转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 15 / 133 下载 TSV

上一页 15 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001627 Chr01 NC_080387.1:30332581-30332595promoter 内 1345-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 30335237-30340440(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGGATAAGGTGCT
SmilChr02G003311 Chr02 NC_080388.1:54357520-54357534promoter 内 1071-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 54360450-54361312(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTCCA
SmilChr02G002914 Chr02 NC_080388.1:49446963-49446977promoter 内 1060-1074 bp + 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 49449904-49450771(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTCCA
SmilChr01G001893 Chr01 NC_080387.1:34047391-34047405promoter 内 1057-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 34050335-34051200(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTCCA
SmilChr01G001624 Chr01 NC_080387.1:30332581-30332595promoter 内 461-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 30328983-30329055(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGCACCTTATCCTAT
SmilChr01G000200 Chr01 NC_080387.1:3437609-3437623promoter 内 348-362 bp - 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 3441262-3444125(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGTTCCTTATCCTCA
SmilChr02G002100 Chr02 NC_080388.1:37678350-37678364promoter 内 311-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 37670534-37674674(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAAGCTTATCCACT
SmilChr02G001290 Chr02 NC_080388.1:23729646-23729660promoter 内 278-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 23724213-23725937(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTGGGATAAGGTGTA
SmilChr01G000404 Chr01 NC_080387.1:8240340-8240354promoter 内 63-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 8235658-8236416(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGGGGATAAGGGTGA
SmilChr01G005886 Chr01 NC_080387.1:74773948-74773962promoter 内 3932-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 74774017-74848538(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATAGATAAGGTAGA
SmilChr01G001192 Chr01 NC_080387.1:24058205-24058219promoter 内 3864-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 24058342-24059483(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACTATCTTATCCCCA
SmilChr01G001345 Chr01 NC_080387.1:26705393-26705407promoter 内 3826-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 26705568-26708801(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAAGAAAAG
SmilChr01G000405 Chr01 NC_080387.1:8240340-8240354promoter 内 3767-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 8237862-8240120(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGGGGATAAGGGTGA
SmilChr01G003730 Chr01 NC_080387.1:55603438-55603452promoter 内 3765-3779 bp + 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 55602590-55603216(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGGACCTTATCCTTA
SmilChr01G001342 Chr01 NC_080387.1:26681723-26681737promoter 内 3741-3755 bp + 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 26681983-26688397(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTGGGATAAGATTTA
SmilChr02G004280 Chr02 NC_080388.1:64991683-64991697promoter 内 3621-3635 bp - 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 64989756-64991317(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGGATAAGAATAA
SmilChr02G003546 Chr02 NC_080388.1:56615906-56615920promoter 内 3523-3537 bp - 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 56612498-56615442(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGATATT
SmilChr01G005304 Chr01 NC_080387.1:70309696-70309710promoter 内 3390-3404 bp + 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 70307271-70309099(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACAAACTTATCCACT
SmilChr01G002605 Chr01 NC_080387.1:44245374-44245388promoter 内 2937-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 44246438-44247302(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATAGATAAGGTGTG
SmilChr01G004218 Chr01 NC_080387.1:60570549-60570563promoter 内 2598-2612 bp + 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 60571952-60575509(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGAATTT
SmilChr02G000195 Chr02 NC_080388.1:2457768-2457782promoter 内 2405-2419 bp - 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2454735-2456186(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGAATTT
SmilChr02G003097 Chr02 NC_080388.1:51843406-51843420promoter 内 2292-2306 bp - 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 51832350-51841711(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTAGATAAGGATTT
SmilChr01G004217 Chr01 NC_080387.1:60570549-60570563promoter 内 2103-2117 bp + 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 60565055-60568665(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAATTCTTATCCAAT
SmilChr03G001359 Chr03 NC_080389.1:15960880-15960894promoter 内 1832-1846 bp + 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15956471-15958725(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CACACCTTATCTATT
SmilChr02G005430 Chr02 NC_080388.1:74737234-74737248promoter 内 1787-1801 bp + 2200 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 74733230-74735034(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAATCTTATCCTAT
SmilChr01G003726 Chr01 NC_080387.1:55578977-55578991promoter 内 1735-1749 bp + 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 55575070-55576725(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACATTCTTATCCTTT
SmilChr02G004509 Chr02 NC_080388.1:67613337-67613351promoter 内 1470-1484 bp + 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 67609877-67610820(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAAGCTTATCCACT
SmilChr01G002967 Chr01 NC_080387.1:48566209-48566223promoter 内 1347-1361 bp + 2640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 48555600-48563569(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAATTCTTATCCATT
SmilChr01G000248 Chr01 NC_080387.1:4673382-4673396promoter 内 1298-1312 bp + 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 4670000-4670693(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCTTTCTTATCCACA
SmilChr01G000441 Chr01 NC_080387.1:8922957-8922971promoter 内 1194-1208 bp + 2793 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 8925764-8930684(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCTGGATAAGATCGG
SmilChr02G001149 Chr02 NC_080388.1:20916060-20916074promoter 内 1192-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 20918869-20924304(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGTTTTT
SmilChr02G003547 Chr02 NC_080388.1:56615906-56615920promoter 内 1070-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 56618837-56620398(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATATCTTATCCTAA
SmilChr02G003437 Chr02 NC_080388.1:55602052-55602066promoter 内 1051-1065 bp - 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 55605002-55613731(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAATTCTTATCCAAT
SmilChr02G005224 Chr02 NC_080388.1:73450983-73450997promoter 内 954-968 bp + 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 73454030-73459418(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGCTTTT
SmilChr02G000512 Chr02 NC_080388.1:7082552-7082566promoter 内 825-839 bp + 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 7076226-7079390(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTAGCCTTATCTACA
SmilChr01G002565 Chr01 NC_080387.1:43759175-43759189promoter 内 786-800 bp - 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 43762390-43764524(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGTCTTATCCATT
SmilChr02G001333 Chr02 NC_080388.1:24781900-24781914promoter 内 503-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 24785398-24787724(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGCCTTATCTATA
SmilChr01G006022 Chr01 NC_080387.1:75809395-75809409promoter 内 284-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 75800542-75805692(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTAGATAAGGTGAA
SmilChr02G002812 Chr02 NC_080388.1:48174556-48174570promoter 内 192-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 48178365-48180165(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTCCA
SmilChr02G000977 Chr02 NC_080388.1:17066355-17066369promoter 内 52-66 bp - 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 17070304-17071308(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGCACCTTATCCTTT
SmilChr02G003250 Chr02 NC_080388.1:53773852-53773866promoter 内 2077-2091 bp - 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 53775776-53778754(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CAAGCCTTATCTAAT
SmilChr02G000774 Chr02 NC_080388.1:12716750-12716764promoter 内 3985-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 12714141-12716748(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGCTTTG
SmilChr03G001222 Chr03 NC_080389.1:14082872-14082886promoter 内 3748-3762 bp + 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 14078360-14082633(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATCATCTTATCCTTT
SmilChr02G004884 Chr02 NC_080388.1:70926111-70926125promoter 内 2300-2314 bp - 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 70927812-70928715(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTTTCTTATCCTCA
SmilChr03G000824 Chr03 NC_080389.1:9436834-9436848promoter 内 1913-1927 bp - 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 9427890-9434760(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAGGATAAGATATA
SmilChr02G001017 Chr02 NC_080388.1:17942891-17942905promoter 内 1381-1395 bp - 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 17939512-17940285(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTAGATAAGGGTGT
SmilChr01G003738 Chr01 NC_080387.1:55706992-55707006promoter 内 1061-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 55709932-55712763(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACAAGCTTATCCATA
SmilChr03G001691 Chr03 NC_080389.1:22425789-22425803promoter 内 857-871 bp - 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 22428933-22429433(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCATCCTTATCTTTA
SmilChr01G000073 Chr01 NC_080387.1:1266047-1266061promoter 内 661-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 1269387-1271849(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AACGCCTTATCCAAA
SmilChr02G005239 Chr02 NC_080388.1:73567663-73567677promoter 内 3824-3838 bp - 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 73567840-73571789(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGATCTTATCCATT