转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 15 / 143 下载 TSV

上一页 15 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002965 Chr01 NC_080387.1:48531785-48531796promoter 内 3962-3973 bp - 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 48524866-48531757(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAT
SmilChr05G003496 Chr05 NC_080391.1:46537908-46537919promoter 内 3597-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 46538312-46590024(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGTT
SmilChr05G002849 Chr05 NC_080391.1:33977742-33977753promoter 内 2626-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 33979117-33981217(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGCCAGCTGTA
SmilChr04G001660 Chr04 NC_080390.1:27563744-27563755promoter 内 2469-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 27565276-27583680(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCAC
SmilChr03G004035 Chr03 NC_080389.1:59351693-59351704promoter 内 1908-1919 bp - 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 59347460-59349611(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr01G000193 Chr01 NC_080387.1:3339707-3339718promoter 内 1653-1664 bp - 2337 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 3342055-3344608(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCAC
SmilChr02G001095 Chr02 NC_080388.1:19745320-19745331promoter 内 1468-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 19747853-19752356(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTC
SmilChr04G001030 Chr04 NC_080390.1:14569163-14569174promoter 内 1015-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 14572149-14573445(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGCCAGCTGTA
SmilChr06G002720 Chr06 NC_080392.1:39283632-39283643promoter 内 3839-3850 bp + 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 39280669-39283481(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTC
SmilChr03G001492 Chr03 NC_080389.1:18073467-18073478promoter 内 3446-3457 bp + 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 18074022-18075038(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGCCAGCTGTA
SmilChr02G002081 Chr02 NC_080388.1:37388632-37388643promoter 内 2699-2710 bp + 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 37389934-37392438(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGTC
SmilChr02G000434 Chr02 NC_080388.1:5646416-5646427promoter 内 1001-1012 bp - 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 5649416-5652266(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCGG
SmilChr06G002912 Chr06 NC_080392.1:41959619-41959630promoter 内 799-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 41962821-41965249(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGTT
SmilChr01G003934 Chr01 NC_080387.1:57639299-57639310promoter 内 581-592 bp + 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 57631456-57635890(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCGG
SmilChr02G004873 Chr02 NC_080388.1:70816071-70816082promoter 内 3738-3749 bp - 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 70807608-70815819(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAT
SmilChr03G004047 Chr03 NC_080389.1:59443411-59443422promoter 内 3223-3234 bp + 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 59444189-59446271(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr07G002684 Chr07 NC_080393.1:26250662-26250673promoter 内 2831-2842 bp - 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26248437-26249503(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAT
SmilChr07G002686 Chr07 NC_080393.1:26250662-26250673promoter 内 2682-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26251981-26253459(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAA
SmilChr07G004005 Chr07 NC_080393.1:51110649-51110660promoter 内 1723-1734 bp + 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 51112927-51113563(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr07G002688 Chr07 NC_080393.1:26250662-26250673promoter 内 1088-1099 bp - 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26253575-26254937(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAA
SmilChr03G000720 Chr03 NC_080389.1:8058622-8058633promoter 内 972-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 8061651-8063327(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr07G001205 Chr07 NC_080393.1:9188715-9188726promoter 内 901-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 9183400-9185626(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr04G001611 Chr04 NC_080390.1:26804108-26804119promoter 内 875-886 bp + 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26799365-26800993(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAT
SmilChr05G001852 Chr05 NC_080391.1:18541565-18541576promoter 内 815-826 bp + 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 18544751-18545591(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAT
SmilChr08G003174 Chr08 NC_080394.1:32436098-32436109promoter 内 447-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 32428791-32432555(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr03G001830 Chr03 NC_080389.1:25072696-25072707promoter 内 432-443 bp - 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 25064286-25069138(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG
SmilChr07G002689 Chr07 NC_080393.1:26250662-26250673promoter 内 316-327 bp - 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26254347-26256261(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAA
SmilChr02G002008 Chr02 NC_080388.1:36226242-36226253promoter 内 174-185 bp + 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 36216486-36222426(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGT
SmilChr02G002733 Chr02 NC_080388.1:47251419-47251430promoter 内 2868-2879 bp - 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 47252552-47261659(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAT
SmilChr02G003049 Chr02 NC_080388.1:51285047-51285058promoter 内 1608-1619 bp + 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 51287440-51289156(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr02G000720 Chr02 NC_080388.1:11588600-11588611promoter 内 464-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 11592137-11595069(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr01G005686 Chr01 NC_080387.1:73111680-73111691promoter 内 2678-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 73113003-73117631(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAT
SmilChr06G001658 Chr06 NC_080392.1:18864530-18864541promoter 内 2126-2137 bp + 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 18866405-18868310(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGCCAGCTGTG
SmilChr01G004896 Chr01 NC_080387.1:67032331-67032342promoter 内 1565-1576 bp - 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 67034767-67037714(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAT
SmilChr01G005684 Chr01 NC_080387.1:73111680-73111691promoter 内 1476-1487 bp - 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 73105131-73109166(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr03G002676 Chr03 NC_080389.1:42474738-42474749promoter 内 954-965 bp - 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 42477785-42481904(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCC
SmilChr03G003460 Chr03 NC_080389.1:52975706-52975717promoter 内 596-607 bp - 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 52979111-52984837(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTA
SmilChr05G002638 Chr05 NC_080391.1:29799335-29799346promoter 内 250-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 29791790-29795595(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCCC
SmilChr04G003253 Chr04 NC_080390.1:49283181-49283192promoter 内 95-106 bp + 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 49278281-49279286(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAC
SmilChr04G002396 Chr04 NC_080390.1:38473028-38473039promoter 内 83-94 bp + 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 38476946-38483560(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGCCAGCTGTA
SmilChr05G004200 Chr05 NC_080391.1:55862418-55862429promoter 内 3318-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 55863101-55865906(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr02G004342 Chr02 NC_080388.1:65673968-65673979promoter 内 3088-3099 bp - 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 65674881-65678148(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCAG
SmilChr08G000525 Chr08 NC_080394.1:3826794-3826805promoter 内 2771-2782 bp - 1219 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3823260-3825575(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGCCAGCTGTG
SmilChr05G001623 Chr05 NC_080391.1:15094132-15094143promoter 内 2727-2738 bp - 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 15089812-15092869(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr01G002383 Chr01 NC_080387.1:41052151-41052162promoter 内 2594-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 41053558-41055142(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAT
SmilChr02G004341 Chr02 NC_080388.1:65673968-65673979promoter 内 2422-2433 bp - 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 65669848-65672400(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAC
SmilChr08G000526 Chr08 NC_080394.1:3826794-3826805promoter 内 1970-1981 bp - 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3828825-3831781(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCGG
SmilChr05G000214 Chr05 NC_080391.1:1689015-1689026promoter 内 1857-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1683802-1686882(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAT
SmilChr06G002910 Chr06 NC_080392.1:41948077-41948088promoter 内 1840-1851 bp + 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 41943215-41945927(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAT
SmilChr01G005717 Chr01 NC_080387.1:73371689-73371700promoter 内 1755-1766 bp - 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 73368484-73369454(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAC