转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 22 / 149 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005465 Chr02 NC_080388.1:74949203-74949217promoter 内 3102-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 74945122-74948318(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTAGGATAAGACT
SmilChr01G000627 Chr01 NC_080387.1:14051808-14051822promoter 内 3028-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 14049918-14050849(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTGAGGATAAGATA
SmilChr04G002925 Chr04 NC_080390.1:45520708-45520722promoter 内 2978-2992 bp + 1009 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 45518617-45519699(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAACGTC
SmilChr04G003060 Chr04 NC_080390.1:47178777-47178791promoter 内 2808-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 47175323-47177598(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAATGGATAAGAAA
SmilChr02G005117 Chr02 NC_080388.1:72677218-72677232promoter 内 2533-2547 bp + 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 72672090-72675764(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATGGATAATATT
SmilChr02G003698 Chr02 NC_080388.1:58440128-58440142promoter 内 1564-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 58442565-58448672(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCACTTC
SmilChr02G000054 Chr02 NC_080388.1:712800-712814promoter 内 1526-1540 bp - 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 709977-710339(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTCATCCATACA
SmilChr04G003516 Chr04 NC_080390.1:51543839-51543853promoter 内 1409-1423 bp - 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 51539609-51541261(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TCCCTTATCCAAATT
SmilChr04G000420 Chr04 NC_080390.1:4458423-4458437promoter 内 1343-1357 bp - 2644 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 4461081-4462226(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACATTGGATAAGGTC
SmilChr04G003062 Chr04 NC_080390.1:47178777-47178791promoter 内 1175-1189 bp + 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 47181603-47182541(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCATTTA
SmilChr02G005119 Chr02 NC_080388.1:72677218-72677232promoter 内 1173-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 72680046-72684140(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATAAT
SmilChr04G001785 Chr04 NC_080390.1:29276428-29276442promoter 内 993-1007 bp + 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 29264863-29273434(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGAACGGATAAGGTG
SmilChr03G001237 Chr03 NC_080389.1:14275763-14275777promoter 内 958-972 bp + 3029 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 14278806-14279299(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCTTATT
SmilChr04G000470 Chr04 NC_080390.1:5016729-5016743promoter 内 122-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 5020608-5021363(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCCCTATCCATTTC
SmilChr02G005466 Chr02 NC_080388.1:74949203-74949217promoter 内 3642-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 74949562-74959898(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTCTTATCCTAATC
SmilChr01G000628 Chr01 NC_080387.1:14051808-14051822promoter 内 3536-3550 bp + 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 14052273-14053478(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCTCAAC
SmilChr02G004150 Chr02 NC_080388.1:63823465-63823479promoter 内 3467-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 63816830-63822945(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTAAGGATAAGGAA
SmilChr01G000650 Chr01 NC_080387.1:14493344-14493358promoter 内 3319-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 14491531-14492676(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCTCAAC
SmilChr03G004684 Chr03 NC_080389.1:64251046-64251060promoter 内 3304-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64249254-64250363(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACATTATCCAAAAA
SmilChr01G002159 Chr01 NC_080387.1:37598205-37598219promoter 内 3198-3212 bp - 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 37593727-37597416(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCATTAG
SmilChr01G002695 Chr01 NC_080387.1:45210772-45210786promoter 内 3061-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 45211712-45216382(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAAGTGGATAACATT
SmilChr03G004297 Chr03 NC_080389.1:61377061-61377075promoter 内 3054-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 61373556-61376128(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCGATTC
SmilChr02G000517 Chr02 NC_080388.1:7146214-7146228promoter 内 3043-3057 bp + 944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7143063-7145270(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATGGATGAGGTT
SmilChr02G003855 Chr02 NC_080388.1:60315480-60315494promoter 内 2983-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 60305438-60314476(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATATT
SmilChr01G000612 Chr01 NC_080387.1:13516908-13516922promoter 内 2968-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 13514420-13515889(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTCTTATCCTAATC
SmilChr03G004660 Chr03 NC_080389.1:64086925-64086939promoter 内 2959-2973 bp + 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64087967-64091188(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATAAT
SmilChr01G000651 Chr01 NC_080387.1:14493344-14493358promoter 内 2526-2540 bp - 1461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 14494819-14495241(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTGAGGATAAGATA
SmilChr01G003522 Chr01 NC_080387.1:53854966-53854980promoter 内 2443-2457 bp - 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53856524-53861726(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATTGGATAAGTTT
SmilChr04G000469 Chr04 NC_080390.1:5016729-5016743promoter 内 2388-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 5018342-5019145(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCCCTATCCATTTC
SmilChr02G004585 Chr02 NC_080388.1:68341856-68341870promoter 内 2095-2109 bp + 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 68343762-68346106(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCAAATA
SmilChr03G003588 Chr03 NC_080389.1:54542376-54542390promoter 内 1933-1947 bp + 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 54544444-54546455(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCTTATA
SmilChr01G003523 Chr01 NC_080387.1:53854966-53854980promoter 内 1874-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53857093-53857698(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATTGGATAAGTTT
SmilChr01G002770 Chr01 NC_080387.1:46147750-46147764promoter 内 1788-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 46144436-46145551(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCTTTATCCATTTC
SmilChr01G004200 Chr01 NC_080387.1:60475684-60475698promoter 内 1759-1773 bp + 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 60477926-60482479(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CCCCTTATCCAAATC
SmilChr03G001489 Chr03 NC_080389.1:17957438-17957452promoter 内 1647-1661 bp + 2340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 17953517-17955098(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTAGAGGATAAGGTG
SmilChr01G001531 Chr01 NC_080387.1:29301843-29301857promoter 内 1395-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 29304449-29306676(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACGTTATCCATTAT
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