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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 26 / 144 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000670 Chr02 NC_080388.1:10338662-10338674promoter 内 2671-2683 bp - 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 10339992-10340971(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAGTTGACTTTT
SmilChr02G000702 Chr02 NC_080388.1:11219494-11219506promoter 内 2491-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 11208006-11217996(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACACC
SmilChr03G001706 Chr03 NC_080389.1:22651107-22651119promoter 内 2470-2482 bp - 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 22652638-22657573(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAGTTGACTTTT
SmilChr02G002869 Chr02 NC_080388.1:48882288-48882300promoter 内 2245-2257 bp - 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 48884044-48887808(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCATTGACTTTG
SmilChr03G000464 Chr03 NC_080389.1:4969817-4969829promoter 内 1923-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 4966111-4967751(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTGTTGACTTCG
SmilChr02G001535 Chr02 NC_080388.1:28599063-28599075promoter 内 1684-1696 bp + 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 28601380-28601452(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAAAGGG
SmilChr02G000665 Chr02 NC_080388.1:10213000-10213012promoter 内 1138-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 10208037-10210149(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGCGTTGACCATC
SmilChr02G004635 Chr02 NC_080388.1:68823182-68823194promoter 内 912-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 68818426-68820105(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCGTTGACTACG
SmilChr01G002195 Chr01 NC_080387.1:38105867-38105879promoter 内 861-873 bp + 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 38109007-38109480(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACCTT
SmilChr02G003328 Chr02 NC_080388.1:54538108-54538120promoter 内 768-780 bp + 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 54528113-54534887(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCGGTTGACTATG
SmilChr02G001735 Chr02 NC_080388.1:31893601-31893613promoter 内 554-566 bp - 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 31887148-31890166(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAATGCC
SmilChr02G000672 Chr02 NC_080388.1:10359402-10359414promoter 内 45-57 bp - 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 10363358-10368799(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAGTTGACTTTT
SmilChr03G001441 Chr03 NC_080389.1:17149552-17149564promoter 内 39-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 17144939-17145602(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTAGTTGACTTTG
SmilChr02G001533 Chr02 NC_080388.1:28599063-28599075promoter 内 3951-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28598548-28599025(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCTTTGACTTTC
SmilChr02G005519 Chr02 NC_080388.1:75292174-75292186promoter 内 3927-3939 bp + 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 75290995-75292112(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAGTTGACTTTT
SmilChr01G004946 Chr01 NC_080387.1:67558769-67558781promoter 内 3856-3868 bp + 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 67555120-67558636(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACTACA
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SmilChr03G001323 Chr03 NC_080389.1:15469445-15469457promoter 内 3692-3704 bp - 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15469754-15470548(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTTT
SmilChr01G000837 Chr01 NC_080387.1:18087436-18087448promoter 内 3506-3518 bp + 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 18083466-18086953(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTGTTGACTATT
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SmilChr02G004368 Chr02 NC_080388.1:65977636-65977648promoter 内 3180-3192 bp + 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 65974899-65976827(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACCTAT
SmilChr01G000342 Chr01 NC_080387.1:6989201-6989213promoter 内 3024-3036 bp + 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6981145-6988236(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACTGAT
SmilChr01G003322 Chr01 NC_080387.1:51924041-51924053promoter 内 3024-3036 bp + 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 51920813-51923076(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTTT
SmilChr01G000855 Chr01 NC_080387.1:18426746-18426758promoter 内 2868-2880 bp + 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 18427879-18429114(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GATGGTCAACGCG
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SmilChr01G005023 Chr01 NC_080387.1:68207458-68207470promoter 内 2604-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68202894-68206073(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACATT
SmilChr02G004920 Chr02 NC_080388.1:71233948-71233960promoter 内 2537-2549 bp + 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71235412-71237777(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGAGTCAACGAG
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SmilChr03G000789 Chr03 NC_080389.1:8999642-8999654promoter 内 2449-2461 bp + 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8992586-8998102(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTGTTGACTATT
SmilChr01G004150 Chr01 NC_080387.1:60036265-60036277promoter 内 2334-2346 bp + 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60028237-60034610(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATGGTTGACTTTC
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SmilChr03G000508 Chr03 NC_080389.1:5481923-5481935promoter 内 2175-2187 bp - 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5483749-5488480(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTTT
SmilChr03G002729 Chr03 NC_080389.1:43354646-43354658promoter 内 2122-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 43351839-43352779(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGCGTTGACCATC
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SmilChr01G005438 Chr01 NC_080387.1:71516280-71516292promoter 内 1636-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71509433-71513927(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATGGTTGACTTTC
SmilChr01G004085 Chr01 NC_080387.1:59264661-59264673promoter 内 1543-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59267119-59268086(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTAAGTCAACGCA
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SmilChr03G004069 Chr03 NC_080389.1:59673834-59673846promoter 内 652-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59662715-59670497(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GATGGTCAACGCG
SmilChr01G001494 Chr01 NC_080387.1:28766941-28766953promoter 内 570-582 bp - 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28770372-28774508(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTTT
SmilChr02G005376 Chr02 NC_080388.1:74440039-74440051promoter 内 184-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 74431320-74436234(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTAAC
SmilChr03G001070 Chr03 NC_080389.1:12407662-12407674promoter 内 151-163 bp - 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 12402708-12403824(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGAGTCAACGAG
SmilChr01G002115 Chr01 NC_080387.1:37191408-37191420promoter 内 98-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37184435-37187517(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCATTGACTTTG
SmilChr03G003866 Chr03 NC_080389.1:57770393-57770405promoter 内 91-103 bp + 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 57763343-57766495(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTTT
SmilChr02G003817 Chr02 NC_080388.1:59800557-59800569promoter 内 33-45 bp + 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59787754-59796601(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CACGTTGACTGTG
SmilChr01G005851 Chr01 NC_080387.1:74446034-74446046promoter 内 3345-3357 bp + 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 74442519-74445390(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTTTA
SmilChr04G000278 Chr04 NC_080390.1:2547149-2547161promoter 内 3089-3101 bp + 900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 2548061-2548459(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACCTA
SmilChr02G005332 Chr02 NC_080388.1:74155930-74155942promoter 内 3659-3671 bp - 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 74153415-74155600(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGAT