转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 16 / 136 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003465 Chr01 NC_080387.1:53215561-53215571promoter 内 1709-1719 bp + 2282 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 53217853-53218458(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr07G000919 Chr07 NC_080393.1:6559507-6559517promoter 内 1625-1635 bp - 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 6561883-6564304(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr06G000088 Chr06 NC_080392.1:630898-630908promoter 内 1506-1516 bp - 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 633393-635237(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr01G005577 Chr01 NC_080387.1:72501226-72501236promoter 内 1324-1334 bp + 2667 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 72503903-72505447(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr08G004188 Chr08 NC_080394.1:51303351-51303361promoter 内 1245-1255 bp + 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 51299379-51300605(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr07G001685 Chr07 NC_080393.1:14284569-14284579promoter 内 1121-1131 bp + 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 14281616-14281699(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr08G000946 Chr08 NC_080394.1:7053862-7053872promoter 内 967-977 bp + 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 7056896-7059686(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr02G004564 Chr02 NC_080388.1:68159625-68159635promoter 内 849-859 bp + 3142 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 68151567-68156483(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr07G004493 Chr07 NC_080393.1:57534908-57534918promoter 内 811-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 57538098-57540899(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr08G000306 Chr08 NC_080394.1:2136888-2136898promoter 内 742-752 bp + 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 2128594-2133639(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr01G002943 Chr01 NC_080387.1:48213854-48213864promoter 内 646-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 48217209-48218367(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr01G000558 Chr01 NC_080387.1:11630522-11630532promoter 内 290-300 bp + 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 11625613-11626821(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr01G005382 Chr01 NC_080387.1:71066676-71066686promoter 内 116-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 71056389-71062801(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr07G001687 Chr07 NC_080393.1:14284569-14284579promoter 内 113-123 bp + 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 14288457-14289437(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr07G002511 Chr07 NC_080393.1:23805716-23805726promoter 内 3880-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 23805837-23805908(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGTC
SmilChr01G004313 Chr01 NC_080387.1:61303661-61303671promoter 内 3549-3559 bp - 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 61300692-61303219(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr01G003137 Chr01 NC_080387.1:50161851-50161861promoter 内 3435-3445 bp + 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50162417-50164538(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr04G002151 Chr04 NC_080390.1:34558458-34558468promoter 内 3211-3221 bp - 780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34555768-34557678(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr07G003794 Chr07 NC_080393.1:46702754-46702764promoter 内 3194-3204 bp - 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46703561-46707329(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCC
SmilChr06G000546 Chr06 NC_080392.1:4561244-4561254promoter 内 3146-3156 bp + 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 4562099-4564223(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr07G002954 Chr07 NC_080393.1:29986849-29986859promoter 内 3116-3126 bp - 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 29983060-29985974(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr07G002972 Chr07 NC_080393.1:30273942-30273952promoter 内 3115-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 30270149-30273066(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr07G002741 Chr07 NC_080393.1:26937194-26937204promoter 内 3054-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 26934749-26936257(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr07G003574 Chr07 NC_080393.1:41729496-41729506promoter 内 3042-3052 bp + 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 41730455-41731824(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGTC
SmilChr08G004843 Chr08 NC_080394.1:57690189-57690199promoter 内 3040-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 57691150-57694047(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGC
SmilChr08G000004 Chr08 NC_080394.1:64329-64339promoter 内 2900-2910 bp + 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 65430-69058(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr02G002487 Chr02 NC_080388.1:43300680-43300690promoter 内 2650-2660 bp + 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 43295034-43299339(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr08G000879 Chr08 NC_080394.1:6500845-6500855promoter 内 2600-2610 bp - 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6498181-6499454(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr03G003936 Chr03 NC_080389.1:58425326-58425336promoter 内 2291-2301 bp - 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 58422533-58423626(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr01G003184 Chr01 NC_080387.1:50604699-50604709promoter 内 2135-2145 bp - 1856 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50606565-50607204(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr03G002896 Chr03 NC_080389.1:45690985-45690995promoter 内 2088-2098 bp - 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 45692898-45694761(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGC
SmilChr06G000206 Chr06 NC_080392.1:1405412-1405422promoter 内 2039-2049 bp - 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 1401045-1403460(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGTC
SmilChr05G001707 Chr05 NC_080391.1:16301294-16301304promoter 内 2022-2032 bp - 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16303273-16303841(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr06G002094 Chr06 NC_080392.1:27866401-27866411promoter 内 1922-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 27862462-27864332(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr02G000040 Chr02 NC_080388.1:489319-489329promoter 内 1901-1911 bp + 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 483264-487229(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr03G002978 Chr03 NC_080389.1:46617631-46617641promoter 内 1813-1823 bp - 2178 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46619819-46623735(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr03G000591 Chr03 NC_080389.1:6575955-6575965promoter 内 1779-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6572757-6573743(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr07G000746 Chr07 NC_080393.1:5254365-5254375promoter 内 1725-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 5249752-5252099(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr01G005320 Chr01 NC_080387.1:70430794-70430804promoter 内 1712-1722 bp + 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 70424670-70428515(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCC
SmilChr01G005317 Chr01 NC_080387.1:70430794-70430804promoter 内 1706-1716 bp + 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 70412045-70428509(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCC
SmilChr02G002188 Chr02 NC_080388.1:39080141-39080151promoter 内 1612-1622 bp + 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 39076725-39077762(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr02G005081 Chr02 NC_080388.1:72436693-72436703promoter 内 1567-1577 bp - 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 72432735-72434269(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr07G001163 Chr07 NC_080393.1:8713041-8713051promoter 内 1545-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 8707822-8710595(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr02G004087 Chr02 NC_080388.1:63146497-63146507promoter 内 1165-1175 bp - 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 63149333-63150023(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr02G003102 Chr02 NC_080388.1:51956784-51956794promoter 内 1100-1110 bp + 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51951341-51953893(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr01G004455 Chr01 NC_080387.1:62674757-62674767promoter 内 1090-1100 bp - 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 62668522-62671856(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr08G000679 Chr08 NC_080394.1:5056816-5056826promoter 内 1063-1073 bp - 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 5052606-5053888(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGTC
SmilChr02G000137 Chr02 NC_080388.1:1857175-1857185promoter 内 974-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 1860202-1861492(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr06G002477 Chr06 NC_080392.1:35607253-35607263promoter 内 943-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35600335-35604205(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr07G001844 Chr07 NC_080393.1:15933074-15933084promoter 内 939-949 bp + 3052 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 15926847-15930022(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC