转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 29 / 151 下载 TSV

上一页 29 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002221 Chr01 NC_080387.1:38611177-38611189promoter 内 814-826 bp - 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 38614364-38618732(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATAGTAGGTAAG
SmilChr02G001667 Chr02 NC_080388.1:30941704-30941716promoter 内 757-769 bp + 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 30944948-30946979(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr02G004952 Chr02 NC_080388.1:71479851-71479863promoter 内 609-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 71483243-71487460(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr01G003006 Chr01 NC_080387.1:49098322-49098334promoter 内 3974-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 49098349-49102127(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTAAA
SmilChr04G002675 Chr04 NC_080390.1:42197910-42197922promoter 内 3974-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 42197937-42202533(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr01G004979 Chr01 NC_080387.1:67843887-67843899promoter 内 3857-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 67844031-67848404(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr02G005455 Chr02 NC_080388.1:74878978-74878990promoter 内 3857-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 74879122-74883586(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr02G004806 Chr02 NC_080388.1:70230831-70230843promoter 内 3851-3863 bp + 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 70225492-70230693(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTAAA
SmilChr04G003443 Chr04 NC_080390.1:50947137-50947149promoter 内 3769-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 50945181-50946917(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G002661 Chr02 NC_080388.1:46081932-46081944promoter 内 3562-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 46070906-46081505(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAACATC
SmilChr03G002973 Chr03 NC_080389.1:46526844-46526856promoter 内 3522-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 46524990-46526377(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr05G001662 Chr05 NC_080391.1:15727327-15727339promoter 内 3521-3533 bp - 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 15727807-15729588(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTAAA
SmilChr04G000096 Chr04 NC_080390.1:871335-871347promoter 内 3400-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 871936-875416(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGTTAGGTAAG
SmilChr04G001079 Chr04 NC_080390.1:15469468-15469480promoter 内 3344-3356 bp + 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 15470125-15473921(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr04G000810 Chr04 NC_080390.1:10130966-10130978promoter 内 3170-3182 bp + 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 10128874-10130147(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAG
SmilChr03G000476 Chr03 NC_080389.1:5048836-5048848promoter 内 3044-3056 bp + 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 5047238-5047891(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAAGTAGGTAAA
SmilChr02G001881 Chr02 NC_080388.1:34126531-34126543promoter 内 3027-3039 bp + 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 34127505-34128953(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr04G000811 Chr04 NC_080390.1:10130966-10130978promoter 内 3009-3021 bp + 980 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 10131958-10141812(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCA
SmilChr02G002842 Chr02 NC_080388.1:48541897-48541909promoter 内 2985-2997 bp + 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 48539710-48540893(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGTTAGGTAAG
SmilChr01G003939 Chr01 NC_080387.1:57723473-57723485promoter 内 2888-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 57724586-57724936(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGAGTAGGTAGG
SmilChr02G002552 Chr02 NC_080388.1:44415775-44415787promoter 内 2762-2774 bp - 1227 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 44412869-44414548(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr02G001770 Chr02 NC_080388.1:32455864-32455876promoter 内 2654-2666 bp - 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32453541-32454529(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr01G001201 Chr01 NC_080387.1:24212783-24212795promoter 内 2653-2665 bp + 1336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 24214131-24217214(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr05G000304 Chr05 NC_080391.1:2310607-2310619promoter 内 2538-2550 bp - 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2312070-2313698(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTAGC
SmilChr01G005449 Chr01 NC_080387.1:71557601-71557613promoter 内 2504-2516 bp + 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 71559098-71562935(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCA
SmilChr02G004015 Chr02 NC_080388.1:62449247-62449259promoter 内 2504-2516 bp + 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 62450744-62453944(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTAC
SmilChr04G002457 Chr04 NC_080390.1:39368238-39368250promoter 内 2471-2483 bp + 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 39369768-39372681(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTAAT
SmilChr02G002946 Chr02 NC_080388.1:49992803-49992815promoter 内 2148-2160 bp - 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 49990033-49990962(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr01G005052 Chr01 NC_080387.1:68468022-68468034promoter 内 2088-2100 bp + 1901 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 68469935-68470707(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr03G003500 Chr03 NC_080389.1:53615725-53615737promoter 内 1859-1871 bp + 2130 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 53617867-53619696(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr02G002369 Chr02 NC_080388.1:41474138-41474150promoter 内 1735-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 41471010-41471884(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G002841 Chr02 NC_080388.1:48541897-48541909promoter 内 1701-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 48537649-48539609(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGTTAGGTAAG
SmilChr02G004014 Chr02 NC_080388.1:62449247-62449259promoter 内 1579-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 62444752-62446837(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAAGTAGGTAAA
SmilChr05G001661 Chr05 NC_080391.1:15727327-15727339promoter 内 1328-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 15722574-15724666(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAG
SmilChr05G000303 Chr05 NC_080391.1:2310607-2310619promoter 内 1245-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2307424-2307863(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTTTC
SmilChr01G000775 Chr01 NC_080387.1:16875139-16875151promoter 内 1142-1154 bp + 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 16869258-16872292(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G005454 Chr02 NC_080388.1:74878978-74878990promoter 内 1120-1132 bp + 2869 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 74873062-74876109(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAAGTAGGTAAA
SmilChr01G000647 Chr01 NC_080387.1:14452519-14452531promoter 内 1033-1045 bp + 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 14448406-14449563(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGC
SmilChr04G003444 Chr04 NC_080390.1:50952558-50952570promoter 内 1001-1013 bp + 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 50955558-50956148(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr04G002161 Chr04 NC_080390.1:34796469-34796481promoter 内 964-976 bp - 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 34789902-34793444(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACCGTT
SmilChr04G003274 Chr04 NC_080390.1:49433328-49433340promoter 内 958-970 bp - 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 49436371-49436477(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAAGTAGGTAGC
SmilChr02G001880 Chr02 NC_080388.1:34126531-34126543promoter 内 866-878 bp + 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 34122199-34123408(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGC
SmilChr01G002147 Chr01 NC_080387.1:37465838-37465850promoter 内 832-844 bp - 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 37456800-37462681(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTACG
SmilChr01G005053 Chr01 NC_080387.1:68468022-68468034promoter 内 655-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 68471368-68474383(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCGCA
SmilChr02G004804 Chr02 NC_080388.1:70224706-70224718promoter 内 378-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 70217075-70221095(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTAAA
SmilChr04G001086 Chr04 NC_080390.1:15572178-15572190promoter 内 222-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 15565338-15568411(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAG
SmilChr01G005072 Chr01 NC_080387.1:68595963-68595975promoter 内 177-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 68599787-68603091(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G005043 Chr02 NC_080388.1:72154388-72154400promoter 内 24-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 72146367-72150423(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATAGTAGGTAGG
SmilChr02G001042 Chr02 NC_080388.1:18492274-18492286promoter 内 298-310 bp - 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 18495977-18498415(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGTTAGGTAAA
SmilChr04G003875 Chr04 NC_080390.1:54632571-54632583promoter 内 721-733 bp + 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 54626923-54629303(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGTTAGGTAAA