转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 20 / 126 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001508 Chr07 NC_080393.1:12022095-12022109promoter 内 814-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 12025282-12028518(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACCACC
SmilChr04G002671 Chr04 NC_080390.1:42123004-42123018promoter 内 779-793 bp - 3208 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 42117659-42119796(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGTTGTGACGTGGCA
SmilChr03G003348 Chr03 NC_080389.1:51822805-51822819promoter 内 742-756 bp + 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 51818628-51819560(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTTCCAA
SmilChr04G003588 Chr04 NC_080390.1:52321940-52321954promoter 内 667-681 bp - 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52317441-52318620(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCAGATGACGTGGCA
SmilChr04G000656 Chr04 NC_080390.1:7425227-7425241promoter 内 484-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 7428744-7431916(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTGGAAGACGTGGCA
SmilChr03G003349 Chr03 NC_080389.1:51822805-51822819promoter 内 413-427 bp + 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 51826393-51831369(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTGGAAGACGTGGCA
SmilChr04G003969 Chr04 NC_080390.1:55169323-55169337promoter 内 338-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 55162182-55165674(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCTCTA
SmilChr07G003388 Chr07 NC_080393.1:36698990-36699004promoter 内 322-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 36702669-36706091(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTGGAAGACGTGGCA
SmilChr05G001803 Chr05 NC_080391.1:17810808-17810822promoter 内 194-208 bp - 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 17814615-17816936(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTTCCAA
SmilChr08G002863 Chr08 NC_080394.1:28462516-28462530promoter 内 142-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 28456742-28458671(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACCACC
SmilChr01G002582 Chr01 NC_080387.1:43959900-43959914promoter 内 80-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 43953659-43955993(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGGTGACGTGGCT
SmilChr04G003590 Chr04 NC_080390.1:52321940-52321954promoter 内 58-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52325883-52336260(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATCTGC
SmilChr04G002991 Chr04 NC_080390.1:46337270-46337284promoter 内 40-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 46341231-46342816(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCATCATC
SmilChr05G001301 Chr05 NC_080391.1:11239378-11239392promoter 内 8-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11243371-11245954(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACCACC
SmilChr02G003890 Chr02 NC_080388.1:60996476-60996490promoter 内 3952-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 60996525-60999185(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTAGAACACGTGGCG
SmilChr02G003891 Chr02 NC_080388.1:60996476-60996490promoter 内 1191-1205 bp + 2796 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 60999286-61002831(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTAGAACACGTGGCG
SmilChr01G001124 Chr01 NC_080387.1:22850236-22850250promoter 内 3892-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 22850345-22851537(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTATGACACGTGGCG
SmilChr01G002810 Chr01 NC_080387.1:46655111-46655125promoter 内 3851-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 46650825-46654975(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTCATCC
SmilChr03G004704 Chr03 NC_080389.1:64333297-64333311promoter 内 3843-3857 bp - 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 64333455-64336742(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCACATCC
SmilChr03G004703 Chr03 NC_080389.1:64333297-64333311promoter 内 2998-3012 bp - 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 64328867-64332308(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGATGTGACGTGGCG
SmilChr07G002738 Chr07 NC_080393.1:26887937-26887951promoter 内 1940-1954 bp + 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 26889998-26893429(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAGATGACGTGGCA
SmilChr08G000059 Chr08 NC_080394.1:345344-345358promoter 内 1573-1587 bp - 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 347772-350009(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGCACGT
SmilChr01G004644 Chr01 NC_080387.1:64484329-64484343promoter 内 1571-1585 bp - 2416 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 64486759-64489939(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCATCTCC
SmilChr08G000057 Chr08 NC_080394.1:345344-345358promoter 内 1495-1509 bp - 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 340434-342852(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACGTGCCACGTGGCA
SmilChr03G002104 Chr03 NC_080389.1:32763881-32763895promoter 内 565-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 32760324-32760459(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGCTCCA
SmilChr04G004135 Chr04 NC_080390.1:56153369-56153383promoter 内 275-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 56157095-56162754(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCGTC
SmilChr04G001817 Chr04 NC_080390.1:29655111-29655125promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 29652716-29655077(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCAGAT
SmilChr01G000985 Chr01 NC_080387.1:20869634-20869648promoter 内 3861-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 20868374-20869508(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTATGACACGTGGCG
SmilChr01G004286 Chr01 NC_080387.1:61076980-61076994promoter 内 3618-3632 bp - 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 61077363-61166893(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTCGAT
SmilChr08G001855 Chr08 NC_080394.1:15938193-15938207promoter 内 3565-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 15938629-15940076(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTGCATG
SmilChr01G001802 Chr01 NC_080387.1:32938581-32938595promoter 内 3563-3577 bp - 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 32935842-32938157(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTTGTCACGTGGCG
SmilChr08G004244 Chr08 NC_080394.1:51899895-51899909promoter 内 3473-3487 bp - 514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51900423-51903986(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCATCTCC
SmilChr08G004127 Chr08 NC_080394.1:50119325-50119339promoter 内 3118-3132 bp + 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50116983-50118456(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCATCTCC
SmilChr01G001726 Chr01 NC_080387.1:31797996-31798010promoter 内 3028-3042 bp - 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 31794900-31797037(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTTGTCACGTGGCG
SmilChr07G000468 Chr07 NC_080393.1:3283201-3283215promoter 内 2773-2787 bp + 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3284429-3290968(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGATGACGTGGCG
SmilChr01G003604 Chr01 NC_080387.1:54584846-54584860promoter 内 2673-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 54580869-54583532(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTTCCAC
SmilChr02G003001 Chr02 NC_080388.1:50677537-50677551promoter 内 2552-2566 bp - 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50678986-50681683(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTTCCAC
SmilChr02G002661 Chr02 NC_080388.1:46082967-46082981promoter 内 2525-2539 bp + 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46070906-46081505(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCACCCAG
SmilChr01G002261 Chr01 NC_080387.1:39423199-39423213promoter 内 2449-2463 bp + 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 39417632-39421661(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATCTAA
SmilChr05G002252 Chr05 NC_080391.1:24199648-24199662promoter 内 2137-2151 bp - 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 24201512-24211106(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCATCTCC
SmilChr07G003466 Chr07 NC_080393.1:38750333-38750347promoter 内 2136-2150 bp + 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 38752198-38754479(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCGAACACGTGGCA
SmilChr04G003472 Chr04 NC_080390.1:51192909-51192923promoter 内 1873-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51186651-51190795(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGGGCAGACGTGGCA
SmilChr04G001531 Chr04 NC_080390.1:25233170-25233184promoter 内 1453-1467 bp + 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 25235718-25237673(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGATGACGTGGCG
SmilChr04G001666 Chr04 NC_080390.1:27615639-27615653promoter 内 1242-1256 bp - 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 27618398-27618811(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGATCCTG
SmilChr02G004329 Chr02 NC_080388.1:65565223-65565237promoter 内 1188-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 65568036-65572115(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAGGCCCACGTGGCG
SmilChr08G002563 Chr08 NC_080394.1:24969390-24969404promoter 内 813-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 24972578-24979185(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GACGCTGACGTGGCA
SmilChr07G004428 Chr07 NC_080393.1:56898657-56898671promoter 内 702-716 bp - 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 56892545-56895372(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACAGCTGACGTGGCA
SmilChr08G003406 Chr08 NC_080394.1:35984239-35984253promoter 内 555-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35977635-35980807(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GACGCTGACGTGGCA
SmilChr01G005456 Chr01 NC_080387.1:71594778-71594792promoter 内 338-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 71598441-71600735(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGGACCACGTGGCG
SmilChr01G003475 Chr01 NC_080387.1:53299737-53299751promoter 内 323-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53303415-53305304(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGCCGAC