转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 28 / 138 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001284 Chr02 NC_080388.1:23681381-23681393promoter 内 1939-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 23677852-23679331(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACAGC
SmilChr02G005526 Chr02 NC_080388.1:75330557-75330569promoter 内 1648-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 75327165-75328216(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACCACA
SmilChr02G003729 Chr02 NC_080388.1:58922829-58922841promoter 内 1460-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 58925370-58929358(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTTGA
SmilChr02G003356 Chr02 NC_080388.1:54721517-54721529promoter 内 1259-1271 bp - 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 54724259-54726747(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACCCA
SmilChr01G004762 Chr01 NC_080387.1:65801569-65801581promoter 内 1190-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 65797080-65798770(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGGTCAACGAG
SmilChr02G005187 Chr02 NC_080388.1:73179710-73179722promoter 内 1049-1061 bp - 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 73182662-73184352(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACCGA
SmilChr02G005588 Chr02 NC_080388.1:75670006-75670018promoter 内 376-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 75673631-75675457(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACCCA
SmilChr02G000304 Chr02 NC_080388.1:3845256-3845268promoter 内 127-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 3839067-3841394(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACTCTT
SmilChr01G001516 Chr01 NC_080387.1:29011150-29011162promoter 内 110-122 bp - 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 29002455-29007271(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACCCAA
SmilChr02G003355 Chr02 NC_080388.1:54721517-54721529promoter 内 3934-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 54721584-54723574(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACCCA
SmilChr03G002297 Chr03 NC_080389.1:36190245-36190257promoter 内 3796-3808 bp - 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 36185510-36190052(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCGGTTGACTTTT
SmilChr02G001285 Chr02 NC_080388.1:23681381-23681393promoter 内 3738-3750 bp + 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23679351-23681130(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACAGC
SmilChr03G003889 Chr03 NC_080389.1:57964059-57964071promoter 内 3548-3560 bp - 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 57961116-57963618(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTGTTGACTTTT
SmilChr01G004670 Chr01 NC_080387.1:64797917-64797929promoter 内 3139-3151 bp - 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 64795713-64797067(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACCTCC
SmilChr01G005658 Chr01 NC_080387.1:72931840-72931852promoter 内 3074-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 72929350-72930925(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGAC
SmilChr01G003721 Chr01 NC_080387.1:55533056-55533068promoter 内 2811-2823 bp - 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55534246-55537248(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAACGAG
SmilChr03G002259 Chr03 NC_080389.1:35583728-35583740promoter 内 2757-2769 bp - 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 35581768-35582496(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGGTTGACTGTT
SmilChr01G001778 Chr01 NC_080387.1:32665232-32665244promoter 内 2561-2573 bp + 1428 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 32666672-32668220(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACCAAC
SmilChr03G003237 Chr03 NC_080389.1:50271099-50271111promoter 内 2305-2317 bp - 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 50272795-50275365(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGAGTCAACGAC
SmilChr01G004160 Chr01 NC_080387.1:60096124-60096136promoter 内 2174-2186 bp - 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 60090743-60094309(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACTACC
SmilChr02G003802 Chr02 NC_080388.1:59653345-59653357promoter 内 2101-2113 bp + 1888 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 59655245-59658777(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTATA
SmilChr01G000354 Chr01 NC_080387.1:7341270-7341282promoter 内 1864-1876 bp - 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 7338112-7339145(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGTTGACTGTT
SmilChr01G000338 Chr01 NC_080387.1:6928704-6928716promoter 内 1706-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 6930999-6934624(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGGTCAACGAG
SmilChr01G003995 Chr01 NC_080387.1:58372834-58372846promoter 内 1683-1695 bp - 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 58367056-58370528(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTTGA
SmilChr01G004094 Chr01 NC_080387.1:59410226-59410238promoter 内 1680-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 59399844-59407917(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGAGTCAACGAC
SmilChr02G003463 Chr02 NC_080388.1:55920222-55920234promoter 内 1625-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55922598-55931701(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAGAC
SmilChr02G000305 Chr02 NC_080388.1:3845256-3845268promoter 内 1544-1556 bp - 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 3847713-3851771(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGAGTCAACGTA
SmilChr02G005586 Chr02 NC_080388.1:75670006-75670018promoter 内 1464-1476 bp - 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 75664446-75667481(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGGTTGACTGTT
SmilChr02G001222 Chr02 NC_080388.1:22440062-22440074promoter 内 1421-1433 bp + 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 22435815-22437494(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCAGTCAACCCT
SmilChr03G002389 Chr03 NC_080389.1:37821090-37821102promoter 内 998-1010 bp + 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 37824093-37830882(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTGGA
SmilChr01G005713 Chr01 NC_080387.1:73348631-73348643promoter 内 918-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 73341651-73345560(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACGGTTGACTGGA
SmilChr03G003240 Chr03 NC_080389.1:50309554-50309566promoter 内 477-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 50305301-50306042(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGAGTCAACGAC
SmilChr02G002955 Chr02 NC_080388.1:50084983-50084995promoter 内 337-349 bp + 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 50088647-50091298(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGTTGACTGTT
SmilChr02G001286 Chr02 NC_080388.1:23681381-23681393promoter 内 158-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23685224-23686315(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTGTTGACTGTT
SmilChr02G005186 Chr02 NC_080388.1:73179710-73179722promoter 内 138-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 73172860-73175859(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCGGTTGACTTTT
SmilChr02G004774 Chr02 NC_080388.1:69898657-69898669promoter 内 42-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 69902616-69903537(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACTAAC
SmilChr02G001709 Chr02 NC_080388.1:31485064-31485076promoter 内 561-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 7 31488504-31493193(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTCA
SmilChr03G002653 Chr03 NC_080389.1:42181403-42181415promoter 内 2789-2801 bp + 1200 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 42182615-42186970(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTCA
SmilChr03G002470 Chr03 NC_080389.1:39173255-39173267promoter 内 2295-2307 bp + 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 39174961-39175034(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTCA
SmilChr02G004640 Chr02 NC_080388.1:68855349-68855361promoter 内 1908-1920 bp + 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 68857442-68859086(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACTCCT
SmilChr02G000709 Chr02 NC_080388.1:11436340-11436352promoter 内 3368-3380 bp - 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 11436973-11442426(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCAGTCAACGGA
SmilChr03G002471 Chr03 NC_080389.1:39173255-39173267promoter 内 2190-2202 bp + 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 39175066-39178152(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTCA
SmilChr02G000690 Chr02 NC_080388.1:10995043-10995055promoter 内 1330-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 10997714-10999835(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTCA
SmilChr02G002880 Chr02 NC_080388.1:49056286-49056298promoter 内 1318-1330 bp - 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 49058969-49064452(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTAGTCAACCGT
SmilChr02G000688 Chr02 NC_080388.1:10967083-10967095promoter 内 79-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 10971005-10973024(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTCA
SmilChr02G002965 Chr02 NC_080388.1:50164115-50164127promoter 内 24-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 50168092-50171839(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTTAT
SmilChr01G004021 Chr01 NC_080387.1:58604950-58604962promoter 内 2775-2787 bp - 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 58606176-58610147(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGAGTCAACGTT
SmilChr02G003059 Chr02 NC_080388.1:51375748-51375760promoter 内 2619-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 51377130-51377952(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTGCA
SmilChr03G002906 Chr03 NC_080389.1:45815917-45815929promoter 内 2054-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 45809004-45813982(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTGAT
SmilChr01G001200 Chr01 NC_080387.1:24171978-24171990promoter 内 1615-1627 bp + 2374 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 24160292-24169604(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAAAGGT