转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 17 / 134 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003116 Chr02 NC_080388.1:52155876-52155890promoter 内 3607-3621 bp + 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 52156270-52163232(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAGTGATGATTAT
SmilChr02G003110 Chr02 NC_080388.1:52078229-52078243promoter 内 3551-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 52075593-52077793(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATCGTAATGATTAA
SmilChr01G004457 Chr01 NC_080387.1:62691217-62691231promoter 内 3433-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 62691785-62695137(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGACAATGATTAT
SmilChr01G003420 Chr01 NC_080387.1:52840241-52840255promoter 内 3060-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 52841182-52843398(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGCGATAATGATTAC
SmilChr03G003061 Chr03 NC_080389.1:47556612-47556626promoter 内 2541-2555 bp + 1446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 47558072-47559707(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAGATAATGATTAG
SmilChr02G003682 Chr02 NC_080388.1:58186588-58186602promoter 内 2236-2250 bp - 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 58180474-58184837(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGATGTGATGATTAT
SmilChr01G005725 Chr01 NC_080387.1:73401625-73401639promoter 内 1848-1862 bp - 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 73403778-73406849(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCATGTTT
SmilChr01G005724 Chr01 NC_080387.1:73401625-73401639promoter 内 1429-1443 bp - 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 73398756-73399067(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACATGATGATTAC
SmilChr02G001653 Chr02 NC_080388.1:30691170-30691184promoter 内 1276-1290 bp - 2711 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 30686091-30688459(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGGCAATGATTGG
SmilChr01G005508 Chr01 NC_080387.1:71936313-71936327promoter 内 777-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 71939537-71944581(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTCATT
SmilChr02G004895 Chr02 NC_080388.1:70967933-70967947promoter 内 442-456 bp + 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 70971492-70973380(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGTAATGATTGC
SmilChr02G001174 Chr02 NC_080388.1:21546575-21546589promoter 内 278-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 21550298-21552936(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACATCA
SmilChr01G003732 Chr01 NC_080387.1:55613898-55613912promoter 内 263-277 bp - 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 55607009-55610174(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGCTGTAATGATGAT
SmilChr01G005723 Chr01 NC_080387.1:73401625-73401639promoter 内 204-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 73393875-73397842(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACATGATGATTAC
SmilChr01G002692 Chr01 NC_080387.1:45163555-45163569promoter 内 3792-3806 bp + 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 6 45162758-45163360(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTACCAAT
SmilChr01G002652 Chr01 NC_080387.1:44839097-44839111promoter 内 2255-2269 bp + 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 44837282-44837365(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATGCTC
SmilChr03G001879 Chr03 NC_080389.1:26082732-26082746promoter 内 3786-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 26080846-26082531(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACTCCA
SmilChr01G001840 Chr01 NC_080387.1:33339749-33339763promoter 内 3493-3507 bp - 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 33337817-33339255(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAGTGTAATGATGAA
SmilChr01G004793 Chr01 NC_080387.1:66165531-66165545promoter 内 2874-2888 bp + 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 66166658-66169694(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTAA
SmilChr02G003641 Chr02 NC_080388.1:57770570-57770584promoter 内 2046-2060 bp + 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 57764398-57768629(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAGTATT
SmilChr02G004723 Chr02 NC_080388.1:69483797-69483811promoter 内 1732-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 69476382-69481542(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATGTTT
SmilChr03G002994 Chr03 NC_080389.1:46767507-46767521promoter 内 1651-1665 bp + 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 46760821-46765171(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATTTTG
SmilChr02G002068 Chr02 NC_080388.1:37223785-37223799promoter 内 1124-1138 bp + 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 37226662-37228325(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATGGG
SmilChr03G000730 Chr03 NC_080389.1:8218137-8218151promoter 内 904-918 bp - 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 8212387-8215054(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGACGTAATGATGAG
SmilChr01G000878 Chr01 NC_080387.1:18664285-18664299promoter 内 549-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 18659187-18660847(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTACTTCA
SmilChr01G002708 Chr01 NC_080387.1:45346656-45346670promoter 内 3789-3803 bp + 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45346868-45348686(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAGATAATGATTAT
SmilChr01G005712 Chr01 NC_080387.1:73336788-73336802promoter 内 3289-3303 bp - 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 73337500-73338856(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACTATT
SmilChr03G000731 Chr03 NC_080389.1:8218137-8218151promoter 内 2934-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 8215976-8217084(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGACGTAATGATGAG
SmilChr01G004788 Chr01 NC_080387.1:66106280-66106294promoter 内 2874-2888 bp + 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 66107407-66110445(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTAA
SmilChr02G003856 Chr02 NC_080388.1:60364748-60364762promoter 内 2546-2560 bp + 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 60366203-60366763(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGATAATGATGAT
SmilChr02G005541 Chr02 NC_080388.1:75422145-75422159promoter 内 2220-2234 bp + 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 75423926-75428294(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGCTAATGATGAA
SmilChr02G004767 Chr02 NC_080388.1:69845540-69845554promoter 内 1762-1776 bp - 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 69847779-69848270(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATATTA
SmilChr01G004789 Chr01 NC_080387.1:66113250-66113264promoter 内 1604-1618 bp + 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 66115647-66117585(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTAA
SmilChr01G002953 Chr01 NC_080387.1:48399670-48399684promoter 内 1538-1552 bp + 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 48402133-48404640(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGATGATGATTAT
SmilChr01G003267 Chr01 NC_080387.1:51344118-51344132promoter 内 1301-1315 bp - 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 51346818-51353740(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATCTTA
SmilChr03G003002 Chr03 NC_080389.1:46867763-46867777promoter 内 1230-1244 bp - 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 46870534-46874631(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATTCTT
SmilChr01G001491 Chr01 NC_080387.1:28718197-28718211promoter 内 1159-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 28721039-28721521(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCGTC
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SmilChr01G004785 Chr01 NC_080387.1:66058998-66059012promoter 内 688-702 bp + 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 66062311-66064074(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTAA
SmilChr02G000339 Chr02 NC_080388.1:4353910-4353924promoter 内 291-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 4347520-4350214(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAAATAATGATTAG
SmilChr01G002706 Chr01 NC_080387.1:45346656-45346670promoter 内 198-212 bp + 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45324190-45342867(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCTAT
SmilChr01G003310 Chr01 NC_080387.1:51789314-51789328promoter 内 3919-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 51785927-51789246(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTATTATA
SmilChr01G002844 Chr01 NC_080387.1:47013630-47013644promoter 内 3887-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 47012250-47013530(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATAATT
SmilChr03G001389 Chr03 NC_080389.1:16470916-16470930promoter 内 3510-3524 bp + 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 16471407-16494841(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTAA
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SmilChr03G000844 Chr03 NC_080389.1:9633618-9633632promoter 内 2987-3001 bp - 1000 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 9631854-9632618(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAAATAATGATTAC
SmilChr01G000698 Chr01 NC_080387.1:15672885-15672899promoter 内 2945-2959 bp + 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15673941-15675703(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGGAAATGATTAC
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SmilChr02G004602 Chr02 NC_080388.1:68539687-68539701promoter 内 2621-2635 bp + 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68537309-68538321(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTATTCAT
SmilChr01G003841 Chr01 NC_080387.1:56749657-56749671promoter 内 2566-2580 bp + 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56746216-56748236(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTATCTTC