转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 16 / 144 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002442 Chr01 NC_080387.1:41997070-41997082promoter 内 1400-1412 bp - 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 41999671-42000568(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGAGTTGACTTTG
SmilChr02G003261 Chr02 NC_080388.1:53898015-53898027promoter 内 1282-1294 bp - 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 53900734-53908580(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTTTC
SmilChr01G005466 Chr01 NC_080387.1:71652064-71652076promoter 内 1273-1285 bp + 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 71654792-71658420(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACAGC
SmilChr01G001559 Chr01 NC_080387.1:29619713-29619725promoter 内 1207-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29622507-29624733(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGCGTTGACTCTG
SmilChr02G002055 Chr02 NC_080388.1:36942856-36942868promoter 内 1158-1170 bp - 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 36945699-36946691(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCTTTGACTTTG
SmilChr03G002743 Chr03 NC_080389.1:43588142-43588154promoter 内 1063-1075 bp + 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 43591080-43592390(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAGAC
SmilChr03G004294 Chr03 NC_080389.1:61344098-61344110promoter 内 986-998 bp + 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 61347113-61350884(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACGAT
SmilChr01G004999 Chr01 NC_080387.1:68030411-68030423promoter 内 945-957 bp - 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68025025-68027367(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAGAC
SmilChr03G000702 Chr03 NC_080389.1:7836865-7836877promoter 内 635-647 bp + 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 7840231-7841332(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAGAC
SmilChr01G005188 Chr01 NC_080387.1:69585756-69585768promoter 内 555-567 bp + 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 69589202-69590147(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAGAC
SmilChr03G001782 Chr03 NC_080389.1:24333427-24333439promoter 内 507-519 bp - 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 24336921-24337700(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTTTC
SmilChr02G000763 Chr02 NC_080388.1:12437273-12437285promoter 内 440-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12431552-12433724(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGCGTTGACTCTG
SmilChr04G000684 Chr04 NC_080390.1:7984174-7984186promoter 内 364-376 bp + 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 7979145-7980549(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGAGTTGACTTTG
SmilChr03G000479 Chr03 NC_080389.1:5091731-5091743promoter 内 209-221 bp + 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 5085337-5087951(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCTTTGACTTTG
SmilChr01G002178 Chr01 NC_080387.1:37868213-37868225promoter 内 162-174 bp + 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37862410-37864386(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGCGTTGACTCTG
SmilChr01G003155 Chr01 NC_080387.1:50334699-50334711promoter 内 130-142 bp - 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50338570-50344717(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCTTTGACTTTT
SmilChr01G001876 Chr01 NC_080387.1:33771702-33771714promoter 内 3149-3161 bp + 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 33772554-33773888(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACACT
SmilChr03G001341 Chr03 NC_080389.1:15654897-15654909promoter 内 3117-3129 bp - 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 15649684-15654025(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGCT
SmilChr01G005296 Chr01 NC_080387.1:70273483-70273495promoter 内 3086-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 70274398-70275173(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGAGGTCAACGGG
SmilChr02G002037 Chr02 NC_080388.1:36665086-36665098promoter 内 3039-3051 bp + 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 36666048-36673497(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACACG
SmilChr01G005272 Chr01 NC_080387.1:70157740-70157752promoter 内 3033-3045 bp + 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 70158708-70159433(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGAGGTCAACGGG
SmilChr02G002025 Chr02 NC_080388.1:36477540-36477552promoter 内 2855-2867 bp - 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 36467687-36476406(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACACG
SmilChr03G002615 Chr03 NC_080389.1:41555563-41555575promoter 内 2268-2280 bp - 1721 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 41551723-41553842(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGGA
SmilChr03G004192 Chr03 NC_080389.1:60592172-60592184promoter 内 2156-2168 bp + 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 60594017-60600197(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGCT
SmilChr02G003481 Chr02 NC_080388.1:56089397-56089409promoter 内 2061-2073 bp + 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 56091337-56093015(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACAGT
SmilChr02G004539 Chr02 NC_080388.1:67962513-67962525promoter 内 2009-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 67964505-67965669(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGGGTTGACTTCT
SmilChr01G003201 Chr01 NC_080387.1:50785475-50785487promoter 内 1825-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 50787651-50788924(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGGA
SmilChr01G003893 Chr01 NC_080387.1:57222977-57222989promoter 内 1155-1167 bp - 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 57225823-57234347(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCGTTGACCTCC
SmilChr03G004162 Chr03 NC_080389.1:60389118-60389130promoter 内 1036-1048 bp + 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 60392083-60393964(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGCT
SmilChr01G002848 Chr01 NC_080387.1:47050224-47050236promoter 内 998-1010 bp + 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 47053227-47058908(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACGAA
SmilChr01G005273 Chr01 NC_080387.1:70157740-70157752promoter 内 990-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 70160751-70163867(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGAGGTCAACGGG
SmilChr01G004659 Chr01 NC_080387.1:64682179-64682191promoter 内 580-592 bp - 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 64676701-64678770(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACACG
SmilChr02G004153 Chr02 NC_080388.1:63839077-63839089promoter 内 3680-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 63839398-63842477(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACTATA
SmilChr03G003806 Chr03 NC_080389.1:57133776-57133788promoter 内 3320-3332 bp + 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57130065-57133107(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCTTTGACTTTT
SmilChr01G000566 Chr01 NC_080387.1:11708823-11708835promoter 内 3297-3309 bp + 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11706217-11708131(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCTTTGACTTTT
SmilChr02G004537 Chr02 NC_080388.1:67962513-67962525promoter 内 3269-3281 bp - 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 67957432-67961793(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACCCC
SmilChr01G001875 Chr01 NC_080387.1:33771702-33771714promoter 内 3165-3177 bp + 824 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33767560-33770878(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGTGTTGACTTTG
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SmilChr03G001052 Chr03 NC_080389.1:12239589-12239601promoter 内 2201-2213 bp + 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 12241389-12243025(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGGA
SmilChr04G000330 Chr04 NC_080390.1:3041724-3041736promoter 内 2031-2043 bp + 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3036384-3039766(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCTTTGACTTTT
SmilChr02G005221 Chr02 NC_080388.1:73424732-73424744promoter 内 1820-1832 bp - 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73426913-73431663(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCTTTGACTTTT
SmilChr01G000812 Chr01 NC_080387.1:17542588-17542600promoter 内 1530-1542 bp - 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17538360-17540129(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATAAGTCAACGAT
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SmilChr03G000427 Chr03 NC_080389.1:4649121-4649133promoter 内 506-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4652616-4653626(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCTTTGACTTTT
SmilChr03G001394 Chr03 NC_080389.1:16535872-16535884promoter 内 300-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 16539573-16545270(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGGA
SmilChr01G005297 Chr01 NC_080387.1:70273483-70273495promoter 内 295-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 70277189-70277889(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGAGGTCAACGGG
SmilChr01G003037 Chr01 NC_080387.1:49380154-49380166promoter 内 136-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49375882-49376301(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACACT
SmilChr04G001450 Chr04 NC_080390.1:23827147-23827159promoter 内 2325-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 9 23828823-23830991(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACTTTGACTTTG