转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 14 / 151 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002419 Chr02 NC_080388.1:42172400-42172412promoter 内 250-262 bp - 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 42176151-42180320(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGAA
SmilChr02G001754 Chr02 NC_080388.1:32291831-32291843promoter 内 3809-3821 bp + 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 32292023-32295229(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCATT
SmilChr02G005195 Chr02 NC_080388.1:73210647-73210659promoter 内 2786-2798 bp + 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 73211862-73215804(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTAT
SmilChr02G005194 Chr02 NC_080388.1:73210647-73210659promoter 内 2509-2521 bp + 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 73208114-73209167(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGGA
SmilChr03G001710 Chr03 NC_080389.1:22870922-22870934promoter 内 1252-1264 bp - 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 22873671-22874800(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTGAA
SmilChr02G005193 Chr02 NC_080388.1:73210647-73210659promoter 内 60-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 73203421-73206718(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGGA
SmilChr02G004128 Chr02 NC_080388.1:63522279-63522291promoter 内 3685-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 63522595-63526785(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCAGC
SmilChr01G006092 Chr01 NC_080387.1:76403607-76403619promoter 内 3453-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 76400229-76403071(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGAGGTAGGTGAA
SmilChr01G005097 Chr01 NC_080387.1:68799485-68799497promoter 内 3214-3226 bp + 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 68800272-68802269(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAGC
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74137699-74137711promoter 内 3095-3107 bp - 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 74130223-74136805(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAGC
SmilChr01G004167 Chr01 NC_080387.1:60183744-60183756promoter 内 2346-2358 bp - 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 60180378-60182101(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTAT
SmilChr02G001538 Chr02 NC_080388.1:28619289-28619301promoter 内 2263-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 28607906-28617563(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGAA
SmilChr01G004416 Chr01 NC_080387.1:62302631-62302643promoter 内 1241-1253 bp - 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 62305391-62306368(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGGA
SmilChr02G004872 Chr02 NC_080388.1:70805657-70805669promoter 内 3883-3895 bp + 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 70805775-70807636(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTAT
SmilChr05G000192 Chr05 NC_080391.1:1534051-1534063promoter 内 3579-3591 bp + 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 1529165-1533641(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTAAG
SmilChr01G001780 Chr01 NC_080387.1:32689797-32689809promoter 内 3243-3255 bp - 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 32690555-32691341(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGGA
SmilChr01G004240 Chr01 NC_080387.1:60720358-60720370promoter 内 2534-2546 bp - 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 60715424-60718903(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAGC
SmilChr01G005814 Chr01 NC_080387.1:74137699-74137711promoter 内 2482-2494 bp - 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 74139218-74141307(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTGGTAGGTGGG
SmilChr01G001781 Chr01 NC_080387.1:32689797-32689809promoter 内 2244-2256 bp - 1745 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 32691554-32693498(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGGA
SmilChr04G002591 Chr04 NC_080390.1:41329535-41329547promoter 内 2105-2117 bp + 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 41325877-41327651(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTGAA
SmilChr02G000292 Chr02 NC_080388.1:3701552-3701564promoter 内 1254-1266 bp + 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 3704299-3707126(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCAAT
SmilChr03G003540 Chr03 NC_080389.1:54038398-54038410promoter 内 1013-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 54029571-54035422(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGAA
SmilChr02G003699 Chr02 NC_080388.1:58451771-58451783promoter 内 854-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 58454918-58457152(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGAA
SmilChr03G004566 Chr03 NC_080389.1:63589392-63589404promoter 内 791-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 63584986-63586194(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTTG
SmilChr01G001538 Chr01 NC_080387.1:29393680-29393692promoter 内 692-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 5 29396989-29398368(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCCA
SmilChr01G000735 Chr01 NC_080387.1:16308836-16308848promoter 内 2798-2810 bp + 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 4 16307539-16307645(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTAGA
SmilChr03G001723 Chr03 NC_080389.1:23135180-23135192promoter 内 3378-3390 bp + 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 3 23133489-23134569(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCGGTAGGTGGA
SmilChr01G001740 Chr01 NC_080387.1:32041028-32041040promoter 内 3089-3101 bp + 900 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 3 32041940-32046946(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCCA
SmilChr01G005179 Chr01 NC_080387.1:69515693-69515705promoter 内 1497-1509 bp + 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 3 69518197-69522787(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCACG
SmilChr01G005178 Chr01 NC_080387.1:69515693-69515705promoter 内 3955-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 69512361-69515659(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTGGTAGGTGGA
SmilChr04G000586 Chr04 NC_080390.1:6515759-6515771promoter 内 3934-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 6515826-6520158(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCAAA
SmilChr05G000811 Chr05 NC_080391.1:6334901-6334913promoter 内 3678-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 6334518-6334590(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTAAG
SmilChr05G000502 Chr05 NC_080391.1:3917423-3917435promoter 内 3085-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 3914451-3916519(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTGAG
SmilChr03G003034 Chr03 NC_080389.1:47249081-47249093promoter 内 2579-2591 bp - 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 47244691-47247671(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACG
SmilChr01G001087 Chr01 NC_080387.1:22315546-22315558promoter 内 2375-2387 bp + 1614 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 22311098-22313932(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGAA
SmilChr02G003467 Chr02 NC_080388.1:55970727-55970739promoter 内 1934-1946 bp - 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 55972794-55975525(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCGGTAGGTGGG
SmilChr04G002229 Chr04 NC_080390.1:36014132-36014144promoter 内 1704-1716 bp - 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 36009714-36011847(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCATG
SmilChr02G000384 Chr02 NC_080388.1:4791622-4791634promoter 内 1662-1674 bp + 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 4793961-4795480(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCATG
SmilChr02G000464 Chr02 NC_080388.1:6215218-6215230promoter 内 973-985 bp + 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 6218246-6218740(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCTAA
SmilChr01G005714 Chr01 NC_080387.1:73354209-73354221promoter 内 875-887 bp + 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 73346682-73351095(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTGAA
SmilChr01G001085 Chr01 NC_080387.1:22293557-22293569promoter 内 256-268 bp + 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 22287740-22289824(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTAGA
SmilChr05G000504 Chr05 NC_080391.1:3917423-3917435promoter 内 97-109 bp + 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 3921327-3926190(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCAAA
SmilChr05G000503 Chr05 NC_080391.1:3917423-3917435promoter 内 3675-3687 bp + 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 3917749-3920912(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCAAA
SmilChr04G004138 Chr04 NC_080390.1:56177327-56177339promoter 内 3652-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 56174932-56176990(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACGGTAGGTGAA
SmilChr01G001019 Chr01 NC_080387.1:21359603-21359615promoter 内 3622-3634 bp + 367 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 21359982-21363226(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCATG
SmilChr01G001088 Chr01 NC_080387.1:22332062-22332074promoter 内 3612-3624 bp - 377 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 22328507-22331685(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCATG
SmilChr01G005884 Chr01 NC_080387.1:74761265-74761277promoter 内 3570-3582 bp + 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 74758092-74760846(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTGGTAGGTGAA
SmilChr03G001592 Chr03 NC_080389.1:20181543-20181555promoter 内 3241-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 20182303-20184509(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCATG
SmilChr02G004538 Chr02 NC_080388.1:67956860-67956872promoter 内 3230-3242 bp - 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 67957631-67960798(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGGA
SmilChr01G002098 Chr01 NC_080387.1:37023083-37023095promoter 内 2855-2867 bp - 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 37024229-37028094(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGAA