转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 16 / 142 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005048 Chr02 NC_080388.1:72215365-72215379promoter 内 652-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 72218714-72221703(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACCTCCCT
SmilChr02G004012 Chr02 NC_080388.1:62438578-62438592promoter 内 3854-3868 bp - 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 62438104-62438445(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCAACTACCACCTC
SmilChr04G002610 Chr04 NC_080390.1:41498343-41498357promoter 内 3479-3493 bp - 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 41498865-41499871(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGAGAGGTAGGTGTG
SmilChr04G002609 Chr04 NC_080390.1:41498343-41498357promoter 内 2126-2140 bp - 1861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 41495415-41496482(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCTCTCC
SmilChr06G002483 Chr06 NC_080392.1:35678724-35678738promoter 内 1952-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 35674146-35676689(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCAACCACCACCAA
SmilChr08G000894 Chr08 NC_080394.1:6635692-6635706promoter 内 1777-1791 bp + 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 6630555-6633482(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGGAGGTAGGTGTG
SmilChr05G000792 Chr05 NC_080391.1:6212614-6212628promoter 内 502-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 6216113-6218034(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCTCTAA
SmilChr06G000654 Chr06 NC_080392.1:5764044-5764058promoter 内 449-463 bp + 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 5759192-5760506(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGGAGGTAGGTGTG
SmilChr01G001362 Chr01 NC_080387.1:26973168-26973182promoter 内 88-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 26968437-26969269(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCCCTCC
SmilChr04G002928 Chr04 NC_080390.1:45545055-45545069promoter 内 3523-3537 bp - 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 45545533-45546438(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGTTGGTAGGTGTG
SmilChr03G000084 Chr03 NC_080389.1:974903-974917promoter 内 3438-3452 bp + 549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 973231-974354(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTGCA
SmilChr03G000162 Chr03 NC_080389.1:1784398-1784412promoter 内 3412-3426 bp - 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1784987-1786606(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTGCA
SmilChr06G000992 Chr06 NC_080392.1:9796247-9796261promoter 内 3233-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 9797015-9799451(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGATGGTAGGTGGT
SmilChr02G004902 Chr02 NC_080388.1:71024289-71024303promoter 内 3054-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 71021125-71023356(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTGCA
SmilChr01G002789 Chr01 NC_080387.1:46379800-46379814promoter 内 2998-3012 bp + 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 46363649-46378811(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTAGTTGTG
SmilChr03G000091 Chr03 NC_080389.1:1030331-1030345promoter 内 2883-2897 bp + 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1027224-1029227(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTGCA
SmilChr03G003278 Chr03 NC_080389.1:50778231-50778245promoter 内 2674-2688 bp - 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 50776229-50776918(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCTCTAT
SmilChr05G003888 Chr05 NC_080391.1:52627274-52627288promoter 内 2449-2463 bp + 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 52621163-52625736(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GATCAGGTAGGTGGG
SmilChr05G003857 Chr05 NC_080391.1:52115661-52115675promoter 内 2446-2460 bp + 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 52109582-52114120(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GATCAGGTAGGTGGG
SmilChr01G002081 Chr01 NC_080387.1:36754450-36754464promoter 内 2082-2096 bp + 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 36756369-36761002(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCATTCA
SmilChr06G000655 Chr06 NC_080392.1:5764044-5764058promoter 内 1999-2013 bp + 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 5760720-5762056(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGGAGGTAGGTGTG
SmilChr02G002343 Chr02 NC_080388.1:41166708-41166722promoter 内 1823-1837 bp - 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 41160657-41164544(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GACACCCACCACCAC
SmilChr03G004581 Chr03 NC_080389.1:63674333-63674347promoter 内 1471-1485 bp + 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 63676863-63680716(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGCAACCACCACCAC
SmilChr03G004181 Chr03 NC_080389.1:60531307-60531321promoter 内 848-862 bp - 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 60534460-60538815(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGGAGGTAGGTGAG
SmilChr08G004118 Chr08 NC_080394.1:50029889-50029903promoter 内 982-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 5 50032908-50036715(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCAACAACCACCAT
SmilChr08G001910 Chr08 NC_080394.1:16622069-16622083promoter 内 3382-3396 bp - 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 16622688-16626133(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTTGTTGGA
SmilChr01G001373 Chr01 NC_080387.1:27055200-27055214promoter 内 708-722 bp + 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 27058493-27061257(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACAACAACCACCAC
SmilChr06G001030 Chr06 NC_080392.1:10239761-10239775promoter 内 3117-3131 bp + 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 10237860-10238891(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G004224 Chr01 NC_080387.1:60605747-60605761promoter 内 2909-2923 bp - 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 60602872-60604669(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr04G000454 Chr04 NC_080390.1:4817526-4817540promoter 内 2897-2911 bp + 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 4818630-4819599(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr02G005288 Chr02 NC_080388.1:73893531-73893545promoter 内 2709-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 73894823-73898453(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G000834 Chr08 NC_080394.1:6176215-6176229promoter 内 2686-2700 bp + 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 6172508-6174914(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G000072 Chr05 NC_080391.1:365051-365065promoter 内 2450-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 362702-363514(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G000865 Chr05 NC_080391.1:6859873-6859887promoter 内 1998-2012 bp + 1989 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 6861876-6864054(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr04G002013 Chr04 NC_080390.1:32676355-32676369promoter 内 1578-1592 bp + 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 32671486-32673946(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGGATGGTAGGTAGG
SmilChr04G002014 Chr04 NC_080390.1:32676355-32676369promoter 内 1504-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 32672832-32673872(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGGATGGTAGGTAGG
SmilChr01G001372 Chr01 NC_080387.1:27055200-27055214promoter 内 1468-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 27057733-27059408(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACAACAACCACCAC
SmilChr05G000864 Chr05 NC_080391.1:6859873-6859887promoter 内 731-745 bp + 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 6851903-6856617(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr03G004205 Chr03 NC_080389.1:60663638-60663652promoter 内 19-33 bp + 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 60653795-60659670(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G004670 Chr08 NC_080394.1:56199221-56199235promoter 内 3933-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 56195573-56199167(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCTACAC
SmilChr08G000623 Chr08 NC_080394.1:4654031-4654045promoter 内 3921-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 4654111-4657233(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G005417 Chr01 NC_080387.1:71382326-71382340promoter 内 3827-3841 bp + 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 71382500-71388769(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G001141 Chr05 NC_080391.1:9534962-9534976promoter 内 3754-3768 bp + 233 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9532331-9534729(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G000333 Chr08 NC_080394.1:2330444-2330458promoter 内 3688-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 2328319-2330145(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G001964 Chr01 NC_080387.1:34971599-34971613promoter 内 3685-3699 bp - 302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 34969412-34971297(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
SmilChr03G003437 Chr03 NC_080389.1:52731674-52731688promoter 内 3661-3675 bp + 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 52729843-52731348(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G000696 Chr08 NC_080394.1:5173992-5174006promoter 内 3594-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 5168690-5173599(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G000402 Chr05 NC_080391.1:3038334-3038348promoter 内 3555-3569 bp - 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 3034937-3037902(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACACT
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SmilChr03G004308 Chr03 NC_080389.1:61426566-61426580promoter 内 3344-3358 bp - 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 61427223-61428110(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGAGTTAGGTGGG