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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 26 / 139 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005438 Chr01 NC_080387.1:71514943-71514956promoter 内 2972-2985 bp - 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 71509433-71513927(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGGACGGTGGCCA
SmilChr06G000060 Chr06 NC_080392.1:501772-501785promoter 内 2865-2878 bp - 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 497486-500649(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTTGA
SmilChr02G000347 Chr02 NC_080388.1:4513344-4513357promoter 内 2677-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 4514668-4515375(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGGGGCGGTGGAGG
SmilChr02G000290 Chr02 NC_080388.1:3681442-3681455promoter 内 2583-2596 bp - 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3679397-3680037(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGGGGCGGTGGAGG
SmilChr04G002852 Chr04 NC_080390.1:44635438-44635451promoter 内 2388-2401 bp + 1600 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 44637051-44643486(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGTGC
SmilChr04G001064 Chr04 NC_080390.1:15216113-15216126promoter 内 2340-2353 bp + 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 15217774-15219364(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGGGGCGGTGGAGA
SmilChr02G004559 Chr02 NC_080388.1:68110000-68110013promoter 内 2102-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 68111899-68113130(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAACCACCGTCCTT
SmilChr02G005598 Chr02 NC_080388.1:75711636-75711649promoter 内 1997-2010 bp - 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 75708951-75709645(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGCCGT
SmilChr01G000264 Chr01 NC_080387.1:5099099-5099112promoter 内 1946-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5088159-5097057(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGGCAG
SmilChr01G004769 Chr01 NC_080387.1:65864389-65864402promoter 内 1658-1671 bp - 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 65858151-65862059(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGGGGA
SmilChr02G004558 Chr02 NC_080388.1:68110000-68110013promoter 内 1555-1568 bp - 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 68103579-68107567(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGGTTG
SmilChr02G002601 Chr02 NC_080388.1:45149126-45149139promoter 内 1550-1563 bp + 2438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 45151577-45154195(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGGGGCGGTGGAGA
SmilChr02G002225 Chr02 NC_080388.1:39572490-39572503promoter 内 1170-1183 bp + 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 39567398-39569672(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTTCACCGTCCAT
SmilChr01G004411 Chr01 NC_080387.1:62211539-62211552promoter 内 1052-1065 bp - 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62214488-62219697(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGCCACCGTCTAC
SmilChr04G001633 Chr04 NC_080390.1:27096398-27096411promoter 内 875-888 bp - 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 27088397-27093285(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGGGACGGTGGAGT
SmilChr01G005037 Chr01 NC_080387.1:68304106-68304119promoter 内 607-620 bp + 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 68307500-68325829(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGAGGC
SmilChr03G003331 Chr03 NC_080389.1:51592731-51592744promoter 内 444-457 bp - 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51586072-51589187(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGGGCA
SmilChr01G002632 Chr01 NC_080387.1:44611621-44611634promoter 内 304-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 44615318-44617660(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGGTGT
SmilChr06G000262 Chr06 NC_080392.1:1759573-1759586promoter 内 242-255 bp + 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1752077-1755827(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTTCACCGTCCTC
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681442-3681455promoter 内 231-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3676633-3677685(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGGGGCGGTGGAGG
SmilChr03G002852 Chr03 NC_080389.1:45111409-45111422promoter 内 3056-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 45106738-45110477(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTTCACCGTCCAT
SmilChr02G001871 Chr02 NC_080388.1:33995554-33995567promoter 内 335-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 33990153-33991901(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGGGTA
SmilChr02G002305 Chr02 NC_080388.1:40671449-40671462promoter 内 819-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 40666821-40668280(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGACCGCCGTCCAG
SmilChr07G000245 Chr07 NC_080393.1:1585345-1585358promoter 内 423-436 bp - 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 1579872-1581780(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTGGC
SmilChr03G003691 Chr03 NC_080389.1:55852278-55852291promoter 内 3939-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55852340-55858688(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGGCTAC
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SmilChr03G003695 Chr03 NC_080389.1:55884049-55884062promoter 内 3505-3518 bp - 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55879339-55883566(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGAATG
SmilChr02G001248 Chr02 NC_080388.1:22930896-22930909promoter 内 3310-3323 bp + 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 22931587-22932753(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGAATG
SmilChr06G003207 Chr06 NC_080392.1:44887758-44887771promoter 内 2707-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44889052-44892896(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGCGCCGTCCAC
SmilChr06G003216 Chr06 NC_080392.1:44936693-44936706promoter 内 2704-2717 bp - 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44937990-44941818(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGCGCCGTCCAC
SmilChr04G002488 Chr04 NC_080390.1:39741305-39741318promoter 内 2611-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39742695-39744325(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGCCACCGTCATC
SmilChr04G001795 Chr04 NC_080390.1:29414422-29414435promoter 内 2581-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 29415842-29418239(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGCCACCGTCATC
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SmilChr07G000246 Chr07 NC_080393.1:1585345-1585358promoter 内 2569-2582 bp - 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1582773-1583926(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTGGC
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SmilChr04G000243 Chr04 NC_080390.1:2209640-2209653promoter 内 2178-2191 bp - 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 2204094-2207830(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TAGGCCGGTGGAGA
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SmilChr03G003618 Chr03 NC_080389.1:54841753-54841766promoter 内 1747-1760 bp - 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54844007-54848069(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCCACACCGTCCAC
SmilChr03G004555 Chr03 NC_080389.1:63521069-63521082promoter 内 1672-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63516613-63518753(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGCCACCGTCAAT
SmilChr06G000172 Chr06 NC_080392.1:1186696-1186709promoter 内 1285-1298 bp - 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1189412-1193312(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCACCACCGTCAAT
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SmilChr03G002068 Chr03 NC_080389.1:31588185-31588198promoter 内 1148-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 31585239-31585345(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGGACGGTGGTGC
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SmilChr03G003600 Chr03 NC_080389.1:54623669-54623682promoter 内 661-674 bp - 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54627009-54632648(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCCACACCGTCCAC
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SmilChr01G000097 Chr01 NC_080387.1:1706364-1706377promoter 内 72-85 bp + 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1710293-1712140(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGGACGGTGCAGA
SmilChr01G001065 Chr01 NC_080387.1:22008398-22008411promoter 内 3136-3149 bp - 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 22002683-22007546(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGGCAA