转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 2 / 148 下载 TSV

上一页 2 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003152 Chr04 NC_080390.1:48122594-48122607promoter 内 592-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 48126003-48134453(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTCCCC
SmilChr06G002444 Chr06 NC_080392.1:35165595-35165608promoter 内 3826-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 35165770-35179223(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCCCA
SmilChr01G002815 Chr01 NC_080387.1:46711063-46711076promoter 内 3789-3802 bp + 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 46705765-46710864(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACACTCC
SmilChr02G004925 Chr02 NC_080388.1:71267271-71267284promoter 内 3701-3714 bp - 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 71267571-71269699(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACCCC
SmilChr02G005265 Chr02 NC_080388.1:73745900-73745913promoter 内 2865-2878 bp + 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 73744097-73744777(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCTCCT
SmilChr06G002443 Chr06 NC_080392.1:35165595-35165608promoter 内 2862-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 35162960-35164469(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCGACACGTGG
SmilChr08G001568 Chr08 NC_080394.1:12892447-12892460promoter 内 1885-1898 bp + 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 12894563-12895170(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr04G000736 Chr04 NC_080390.1:8827040-8827053promoter 内 1593-1606 bp - 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 8821774-8824645(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCAAGTCACGTGG
SmilChr01G000177 Chr01 NC_080387.1:2911878-2911891promoter 内 1526-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 2906711-2909416(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAGTCACGTGG
SmilChr05G004036 Chr05 NC_080391.1:54327156-54327169promoter 内 1395-1408 bp - 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 54323422-54324563(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr06G002442 Chr06 NC_080392.1:35165595-35165608promoter 内 1328-1341 bp - 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 35162435-35162935(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCGACACGTGG
SmilChr01G005006 Chr01 NC_080387.1:68115494-68115507promoter 内 1229-1242 bp - 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 68107762-68112735(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCGACACGTGG
SmilChr01G005009 Chr01 NC_080387.1:68115494-68115507promoter 内 1216-1229 bp - 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 68118279-68120350(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCCCA
SmilChr01G004952 Chr01 NC_080387.1:67599040-67599053promoter 内 890-903 bp + 3098 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 67594530-67595942(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCACGCC
SmilChr01G003069 Chr01 NC_080387.1:49535570-49535583promoter 内 831-844 bp + 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 49531191-49532413(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCCCA
SmilChr05G001449 Chr05 NC_080391.1:13226447-13226460promoter 内 774-787 bp + 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 13229674-13239752(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr01G003268 Chr01 NC_080387.1:51359843-51359856promoter 内 771-784 bp - 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 51363073-51369146(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCACGCC
SmilChr03G003485 Chr03 NC_080389.1:53434512-53434525promoter 内 565-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 53425898-53431089(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCCCA
SmilChr02G005263 Chr02 NC_080388.1:73726439-73726452promoter 内 545-558 bp + 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 73718345-73722996(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCACGCC
SmilChr04G003180 Chr04 NC_080390.1:48521229-48521242promoter 内 381-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 48515885-48517622(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr04G003913 Chr04 NC_080390.1:54852262-54852275promoter 内 380-393 bp + 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 54855883-54859870(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTGCGACACGTGG
SmilChr01G002843 Chr01 NC_080387.1:47005869-47005882promoter 内 364-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 46996758-47002245(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr08G000573 Chr08 NC_080394.1:4173566-4173579promoter 内 354-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 4168312-4169932(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr07G000124 Chr07 NC_080393.1:723718-723731promoter 内 275-288 bp + 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 727444-732204(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr07G003983 Chr07 NC_080393.1:50824945-50824958promoter 内 248-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 50818134-50821205(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCACGCC
SmilChr04G001645 Chr04 NC_080390.1:27360642-27360655promoter 内 212-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 27354562-27356866(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTTGCC
SmilChr01G002384 Chr01 NC_080387.1:41063633-41063646promoter 内 80-93 bp + 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 41067554-41070519(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGTGGCACGTGG
SmilChr02G003522 Chr02 NC_080388.1:56391652-56391665promoter 内 74-87 bp - 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 56395579-56397687(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCACGCC
SmilChr03G002960 Chr03 NC_080389.1:46363094-46363107promoter 内 1000-1013 bp - 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 4 46357573-46360106(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAGGCCACGTGG
SmilChr07G004011 Chr07 NC_080393.1:51152534-51152547promoter 内 662-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 4 51146299-51149208(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAGGCCACGTGG
SmilChr01G002906 Chr01 NC_080387.1:47760093-47760106promoter 内 1976-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 3 47752984-47758081(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCGCT
SmilChr05G002788 Chr05 NC_080391.1:32585192-32585205promoter 内 1656-1669 bp + 2332 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 3 32587537-32597710(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCGCGCCACGTGG
SmilChr02G003301 Chr02 NC_080388.1:54291971-54291984promoter 内 2628-2641 bp - 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 54286934-54290611(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCGCGCCACGTGG
SmilChr04G002399 Chr04 NC_080390.1:38536000-38536013promoter 内 596-609 bp - 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 38539405-38544239(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTTCC
SmilChr06G002540 Chr06 NC_080392.1:36426378-36426391promoter 内 495-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 36418599-36422885(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTTCC
SmilChr01G002040 Chr01 NC_080387.1:36067263-36067276promoter 内 62-75 bp + 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 36071202-36076483(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCGCGCCACGTGG
SmilChr05G004202 Chr05 NC_080391.1:55898886-55898899promoter 内 3950-3963 bp - 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 55898937-55902971(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCGCA
SmilChr01G001537 Chr01 NC_080387.1:29396097-29396110promoter 内 3869-3882 bp - 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 29394965-29395978(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGCGACACGTGG
SmilChr05G003349 Chr05 NC_080391.1:44201085-44201098promoter 内 3713-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 44201373-44201921(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCGCA
SmilChr01G005338 Chr01 NC_080387.1:70618010-70618023promoter 内 3668-3681 bp + 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 70613875-70617690(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCTCCA
SmilChr04G004174 Chr04 NC_080390.1:56361287-56361300promoter 内 3313-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 56358324-56360612(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAGGGCACGTGG
SmilChr01G001538 Chr01 NC_080387.1:29396097-29396110promoter 内 3109-3122 bp - 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 29396989-29398368(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCGCA
SmilChr07G003274 Chr07 NC_080393.1:34506719-34506732promoter 内 2943-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 34507777-34507862(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGAGGTCACGTGG
SmilChr06G001213 Chr06 NC_080392.1:12432416-12432429promoter 内 2841-2854 bp + 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 12428016-12431269(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCTGCA
SmilChr07G003275 Chr07 NC_080393.1:34506719-34506732promoter 内 2618-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 34508102-34508186(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGAGGTCACGTGG
SmilChr07G003276 Chr07 NC_080393.1:34506719-34506732promoter 内 2456-2469 bp + 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 34508264-34508352(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGAGGTCACGTGG
SmilChr04G003657 Chr04 NC_080390.1:53049028-53049041promoter 内 1974-1987 bp - 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 53051055-53061009(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCCTCT
SmilChr05G002908 Chr05 NC_080391.1:34948671-34948684promoter 内 1952-1965 bp + 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 34950720-34952245(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGCGACACGTGG
SmilChr01G001536 Chr01 NC_080387.1:29388175-29388188promoter 内 1681-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 29390495-29392866(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGCGACACGTGG
SmilChr07G001877 Chr07 NC_080393.1:16250322-16250335promoter 内 1539-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 16246070-16247873(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGTCACGTGG