转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 25 / 149 下载 TSV

上一页 25 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002136 Chr05 NC_080391.1:22449768-22449778promoter 内 253-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 22453516-22454850(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG
SmilChr01G000471 Chr01 NC_080387.1:9612440-9612450promoter 内 173-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9606995-9608622(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG
SmilChr01G004047 Chr01 NC_080387.1:58898501-58898511promoter 内 159-169 bp + 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 58902343-58908090(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCG
SmilChr05G001129 Chr05 NC_080391.1:9416009-9416019promoter 内 140-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9419870-9426929(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACGGCTGTCA
SmilChr05G002322 Chr05 NC_080391.1:25029552-25029562promoter 内 30-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25033523-25036609(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGT
SmilChr03G004157 Chr03 NC_080389.1:60340321-60340331promoter 内 17-27 bp - 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 60344305-60348450(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGT
SmilChr01G000637 Chr01 NC_080387.1:14308754-14308764promoter 内 13-23 bp - 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14312742-14314457(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTG
SmilChr06G002002 Chr06 NC_080392.1:25678740-25678750promoter 内 2742-2752 bp + 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 25671303-25677491(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr02G000791 Chr02 NC_080388.1:13053508-13053518promoter 内 1534-1544 bp - 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 13046149-13051051(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCA
SmilChr06G002842 Chr06 NC_080392.1:41187328-41187338promoter 内 2989-2999 bp - 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 41184596-41186326(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCA
SmilChr02G003614 Chr02 NC_080388.1:57380175-57380185promoter 内 2487-2497 bp + 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 57373768-57378671(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr03G004193 Chr03 NC_080389.1:60598867-60598877promoter 内 2266-2276 bp - 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 60600602-60602509(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr05G003504 Chr05 NC_080391.1:46773371-46773381promoter 内 43-53 bp - 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 46777329-46779116(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGT
SmilChr05G002771 Chr05 NC_080391.1:32232883-32232893promoter 内 3964-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 32232920-32233363(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr01G004984 Chr01 NC_080387.1:67890014-67890024promoter 内 3909-3919 bp - 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 67888541-67889932(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr03G004281 Chr03 NC_080389.1:61235727-61235737promoter 内 3737-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 61235991-61239443(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr02G003871 Chr02 NC_080388.1:60725284-60725294promoter 内 3450-3460 bp - 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 60725835-60728328(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGG
SmilChr02G000638 Chr02 NC_080388.1:9669668-9669678promoter 内 3446-3456 bp - 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 9664075-9669123(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr04G000656 Chr04 NC_080390.1:7427970-7427980promoter 内 3227-3237 bp - 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 7428744-7431916(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGG
SmilChr06G002816 Chr06 NC_080392.1:40866402-40866412promoter 内 3195-3205 bp + 796 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 40867208-40869335(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr02G004467 Chr02 NC_080388.1:67072830-67072840promoter 内 3171-3181 bp + 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 67073660-67076530(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCA
SmilChr03G001308 Chr03 NC_080389.1:15368251-15368261promoter 内 2859-2869 bp + 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 15369393-15370731(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCA
SmilChr06G002361 Chr06 NC_080392.1:34396236-34396246promoter 内 2558-2568 bp + 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 34397679-34398254(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr02G000131 Chr02 NC_080388.1:1800688-1800698promoter 内 2295-2305 bp - 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 1797090-1798992(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACGGGCTGTCA
SmilChr06G001295 Chr06 NC_080392.1:13495066-13495076promoter 内 2211-2221 bp + 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 13496856-13500011(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCA
SmilChr01G004983 Chr01 NC_080387.1:67890014-67890024promoter 内 2080-2090 bp - 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 67882168-67888103(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr03G003211 Chr03 NC_080389.1:49714108-49714118promoter 内 1615-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 49716494-49725592(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGG
SmilChr05G001498 Chr05 NC_080391.1:13751539-13751549promoter 内 1612-1622 bp + 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 13753928-13755172(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr02G001653 Chr02 NC_080388.1:30691294-30691304promoter 内 1156-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 30686091-30688459(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr01G004627 Chr01 NC_080387.1:64329423-64329433promoter 内 1082-1092 bp - 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 64324689-64326514(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr07G000854 Chr07 NC_080393.1:6079998-6080008promoter 内 792-802 bp + 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 6083207-6091922(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr03G001536 Chr03 NC_080389.1:19269037-19269047promoter 内 629-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 19261872-19265675(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACGGGCTGTCA
SmilChr02G002376 Chr02 NC_080388.1:41646327-41646337promoter 内 523-533 bp - 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 41649805-41652168(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr02G002079 Chr02 NC_080388.1:37377826-37377836promoter 内 483-493 bp - 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37372666-37374318(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCC
SmilChr06G003199 Chr06 NC_080392.1:44858995-44859005promoter 内 482-492 bp + 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 44853100-44855486(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGG
SmilChr03G001728 Chr03 NC_080389.1:23218978-23218988promoter 内 428-438 bp - 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 23222551-23224466(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGGA
SmilChr02G004388 Chr02 NC_080388.1:66240981-66240991promoter 内 255-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 66244727-66248655(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGT
SmilChr02G004466 Chr02 NC_080388.1:67072830-67072840promoter 内 115-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 67065916-67068954(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAGG
SmilChr01G003631 Chr01 NC_080387.1:54843007-54843017promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 54837134-54839022(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACGGGCTGTCA
SmilChr05G002365 Chr05 NC_080391.1:25822979-25822989promoter 内 2317-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 25824663-25824769(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr01G000891 Chr01 NC_080387.1:18954226-18954236promoter 内 2243-2253 bp + 1748 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 18955984-18963499(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAA
SmilChr03G001784 Chr03 NC_080389.1:24416265-24416275promoter 内 3065-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 24405198-24415339(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr05G002611 Chr05 NC_080391.1:29393773-29393783promoter 内 2234-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 29395540-29396278(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr02G002188 Chr02 NC_080388.1:39080053-39080063promoter 内 1700-1710 bp - 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 39076725-39077762(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr03G001786 Chr03 NC_080389.1:24416265-24416275promoter 内 1344-1354 bp - 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 24418922-24420385(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr01G003589 Chr01 NC_080387.1:54433785-54433795promoter 内 3443-3453 bp - 548 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 54434343-54437470(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr06G001941 Chr06 NC_080392.1:23835406-23835416promoter 内 3278-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 23831066-23834693(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr03G000912 Chr03 NC_080389.1:10435878-10435888promoter 内 2886-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 10436993-10445143(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr03G004393 Chr03 NC_080389.1:62106823-62106833promoter 内 2855-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 62107969-62119002(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr02G001818 Chr02 NC_080388.1:33061770-33061780promoter 内 2042-2052 bp - 1949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 33058999-33059821(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA