转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 17 / 138 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000982 Chr01 NC_080387.1:20791735-20791747promoter 内 3698-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 20792038-20795706(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGGTCAACGAA
SmilChr01G001991 Chr01 NC_080387.1:35319471-35319483promoter 内 3313-3325 bp + 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 35320159-35325141(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACTTGT
SmilChr01G002734 Chr01 NC_080387.1:45691837-45691849promoter 内 3008-3020 bp - 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 45692830-45692988(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACGGC
SmilChr01G001989 Chr01 NC_080387.1:35319471-35319483promoter 内 2806-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 35312795-35318288(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACGTG
SmilChr02G000457 Chr02 NC_080388.1:6100081-6100093promoter 内 2803-2815 bp - 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 6101279-6102811(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGGTCAACGTG
SmilChr01G002046 Chr01 NC_080387.1:36220863-36220875promoter 内 2136-2148 bp - 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 36222728-36223768(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACGTC
SmilChr01G003137 Chr01 NC_080387.1:50160545-50160557promoter 内 2129-2141 bp + 1860 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 50162417-50164538(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCCAC
SmilChr01G000564 Chr01 NC_080387.1:11680494-11680506promoter 内 2126-2138 bp + 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 11677945-11678631(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTGGTCAACGTG
SmilChr03G000532 Chr03 NC_080389.1:5735117-5735129promoter 内 2093-2105 bp + 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 5729640-5733221(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAGGC
SmilChr03G000269 Chr03 NC_080389.1:3106810-3106822promoter 内 2010-2022 bp + 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3100105-3104831(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACGTG
SmilChr03G003436 Chr03 NC_080389.1:52715622-52715634promoter 内 2009-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 52717614-52726291(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCAGTCAACGAT
SmilChr03G004093 Chr03 NC_080389.1:59802276-59802288promoter 内 1993-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 59804284-59874437(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGGTCAACGTG
SmilChr02G002781 Chr02 NC_080388.1:47901470-47901482promoter 内 1983-1995 bp + 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 47903488-47904271(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACTTGT
SmilChr02G000456 Chr02 NC_080388.1:6100081-6100093promoter 内 1922-1934 bp - 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 6093714-6098014(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCTTA
SmilChr01G002735 Chr01 NC_080387.1:45691837-45691849promoter 内 1909-1921 bp - 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 45693929-45694047(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACGGC
SmilChr01G002527 Chr01 NC_080387.1:43285761-43285773promoter 内 1876-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 43278640-43283648(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCTTTGACTATT
SmilChr01G002029 Chr01 NC_080387.1:35867640-35867652promoter 内 1856-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 35864563-35865507(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACGTC
SmilChr01G003280 Chr01 NC_080387.1:51489821-51489833promoter 内 1527-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 51492295-51495595(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGCG
SmilChr01G003531 Chr01 NC_080387.1:53936181-53936193promoter 内 1516-1528 bp + 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 53931251-53933708(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAAGTCAACGTG
SmilChr02G003145 Chr02 NC_080388.1:52484807-52484819promoter 内 1501-1513 bp + 2488 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 52478208-52482319(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGGTCAACGGG
SmilChr03G000270 Chr03 NC_080389.1:3106810-3106822promoter 内 1352-1364 bp + 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3109459-3112277(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACTTGT
SmilChr02G000910 Chr02 NC_080388.1:15747409-15747421promoter 内 1289-1301 bp - 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 15743999-15744709(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTTTA
SmilChr03G003786 Chr03 NC_080389.1:56965252-56965264promoter 内 1205-1217 bp + 2784 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56968048-56969315(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACTTTT
SmilChr03G003010 Chr03 NC_080389.1:46965231-46965243promoter 内 1093-1105 bp - 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 46940075-46962335(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACTTTT
SmilChr03G000219 Chr03 NC_080389.1:2529616-2529628promoter 内 729-741 bp + 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 2532888-2534832(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACTTTT
SmilChr01G004774 Chr01 NC_080387.1:65932235-65932247promoter 内 510-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 65926426-65928756(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAGGTCAACGTG
SmilChr02G002193 Chr02 NC_080388.1:39157655-39157667promoter 内 44-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 39152112-39153710(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTGAG
SmilChr02G004565 Chr02 NC_080388.1:68169822-68169834promoter 内 1956-1968 bp - 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 6 68171867-68762800(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACCCC
SmilChr03G003777 Chr03 NC_080389.1:56921808-56921820promoter 内 3185-3197 bp - 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 56922624-56925507(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCAGTCAACGAT
SmilChr02G002923 Chr02 NC_080388.1:49632033-49632045promoter 内 2414-2426 bp - 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 49629524-49630458(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGGTTGACTTTG
SmilChr01G002812 Chr01 NC_080387.1:46668207-46668219promoter 内 1013-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 46663315-46665231(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAAGTCAACGAT
SmilChr02G003009 Chr02 NC_080388.1:50725859-50725871promoter 内 125-137 bp + 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 50718824-50721995(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCCAGTCAACCGC
SmilChr02G003941 Chr02 NC_080388.1:61555938-61555950promoter 内 3547-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 61556392-61633213(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCTCT
SmilChr02G001674 Chr02 NC_080388.1:30999032-30999044promoter 内 3102-3114 bp + 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 30995524-30998145(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACCGC
SmilChr03G003775 Chr03 NC_080389.1:56921808-56921820promoter 内 2821-2833 bp - 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 56917900-56920640(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTGAT
SmilChr03G000894 Chr03 NC_080389.1:10246834-10246846promoter 内 2814-2826 bp + 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 10242286-10245659(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACCCC
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