
SmilChr04G003439 Chr04 NC_080390.1:50932892-50932906promoter 内 694-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 50926055-50929599(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGCTGACGTGGAA
SmilChr03G001038 Chr03 NC_080389.1:12103051-12103065promoter 内 693-707 bp - 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 12106359-12111740(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCGACGTGGCA
SmilChr02G004844 Chr02 NC_080388.1:70570633-70570647promoter 内 3970-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 70570664-70571957(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACTGGCCACGTGGCG
SmilChr03G003621 Chr03 NC_080389.1:54861211-54861225promoter 内 3827-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 54859913-54861051(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCACCGCC
SmilChr05G000977 Chr05 NC_080391.1:7895997-7896011promoter 内 2842-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 7891031-7894852(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGGCGTC
SmilChr06G002559 Chr06 NC_080392.1:36766074-36766088promoter 内 1387-1401 bp + 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 36761610-36763474(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGCTGACGTGGAA
SmilChr07G003461 Chr07 NC_080393.1:38640713-38640727promoter 内 709-723 bp - 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 38644005-38646946(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGTGCTGACGTGGAA
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SmilChr04G003295 Chr04 NC_080390.1:49665324-49665338promoter 内 3587-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 49665738-49666697(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAACTAC
SmilChr01G001538 Chr01 NC_080387.1:29396446-29396460promoter 内 3458-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 29396989-29398368(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGCTGACGTGGAA
SmilChr08G002243 Chr08 NC_080394.1:20583287-20583301promoter 内 3036-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 20584252-20592753(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGCTGACGTGGAA
SmilChr02G004072 Chr02 NC_080388.1:63008197-63008211promoter 内 2961-2975 bp - 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 63005876-63007171(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAACTAC