转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 26 / 151 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001398 Chr02 NC_080388.1:26561858-26561870promoter 内 798-810 bp - 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26565061-26567269(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGTTAGGTAAG
SmilChr03G000209 Chr03 NC_080389.1:2400156-2400168promoter 内 678-690 bp + 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 2403479-2406045(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTGC
SmilChr02G000803 Chr02 NC_080388.1:13406210-13406222promoter 内 669-681 bp - 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 13402053-13402890(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTA
SmilChr05G002062 Chr05 NC_080391.1:21489802-21489814promoter 内 637-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 21484523-21486450(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTA
SmilChr04G003475 Chr04 NC_080390.1:51225265-51225277promoter 内 451-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 51220171-51221727(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTA
SmilChr03G001932 Chr03 NC_080389.1:27148252-27148264promoter 内 412-424 bp - 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 27141191-27144675(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTACT
SmilChr02G003364 Chr02 NC_080388.1:54765641-54765653promoter 内 385-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54759037-54762037(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTA
SmilChr01G001370 Chr01 NC_080387.1:27042363-27042375promoter 内 124-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 27046240-27050291(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAA
SmilChr02G002514 Chr02 NC_080388.1:43644459-43644471promoter 内 76-88 bp - 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 43638504-43640546(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTA
SmilChr02G001523 Chr02 NC_080388.1:28360548-28360560promoter 内 2522-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 28362027-28363689(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAG
SmilChr02G003899 Chr02 NC_080388.1:61076804-61076816promoter 内 3839-3851 bp + 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 61076966-61079679(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr04G000336 Chr04 NC_080390.1:3114749-3114761promoter 内 427-439 bp - 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 3106857-3111187(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr05G000693 Chr05 NC_080391.1:5240970-5240982promoter 内 3958-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 5239438-5240939(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTATA
SmilChr02G004595 Chr02 NC_080388.1:68466439-68466451promoter 内 3532-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 68466908-68473833(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCGGGTAGGTAGA
SmilChr04G001092 Chr04 NC_080390.1:15621366-15621378promoter 内 3322-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 15622045-15622702(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTAAC
SmilChr01G001333 Chr01 NC_080387.1:26526968-26526980promoter 内 3254-3266 bp - 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 26527715-26528434(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr02G004040 Chr02 NC_080388.1:62716297-62716309promoter 内 3016-3028 bp + 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 62717282-62719057(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCGTA
SmilChr03G003456 Chr03 NC_080389.1:52935712-52935724promoter 内 2945-2957 bp - 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 52936768-52944705(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAG
SmilChr04G000337 Chr04 NC_080390.1:3114783-3114795promoter 内 2610-2622 bp - 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 3116174-3117136(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr01G000288 Chr01 NC_080387.1:5647971-5647983promoter 内 2432-2444 bp + 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 5649540-5652649(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr03G003724 Chr03 NC_080389.1:56260017-56260029promoter 内 2406-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 56261612-56264124(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTAGA
SmilChr01G001334 Chr01 NC_080387.1:26526968-26526980promoter 内 2382-2394 bp - 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 26528587-26530877(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr05G002070 Chr05 NC_080391.1:21547504-21547516promoter 内 2348-2360 bp + 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 21544808-21545863(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr03G001397 Chr03 NC_080389.1:16587661-16587673promoter 内 2326-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 16589336-16595237(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAAG
SmilChr03G001468 Chr03 NC_080389.1:17541468-17541480promoter 内 2309-2321 bp - 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 17543160-17547153(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAAG
SmilChr01G002395 Chr01 NC_080387.1:41266535-41266547promoter 内 1748-1760 bp - 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 41268788-41269814(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr04G001090 Chr04 NC_080390.1:15621366-15621378promoter 内 1463-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 15617053-15618840(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCTTG
SmilChr05G000173 Chr05 NC_080391.1:1370462-1370474promoter 内 1400-1412 bp - 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 1365143-1367873(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACACA
SmilChr05G002069 Chr05 NC_080391.1:21547504-21547516promoter 内 1065-1077 bp + 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 21541680-21544580(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr03G000743 Chr03 NC_080389.1:8517618-8517630promoter 内 963-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 8471601-8514592(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr03G000616 Chr03 NC_080389.1:6814212-6814224promoter 内 873-885 bp + 3116 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 6809784-6811096(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAG
SmilChr01G000151 Chr01 NC_080387.1:2580525-2580537promoter 内 549-561 bp + 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 2583977-2585591(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr01G000315 Chr01 NC_080387.1:6075286-6075298promoter 内 192-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 6069699-6071489(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr05G002072 Chr05 NC_080391.1:21591557-21591569promoter 内 127-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 21595431-21597910(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr02G001562 Chr02 NC_080388.1:28889111-28889123promoter 内 79-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 28893033-28895362(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTAA
SmilChr01G000313 Chr01 NC_080387.1:6048614-6048626promoter 内 3940-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6045768-6048565(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTACA
SmilChr03G000617 Chr03 NC_080389.1:6814212-6814224promoter 内 3813-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6812419-6814036(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAG
SmilChr04G000822 Chr04 NC_080390.1:10317849-10317861promoter 内 3784-3796 bp + 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 10318066-10323022(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr02G000823 Chr02 NC_080388.1:13851134-13851146promoter 内 3737-3749 bp - 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 13851398-13852798(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAGG
SmilChr02G002941 Chr02 NC_080388.1:49911755-49911767promoter 内 3541-3553 bp + 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 49912215-49914291(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTATA
SmilChr02G000549 Chr02 NC_080388.1:7640741-7640753promoter 内 3423-3435 bp - 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 7641319-7646267(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGGC
SmilChr04G000819 Chr04 NC_080390.1:10278060-10278072promoter 内 3201-3213 bp - 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 10278860-10282884(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAG
SmilChr02G004843 Chr02 NC_080388.1:70558991-70559003promoter 内 2965-2977 bp + 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 70552265-70557967(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTAGC
SmilChr02G003121 Chr02 NC_080388.1:52222818-52222830promoter 内 2687-2699 bp + 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 52224132-52225238(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTGT
SmilChr02G000822 Chr02 NC_080388.1:13851134-13851146promoter 内 2165-2177 bp - 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 13837220-13849310(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTATA
SmilChr02G001459 Chr02 NC_080388.1:27290425-27290437promoter 内 1536-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27292890-27294003(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTGAA
SmilChr02G001463 Chr02 NC_080388.1:27324095-27324107promoter 内 1536-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27326560-27327765(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTGAA
SmilChr03G000624 Chr03 NC_080389.1:6926578-6926590promoter 内 862-874 bp - 3127 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6929717-6930621(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr02G000110 Chr02 NC_080388.1:1400114-1400126promoter 内 838-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1403277-1405878(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAAG
SmilChr02G000548 Chr02 NC_080388.1:7600717-7600729promoter 内 790-802 bp + 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 7596257-7597518(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG