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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 145 / 148 下载 TSV

上一页 145 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002300 Chr04 NC_080390.1:37245855-37245868promoter 内 2433-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 37247423-37251776(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATTGGTCACGCGG
SmilChr02G003923 Chr02 NC_080388.1:61302723-61302736promoter 内 2290-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 61298190-61301025(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAACTTTG
SmilChr05G000535 Chr05 NC_080391.1:4101373-4101386promoter 内 2193-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 4097265-4099578(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTTATCA
SmilChr01G000701 Chr01 NC_080387.1:15738471-15738484promoter 内 2147-2160 bp + 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 15740325-15742184(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTCTTTCACGTGG
SmilChr02G005004 Chr02 NC_080388.1:71836662-71836675promoter 内 2081-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 71834042-71834755(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAATATCACGTGC
SmilChr08G000876 Chr08 NC_080394.1:6489178-6489191promoter 内 1978-1991 bp + 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 6491201-6491271(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGAATCACGTGA
SmilChr07G000039 Chr07 NC_080393.1:167890-167903promoter 内 1926-1939 bp - 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 169965-173166(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAACAATA
SmilChr01G006058 Chr01 NC_080387.1:76044709-76044722promoter 内 1919-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 76039776-76042640(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAATATCACGTGC
SmilChr01G002383 Chr01 NC_080387.1:41051462-41051475promoter 内 1905-1918 bp - 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 41053558-41055142(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATATAT
SmilChr07G001280 Chr07 NC_080393.1:9842782-9842795promoter 内 1852-1865 bp + 2136 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 9844931-9847315(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGAATCACGTGA
SmilChr01G005321 Chr01 NC_080387.1:70427551-70427564promoter 内 1699-1712 bp + 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 70429853-70432586(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATAATGCACGTGG
SmilChr07G000037 Chr07 NC_080393.1:167890-167903promoter 内 1671-1684 bp - 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 162832-165573(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATTGTTCACGTGG
SmilChr07G003759 Chr07 NC_080393.1:45897262-45897275promoter 内 1671-1684 bp + 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 45899592-45903964(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGATTCTCACGTGT
SmilChr02G005337 Chr02 NC_080388.1:74222749-74222762promoter 内 1638-1651 bp + 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 74216479-74220399(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGATTCTAT
SmilChr07G004605 Chr07 NC_080393.1:58855974-58855987promoter 内 1630-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 58850431-58853616(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAATTATC
SmilChr06G001315 Chr06 NC_080392.1:13646100-13646113promoter 内 1607-1620 bp + 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 13636719-13643719(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAACTAAA
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SmilChr08G000639 Chr08 NC_080394.1:4763696-4763709promoter 内 1413-1426 bp - 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 4754735-4761121(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGCAATCACGTGC
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SmilChr05G004073 Chr05 NC_080391.1:54635036-54635049promoter 内 1318-1331 bp - 2670 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 54625242-54632366(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATATTCCACGTGG
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SmilChr07G002925 Chr07 NC_080393.1:29622094-29622107promoter 内 1070-1083 bp + 2918 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 29625025-29627334(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCTAAACACGTGG
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SmilChr07G003852 Chr07 NC_080393.1:47766163-47766176promoter 内 937-950 bp + 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 47758976-47763112(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCATGGAG
SmilChr03G000995 Chr03 NC_080389.1:11305149-11305162promoter 内 820-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 11308330-11309262(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAATACCA
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SmilChr06G001742 Chr06 NC_080392.1:20086595-20086608promoter 内 707-720 bp - 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 20089889-20092137(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTGACAG
SmilChr01G001712 Chr01 NC_080387.1:31589350-31589363promoter 内 688-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 31592663-31598105(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTATCTCACGTGT
SmilChr03G003652 Chr03 NC_080389.1:55307525-55307538promoter 内 677-690 bp + 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 55300342-55304214(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGATCTTAG
SmilChr08G001675 Chr08 NC_080394.1:13997495-13997508promoter 内 615-628 bp + 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 13992994-13994122(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGAAATT
SmilChr07G001201 Chr07 NC_080393.1:9164905-9164918promoter 内 447-460 bp - 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 9158684-9161364(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAATTCACGTGT
SmilChr01G001640 Chr01 NC_080387.1:30417282-30417295promoter 内 446-459 bp + 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 30420837-30422442(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTATTTCACGTGC
SmilChr07G000410 Chr07 NC_080393.1:2839787-2839800promoter 内 284-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 2833609-2836083(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCACTCACGTGT
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SmilChr01G005748 Chr01 NC_080387.1:73556875-73556888promoter 内 171-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 73560705-73564959(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATAATTCACGTGC
SmilChr03G004195 Chr03 NC_080389.1:60610100-60610113promoter 内 142-155 bp + 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 60603162-60606254(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATATTTT
SmilChr03G004578 Chr03 NC_080389.1:63670848-63670861promoter 内 86-99 bp - 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 63664236-63666946(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTAGATCACGTGA
SmilChr02G005334 Chr02 NC_080388.1:74172854-74172867promoter 内 2695-2708 bp + 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 2 74162934-74171561(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAATTAAG
SmilChr07G002912 Chr07 NC_080393.1:29520636-29520649promoter 内 3934-3947 bp + 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 29520703-29522625(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTAATTCACGTGC
SmilChr06G002149 Chr06 NC_080392.1:29203488-29203501promoter 内 3927-3940 bp - 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 29203562-29207885(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTACATA
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SmilChr06G002041 Chr06 NC_080392.1:26695613-26695626promoter 内 3899-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 26695715-26697224(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTTTTTA
SmilChr07G001405 Chr07 NC_080393.1:10927537-10927550promoter 内 3860-3873 bp + 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 10927678-10929533(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTAATTCACGTGC