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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 28 / 164 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001171 Chr04 NC_080390.1:17532080-17532094promoter 内 1125-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 17534956-17537932(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTAAATT
SmilChr05G003192 Chr05 NC_080391.1:40820734-40820748promoter 内 1123-1137 bp - 2864 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 40823612-40825571(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCTCACG
SmilChr05G004384 Chr05 NC_080391.1:57319780-57319794promoter 内 1083-1097 bp - 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 57322698-57323172(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCTAAT
SmilChr06G001246 Chr06 NC_080392.1:12912425-12912439promoter 内 847-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 12915579-12917067(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCAGACA
SmilChr02G001325 Chr02 NC_080388.1:24731294-24731308promoter 内 805-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 24734490-24735470(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCGACCT
SmilChr06G001620 Chr06 NC_080392.1:18042263-18042277promoter 内 328-342 bp - 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 18036985-18038604(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTGGGGTAGGTGCG
SmilChr02G002594 Chr02 NC_080388.1:45102909-45102923promoter 内 260-274 bp + 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 45096274-45099182(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCATCTT
SmilChr06G000631 Chr06 NC_080392.1:5574613-5574627promoter 内 60-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 5578554-5578892(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATGAGGTAGGTGGC
SmilChr03G004070 Chr03 NC_080389.1:59685077-59685091promoter 内 649-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 59680409-59681739(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTATAGTAGGTGGG
SmilChr01G001228 Chr01 NC_080387.1:24565275-24565289promoter 内 3981-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 24565295-24568092(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTCTC
SmilChr01G001227 Chr01 NC_080387.1:24555959-24555973promoter 内 3935-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 24556025-24558788(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTCTC
SmilChr04G000390 Chr04 NC_080390.1:3963196-3963210promoter 内 2360-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3964837-3972397(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCATGGT
SmilChr06G001507 Chr06 NC_080392.1:16101170-16101184promoter 内 2352-2366 bp - 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 16102819-16103547(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAACACCCA
SmilChr03G003557 Chr03 NC_080389.1:54221436-54221450promoter 内 2316-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 54218619-54219765(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTCTC
SmilChr03G003558 Chr03 NC_080389.1:54237741-54237755promoter 内 2316-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 54234924-54236070(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTCTC
SmilChr07G004739 Chr07 NC_080393.1:60243340-60243354promoter 内 2234-2248 bp + 1753 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 60245107-60248788(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGCTAGGTAGGTAGG
SmilChr04G002229 Chr04 NC_080390.1:36014130-36014144promoter 内 1704-1718 bp + 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 36009714-36011847(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCATGGT
SmilChr01G004114 Chr01 NC_080387.1:59666116-59666130promoter 内 1443-1457 bp + 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 59668674-59671246(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CATTTGGTAGGTAGG
SmilChr05G003111 Chr05 NC_080391.1:39640273-39640287promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 39637920-39640229(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGGGTAGTAGGTGAA
SmilChr07G004738 Chr07 NC_080393.1:60243340-60243354promoter 内 3914-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 60240955-60243267(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCTAGCT
SmilChr02G002424 Chr02 NC_080388.1:42214948-42214962promoter 内 3905-3919 bp - 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 42215044-42219166(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCAACTACCAACAA
SmilChr04G003717 Chr04 NC_080390.1:53477424-53477438promoter 内 3712-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 53477713-53481957(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCCACAA
SmilChr06G000590 Chr06 NC_080392.1:5081303-5081317promoter 内 3580-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 5079450-5080896(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTAGTAGGTGAG
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SmilChr01G006092 Chr01 NC_080387.1:76403607-76403621promoter 内 3451-3465 bp - 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 76400229-76403071(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCGAGGTAGGTGAA
SmilChr02G004538 Chr02 NC_080388.1:67956858-67956872promoter 内 3228-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 67957631-67960798(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCATGGTAGGTGGA
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SmilChr07G002505 Chr07 NC_080393.1:23766856-23766870promoter 内 2544-2558 bp + 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 23768313-23772345(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTTGGGTAGGTGAA
SmilChr07G000304 Chr07 NC_080393.1:1997299-1997313promoter 内 2389-2403 bp + 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1998911-2002862(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTGTGAGTAGGTGGG
SmilChr01G001189 Chr01 NC_080387.1:24048109-24048123promoter 内 1812-1826 bp + 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 24044763-24045934(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTCCGC
SmilChr08G001939 Chr08 NC_080394.1:17026781-17026795promoter 内 1694-1708 bp - 2293 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 17023351-17024488(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAAAAGGTAGGTGGA
SmilChr02G000384 Chr02 NC_080388.1:4791622-4791636promoter 内 1662-1676 bp - 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 4793961-4795480(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCATGGT
SmilChr04G003132 Chr04 NC_080390.1:47913392-47913406promoter 内 1524-1538 bp + 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 47908485-47910929(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCCCTGA
SmilChr03G002113 Chr03 NC_080389.1:32889951-32889965promoter 内 1427-1441 bp - 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 32887286-32887391(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCGTTGGTAGGTGGC
SmilChr07G000301 Chr07 NC_080393.1:1983803-1983817promoter 内 1385-1399 bp + 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1979802-1981201(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCACAC
SmilChr07G001934 Chr07 NC_080393.1:16743598-16743612promoter 内 1377-1391 bp - 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 16739299-16740988(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGAGGGTAGGTGGC
SmilChr07G003271 Chr07 NC_080393.1:34480607-34480621promoter 内 1304-1318 bp - 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 34472958-34477924(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTGGTGTTAGGTGAG
SmilChr06G002823 Chr06 NC_080392.1:40977924-40977938promoter 内 1018-1032 bp + 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 40980907-40988540(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTGATGGTAGGTGCG
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SmilChr08G000469 Chr08 NC_080394.1:3331372-3331386promoter 内 892-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3334481-3336677(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CATTTGGTAGGTAGG
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SmilChr05G000167 Chr05 NC_080391.1:1323413-1323427promoter 内 884-898 bp - 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1326530-1330586(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCCACCC
SmilChr03G003472 Chr03 NC_080389.1:53212893-53212907promoter 内 764-778 bp + 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 53204994-53209670(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCCACCG
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SmilChr01G005384 Chr01 NC_080387.1:71127122-71127136promoter 内 187-201 bp - 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 71121235-71123322(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTGTAGTAGGTGAG
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SmilChr02G000549 Chr02 NC_080388.1:7640739-7640753promoter 内 3421-3435 bp + 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 7641319-7646267(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATTAGGTAGGTGGC
SmilChr08G002439 Chr08 NC_080394.1:23225275-23225289promoter 内 2967-2981 bp + 1020 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 23221433-23224255(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCCCCTC