转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 24 / 149 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003758 Chr04 NC_080390.1:53852171-53852181promoter 内 2737-2747 bp + 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 53839632-53850917(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr02G002418 Chr02 NC_080388.1:42176709-42176719promoter 内 1130-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 42172958-42173848(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGT
SmilChr04G003821 Chr04 NC_080390.1:54346292-54346302promoter 内 184-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 54342415-54342485(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr04G003820 Chr04 NC_080390.1:54346292-54346302promoter 内 107-117 bp + 3884 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 54342321-54342408(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr03G002347 Chr03 NC_080389.1:37020084-37020094promoter 内 2788-2798 bp - 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 37015279-37018881(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACGGCTGTCA
SmilChr03G001962 Chr03 NC_080389.1:28109919-28109929promoter 内 2300-2310 bp + 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 28111620-28116633(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAGGCTGTCA
SmilChr01G002279 Chr01 NC_080387.1:39580267-39580277promoter 内 1765-1775 bp + 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 39582503-39591376(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCA
SmilChr07G002723 Chr07 NC_080393.1:26717515-26717525promoter 内 1614-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 26719902-26721853(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCT
SmilChr07G003097 Chr07 NC_080393.1:32755064-32755074promoter 内 1467-1477 bp + 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 32749360-32752540(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr06G002676 Chr06 NC_080392.1:38664977-38664987promoter 内 1194-1204 bp - 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 38667784-38676358(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAG
SmilChr06G000245 Chr06 NC_080392.1:1634173-1634183promoter 内 1130-1140 bp - 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 1637044-1638905(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGT
SmilChr06G000558 Chr06 NC_080392.1:4778021-4778031promoter 内 862-872 bp + 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 4772776-4774892(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr03G002148 Chr03 NC_080389.1:33414272-33414282promoter 内 820-830 bp - 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 33417453-33418998(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTA
SmilChr06G002674 Chr06 NC_080392.1:38664977-38664987promoter 内 701-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 38658973-38661687(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCGGCTGTCA
SmilChr04G004006 Chr04 NC_080390.1:55401460-55401470promoter 内 426-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 55405035-55406062(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAGGCTGTCA
SmilChr07G000296 Chr07 NC_080393.1:1950591-1950601promoter 内 409-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 1954183-1954790(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTG
SmilChr02G000116 Chr02 NC_080388.1:1470959-1470969promoter 内 3837-3847 bp - 154 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1471123-1473711(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTG
SmilChr06G003286 Chr06 NC_080392.1:45409451-45409461promoter 内 3808-3818 bp + 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 45409644-45410193(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACGGCTGTCA
SmilChr02G003440 Chr02 NC_080388.1:55678788-55678798promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 55674626-55678393(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCA
SmilChr02G001955 Chr02 NC_080388.1:35285754-35285764promoter 内 3476-3486 bp + 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35286279-35288543(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCA
SmilChr05G004049 Chr05 NC_080391.1:54480890-54480900promoter 内 3410-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 54481481-54486420(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCA
SmilChr02G001369 Chr02 NC_080388.1:25809408-25809418promoter 内 3241-3251 bp - 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25810168-25810274(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTG
SmilChr02G001060 Chr02 NC_080388.1:18840555-18840565promoter 内 2943-2953 bp - 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 18841613-18842665(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTA
SmilChr04G000890 Chr04 NC_080390.1:11418042-11418052promoter 内 2904-2914 bp + 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 11419139-11424440(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCA
SmilChr05G002467 Chr05 NC_080391.1:27191817-27191827promoter 内 2902-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 27192916-27196060(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr05G001869 Chr05 NC_080391.1:18848979-18848989promoter 内 2837-2847 bp + 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 18842474-18847825(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr04G001610 Chr04 NC_080390.1:26777672-26777682promoter 内 2681-2691 bp - 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26776290-26776362(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG
SmilChr02G003299 Chr02 NC_080388.1:54279771-54279781promoter 内 2634-2644 bp + 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 54252125-54278414(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGC
SmilChr01G006170 Chr01 NC_080387.1:77210577-77210587promoter 内 2368-2378 bp + 1623 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 77205882-77208954(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGTA
SmilChr03G003818 Chr03 NC_080389.1:57255282-57255292promoter 内 2333-2343 bp + 1658 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 57249431-57253624(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAG
SmilChr07G001380 Chr07 NC_080393.1:10722137-10722147promoter 内 2305-2315 bp + 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 10718930-10720451(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGT
SmilChr02G001901 Chr02 NC_080388.1:34311015-34311025promoter 内 2208-2218 bp + 1783 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 34308094-34309232(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGT
SmilChr03G001529 Chr03 NC_080389.1:19080334-19080344promoter 内 2103-2113 bp + 1888 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19077686-19078446(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAG
SmilChr02G003149 Chr02 NC_080388.1:52521168-52521178promoter 内 2049-2059 bp - 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 52517472-52519226(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCA
SmilChr06G002477 Chr06 NC_080392.1:35606339-35606349promoter 内 1857-1867 bp - 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35600335-35604205(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACGGCTGTCA
SmilChr04G001291 Chr04 NC_080390.1:20571958-20571968promoter 内 1806-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20574153-20576371(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAG
SmilChr06G000240 Chr06 NC_080392.1:1608559-1608569promoter 内 1193-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1611367-1611861(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGC
SmilChr05G001599 Chr05 NC_080391.1:14725301-14725311promoter 内 1068-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14718376-14722378(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAG
SmilChr02G001720 Chr02 NC_080388.1:31648362-31648372promoter 内 1051-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 31651312-31654382(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCGGCTGTCA
SmilChr06G000641 Chr06 NC_080392.1:5670127-5670137promoter 内 944-954 bp + 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 5660467-5667080(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAG
SmilChr04G001608 Chr04 NC_080390.1:26777672-26777682promoter 内 915-925 bp - 3076 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26771724-26774596(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG
SmilChr04G003761 Chr04 NC_080390.1:53874044-53874054promoter 内 883-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 53869789-53870936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGT
SmilChr04G001896 Chr04 NC_080390.1:30984267-30984277promoter 内 858-868 bp - 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30980469-30981134(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTCT
SmilChr04G002233 Chr04 NC_080390.1:36043391-36043401promoter 内 732-742 bp - 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 36046660-36053627(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGC
SmilChr02G005575 Chr02 NC_080388.1:75614162-75614172promoter 内 641-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75617522-75618245(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAGGCTGTCA
SmilChr02G005574 Chr02 NC_080388.1:75614162-75614172promoter 内 635-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75608762-75610806(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr01G002145 Chr01 NC_080387.1:37434958-37434968promoter 内 634-644 bp + 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 37438325-37445361(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCGGCTGTCA
SmilChr06G002721 Chr06 NC_080392.1:39297980-39297990promoter 内 604-614 bp + 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 39301377-39307397(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG
SmilChr07G002156 Chr07 NC_080393.1:19730299-19730309promoter 内 536-546 bp - 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19724640-19726844(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAGGCTGTCA
SmilChr04G002731 Chr04 NC_080390.1:42956897-42956907promoter 内 488-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 42944344-42953394(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG