转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 130 / 143 下载 TSV

上一页 130 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000587 Chr07 NC_080393.1:4015461-4015472promoter 内 2552-2563 bp - 1438 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 4013198-4014023(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAAG
SmilChr04G003483 Chr04 NC_080390.1:51279185-51279196promoter 内 1479-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 51281707-51292148(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTT
SmilChr05G003698 Chr05 NC_080391.1:50091765-50091776promoter 内 3855-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 50091911-50094033(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTA
SmilChr01G004009 Chr01 NC_080387.1:58507784-58507795promoter 内 3838-3849 bp - 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 58507947-58510160(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCCC
SmilChr03G000321 Chr03 NC_080389.1:3658742-3658753promoter 内 3719-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 3655196-3658471(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTATG
SmilChr03G000120 Chr03 NC_080389.1:1322813-1322824promoter 内 3678-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 1302179-1322501(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTATG
SmilChr07G002703 Chr07 NC_080393.1:26402570-26402581promoter 内 3587-3598 bp - 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 26402984-26406766(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTA
SmilChr06G000314 Chr06 NC_080392.1:2275217-2275228promoter 内 3533-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 2270788-2274760(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGCA
SmilChr02G003944 Chr02 NC_080388.1:61588901-61588912promoter 内 3475-3486 bp - 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61589427-61591159(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGG
SmilChr07G000588 Chr07 NC_080393.1:4015461-4015472promoter 内 3450-3461 bp - 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 4016012-4017238(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTG
SmilChr05G000598 Chr05 NC_080391.1:4503685-4503696promoter 内 3141-3152 bp - 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 4501605-4502836(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGCAAGCTGTA
SmilChr03G000122 Chr03 NC_080389.1:1322813-1322824promoter 内 3124-3135 bp + 866 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 1323690-1324707(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAG
SmilChr04G003361 Chr04 NC_080390.1:50203989-50204000promoter 内 2624-2635 bp - 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 50205366-50206919(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTA
SmilChr07G004184 Chr07 NC_080393.1:53818871-53818882promoter 内 2285-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 53820587-53828179(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTATG
SmilChr01G004819 Chr01 NC_080387.1:66377515-66377526promoter 内 2221-2232 bp - 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 66379295-66382038(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCCC
SmilChr06G000315 Chr06 NC_080392.1:2275217-2275228promoter 内 1973-1984 bp - 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 2277245-2284218(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGG
SmilChr04G001111 Chr04 NC_080390.1:15947307-15947318promoter 内 1902-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 15944272-15945219(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGG
SmilChr02G005183 Chr02 NC_080388.1:73129661-73129672promoter 内 1784-1795 bp + 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 73131878-73133462(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGCAAGCTGTA
SmilChr01G005921 Chr01 NC_080387.1:75038061-75038072promoter 内 1274-1285 bp + 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 75032688-75035345(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTG
SmilChr04G002259 Chr04 NC_080390.1:36542118-36542129promoter 内 976-987 bp - 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 36545143-36559440(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTA
SmilChr04G003356 Chr04 NC_080390.1:50155038-50155049promoter 内 655-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 50158384-50167188(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGCAAGCTGTA
SmilChr02G004468 Chr02 NC_080388.1:67086862-67086873promoter 内 578-589 bp + 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 67090285-67092071(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGCAAGCTGTA
SmilChr02G000980 Chr02 NC_080388.1:17174068-17174079promoter 内 461-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 17177608-17183859(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTATG
SmilChr07G001743 Chr07 NC_080393.1:14786685-14786696promoter 内 253-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 14790433-14796584(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGG
SmilChr01G002065 Chr01 NC_080387.1:36511723-36511734promoter 内 248-259 bp + 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 36504862-36507981(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGG
SmilChr04G000905 Chr04 NC_080390.1:11782607-11782618promoter 内 172-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 11786436-11789208(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTA
SmilChr04G003722 Chr04 NC_080390.1:53561946-53561957promoter 内 89-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 53565858-53570442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTA
SmilChr01G000593 Chr01 NC_080387.1:12925750-12925761promoter 内 83-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 12914528-12921843(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAAG
SmilChr01G003633 Chr01 NC_080387.1:54853150-54853161promoter 内 2088-2099 bp + 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 54855063-54856789(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCA
SmilChr05G000911 Chr05 NC_080391.1:7226295-7226306promoter 内 1403-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 7228893-7230180(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr05G000974 Chr05 NC_080391.1:7875166-7875177promoter 内 1122-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 7878045-7879089(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr01G003634 Chr01 NC_080387.1:54853150-54853161promoter 内 321-332 bp + 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 54856830-54858072(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCA
SmilChr07G004134 Chr07 NC_080393.1:53097121-53097132promoter 内 3934-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 53097188-53099171(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr07G003060 Chr07 NC_080393.1:31988226-31988237promoter 内 3843-3854 bp - 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 31988384-31990044(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG
SmilChr07G003062 Chr07 NC_080393.1:32012428-32012439promoter 内 3843-3854 bp - 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 32012586-32014209(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG
SmilChr01G003436 Chr01 NC_080387.1:52977458-52977469promoter 内 3832-3843 bp + 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 52975435-52977300(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTT
SmilChr02G004714 Chr02 NC_080388.1:69406064-69406075promoter 内 3697-3708 bp - 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 69406368-69407424(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAC
SmilChr02G001367 Chr02 NC_080388.1:25760919-25760930promoter 内 3654-3665 bp + 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 25759521-25760583(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATG
SmilChr02G001234 Chr02 NC_080388.1:22657941-22657952promoter 内 3653-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 22656557-22657604(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATG
SmilChr06G003066 Chr06 NC_080392.1:43550601-43550612promoter 内 3645-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 43547665-43550256(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCAAGCTGTA
SmilChr07G002781 Chr07 NC_080393.1:27706850-27706861promoter 内 3585-3596 bp - 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 27707266-27708283(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTA
SmilChr02G000238 Chr02 NC_080388.1:3050963-3050974promoter 内 3475-3486 bp - 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 3049411-3050448(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCGG
SmilChr01G000300 Chr01 NC_080387.1:5905232-5905243promoter 内 3453-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 5900921-5904695(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCTG
SmilChr08G000669 Chr08 NC_080394.1:4964551-4964562promoter 内 3209-3220 bp + 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 4960000-4963770(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr02G000973 Chr02 NC_080388.1:17016449-17016460promoter 内 3012-3023 bp - 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 17017438-17018094(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATG
SmilChr01G005987 Chr01 NC_080387.1:75498518-75498529promoter 内 2680-2691 bp + 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 75494137-75497208(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTT
SmilChr07G000907 Chr07 NC_080393.1:6491601-6491612promoter 内 2675-2686 bp - 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 6488161-6490286(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGAC
SmilChr01G001625 Chr01 NC_080387.1:30332538-30332549promoter 内 2613-2624 bp + 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 30329325-30331161(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr05G004207 Chr05 NC_080391.1:55964291-55964302promoter 内 2515-2526 bp + 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 55961538-55962816(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG
SmilChr02G003978 Chr02 NC_080388.1:62035195-62035206promoter 内 2361-2372 bp - 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 62036835-62048554(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG