转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 131 / 143 下载 TSV

上一页 131 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000879 Chr02 NC_080388.1:15161301-15161312promoter 内 2190-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 15140088-15159501(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATG
SmilChr05G000520 Chr05 NC_080391.1:4009453-4009464promoter 内 2151-2162 bp - 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 3998101-4007614(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGAC
SmilChr07G003953 Chr07 NC_080393.1:50029152-50029163promoter 内 2022-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 50031131-50040745(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGAC
SmilChr07G003943 Chr07 NC_080393.1:49799844-49799855promoter 内 2017-2028 bp + 1973 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 49801828-49811414(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGAC
SmilChr04G003937 Chr04 NC_080390.1:54992750-54992761promoter 内 1742-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 54995009-54998521(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATG
SmilChr03G002806 Chr03 NC_080389.1:44527290-44527301promoter 内 1729-1740 bp + 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 44519219-44525029(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG
SmilChr04G004046 Chr04 NC_080390.1:55676845-55676856promoter 内 1717-1728 bp - 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 55679129-55680176(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG
SmilChr03G004621 Chr03 NC_080389.1:63901555-63901566promoter 内 1592-1603 bp + 2398 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 63898406-63899157(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr02G002087 Chr02 NC_080388.1:37453820-37453831promoter 内 1548-1559 bp + 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 37456273-37458321(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCA
SmilChr01G005888 Chr01 NC_080387.1:74796614-74796625promoter 内 1514-1525 bp + 2476 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 74799101-74807566(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCGG
SmilChr06G002736 Chr06 NC_080392.1:39623283-39623294promoter 内 1507-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 39620245-39620800(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTA
SmilChr08G003498 Chr08 NC_080394.1:37557890-37557901promoter 内 1499-1510 bp + 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 37553666-37555399(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTA
SmilChr01G000343 Chr01 NC_080387.1:7002235-7002246promoter 内 1492-1503 bp + 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 7004744-7008154(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCGG
SmilChr03G004550 Chr03 NC_080389.1:63484165-63484176promoter 内 1461-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 63476045-63481636(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr02G005020 Chr02 NC_080388.1:71963902-71963913promoter 内 1413-1424 bp + 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 71966490-71968279(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCAAGCTGTA
SmilChr07G002790 Chr07 NC_080393.1:27804265-27804276promoter 内 1388-1399 bp - 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 27800664-27801663(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCAAGCTGTA
SmilChr01G001627 Chr01 NC_080387.1:30332538-30332549promoter 内 1302-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 30335237-30340440(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCA
SmilChr04G004177 Chr04 NC_080390.1:56371674-56371685promoter 内 1277-1288 bp + 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 56366051-56368961(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTGA
SmilChr08G002102 Chr08 NC_080394.1:18880471-18880482promoter 内 1155-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 18883317-18886445(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCCA
SmilChr01G005139 Chr01 NC_080387.1:69191293-69191304promoter 内 1121-1132 bp - 2869 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 69171462-69188424(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTAAG
SmilChr01G003548 Chr01 NC_080387.1:54075913-54075924promoter 内 1067-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 54072517-54072990(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr01G003619 Chr01 NC_080387.1:54726115-54726126promoter 内 930-941 bp + 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 54729186-54734505(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCA
SmilChr02G004215 Chr02 NC_080388.1:64394710-64394721promoter 内 907-918 bp + 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 64388940-64391627(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTG
SmilChr03G004620 Chr03 NC_080389.1:63901555-63901566promoter 内 792-803 bp + 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 63897532-63898357(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr04G002227 Chr04 NC_080390.1:35985442-35985453promoter 内 715-726 bp - 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 35988728-35991869(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACCTGTCAA
SmilChr08G001193 Chr08 NC_080394.1:9598105-9598116promoter 内 540-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 9601566-9604031(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAT
SmilChr01G001624 Chr01 NC_080387.1:30332538-30332549promoter 内 507-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 30328983-30329055(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr07G000401 Chr07 NC_080393.1:2763574-2763585promoter 内 390-401 bp - 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 2767185-2773074(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAC
SmilChr06G003065 Chr06 NC_080392.1:43550601-43550612promoter 内 286-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 43545390-43546897(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCAAGCTGTA
SmilChr07G002791 Chr07 NC_080393.1:27804265-27804276promoter 内 191-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 27808075-27808584(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTT
SmilChr05G001038 Chr05 NC_080391.1:8511953-8511964promoter 内 116-127 bp + 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 8507386-8508079(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTC
SmilChr07G002789 Chr07 NC_080393.1:27804265-27804276promoter 内 86-97 bp - 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 27800142-27800361(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCAAGCTGTA
SmilChr06G001833 Chr06 NC_080392.1:21516389-21516400promoter 内 60-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 21512097-21512459(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCCA
SmilChr05G003180 Chr05 NC_080391.1:40718516-40718527promoter 内 1130-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 40721387-40725838(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr05G003195 Chr05 NC_080391.1:40842120-40842131promoter 内 1126-1137 bp + 2864 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 40834821-40839256(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr05G000636 Chr05 NC_080391.1:4802681-4802692promoter 内 818-829 bp - 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 4805864-4809650(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTCC
SmilChr04G001123 Chr04 NC_080390.1:16278987-16278998promoter 内 673-684 bp + 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 16282315-16283636(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGACCAGCTGTT
SmilChr06G002259 Chr06 NC_080392.1:32011724-32011735promoter 内 649-660 bp + 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 32007028-32008383(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTA
SmilChr02G001765 Chr02 NC_080388.1:32394070-32394081promoter 内 452-463 bp + 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 32384930-32390532(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTA
SmilChr07G000860 Chr07 NC_080393.1:6124051-6124062promoter 内 129-140 bp + 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 6115449-6120190(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTA
SmilChr05G003219 Chr05 NC_080391.1:41313876-41313887promoter 内 3884-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 41313993-41315268(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTT
SmilChr06G003056 Chr06 NC_080392.1:43452553-43452564promoter 内 3832-3843 bp - 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 43452722-43454303(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCCA
SmilChr01G001479 Chr01 NC_080387.1:28571735-28571746promoter 内 3776-3787 bp + 214 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 28570654-28571521(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTGT
SmilChr03G002831 Chr03 NC_080389.1:44806456-44806467promoter 内 3678-3689 bp - 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 44804631-44806144(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGCG
SmilChr03G000557 Chr03 NC_080389.1:6039017-6039028promoter 内 2914-2925 bp + 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 6040104-6044499(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCA
SmilChr05G001574 Chr05 NC_080391.1:14407605-14407616promoter 内 2205-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 14405143-14405820(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAC
SmilChr01G003240 Chr01 NC_080387.1:51138464-51138475promoter 内 2170-2181 bp + 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51140295-51140618(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCA
SmilChr04G003797 Chr04 NC_080390.1:54144780-54144791promoter 内 2037-2048 bp - 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 54146744-54155850(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCGG
SmilChr02G001997 Chr02 NC_080388.1:36122606-36122617promoter 内 1866-1877 bp + 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 36105911-36120482(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr04G000718 Chr04 NC_080390.1:8408420-8408431promoter 内 1835-1846 bp + 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 8403916-8406265(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTT