转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020124-RA_Salv SmilChr01G001885 WRKY XP_057806790.1 MP00171 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9833 个结合位点 7182 个候选靶基因 第 3 / 144 下载 TSV

上一页 3 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003197 Chr01 NC_080387.1:50739927-50739939promoter 内 3079-3091 bp + 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 50734261-50739017(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G001631 Chr04 NC_080390.1:27056241-27056253promoter 内 2956-2968 bp - 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 27053956-27055208(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAAGTCAACGGT
SmilChr01G002359 Chr01 NC_080387.1:40760087-40760099promoter 内 2947-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 40761141-40763492(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G001748 Chr01 NC_080387.1:32220203-32220215promoter 内 2803-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 32221401-32235748(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr02G002806 Chr02 NC_080388.1:48133682-48133694promoter 内 2725-2737 bp + 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 48125601-48132418(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTTTC
SmilChr04G003174 Chr04 NC_080390.1:48424424-48424436promoter 内 2522-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 48417993-48422957(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr04G001982 Chr04 NC_080390.1:32094119-32094131promoter 内 2441-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 32090842-32092571(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G000630 Chr01 NC_080387.1:14082392-14082404promoter 内 2287-2299 bp + 1702 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 14084106-14086762(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAAGTCAACGGT
SmilChr01G004066 Chr01 NC_080387.1:59073658-59073670promoter 内 2270-2282 bp + 1719 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 59070817-59071939(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTTTC
SmilChr01G004958 Chr01 NC_080387.1:67676798-67676810promoter 内 2229-2241 bp - 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 67678570-67681247(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G001681 Chr04 NC_080390.1:27828957-27828969promoter 内 2064-2076 bp - 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 27830894-27831947(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G002850 Chr02 NC_080388.1:48679882-48679894promoter 内 2041-2053 bp + 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 48674009-48677934(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G001749 Chr01 NC_080387.1:32220203-32220215promoter 内 1791-1803 bp + 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 32222413-32224941(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr01G003391 Chr01 NC_080387.1:52626793-52626805promoter 内 1726-1738 bp - 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 52629068-52631558(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G001630 Chr04 NC_080390.1:27056241-27056253promoter 内 1688-1700 bp - 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 27053011-27053940(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAAGTCAACGGT
SmilChr02G001984 Chr02 NC_080388.1:35784000-35784012promoter 内 1606-1618 bp + 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 35779820-35781617(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GACGTTGACTTTG
SmilChr03G004002 Chr03 NC_080389.1:59043296-59043308promoter 内 1567-1579 bp + 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 59045730-59048398(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr04G002397 Chr04 NC_080390.1:38530384-38530396promoter 内 1353-1365 bp - 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 38524132-38527748(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr01G003826 Chr01 NC_080387.1:56591295-56591307promoter 内 1306-1318 bp - 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 56593990-56598392(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G003836 Chr01 NC_080387.1:56715166-56715178promoter 内 1299-1311 bp + 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 56708052-56712476(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G002786 Chr01 NC_080387.1:46335173-46335185promoter 内 1184-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 46331419-46332368(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G005187 Chr01 NC_080387.1:69583686-69583698promoter 内 1182-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 69586505-69589186(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G004010 Chr01 NC_080387.1:58510505-58510517promoter 内 836-848 bp - 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 58513670-58514897(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G003089 Chr04 NC_080390.1:47512626-47512638promoter 内 644-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 47515983-47517462(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr02G000788 Chr02 NC_080388.1:12955973-12955985promoter 内 553-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 12959421-12959777(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G003577 Chr01 NC_080387.1:54364949-54364961promoter 内 527-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 54360728-54361487(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G001983 Chr04 NC_080390.1:32094481-32094493promoter 内 451-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 32098031-32108776(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G002525 Chr01 NC_080387.1:43221245-43221257promoter 内 415-427 bp - 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 43224831-43231129(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G004771 Chr02 NC_080388.1:69891711-69891723promoter 内 410-422 bp + 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 69880677-69888132(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G003714 Chr02 NC_080388.1:58747089-58747101promoter 内 343-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 58741135-58743443(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr03G004737 Chr03 NC_080389.1:64506606-64506618promoter 内 330-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 64495204-64502947(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G002486 Chr02 NC_080388.1:43278949-43278961promoter 内 302-314 bp - 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 43282648-43284698(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G000807 Chr02 NC_080388.1:13506351-13506363promoter 内 236-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 13498082-13502598(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTTTC
SmilChr02G000808 Chr02 NC_080388.1:13543500-13543512promoter 内 236-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 13535231-13539747(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTTTC
SmilChr04G000439 Chr04 NC_080390.1:4647793-4647805promoter 内 3820-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 4647974-4659034(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G003968 Chr02 NC_080388.1:61824706-61824718promoter 内 3701-3713 bp + 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 61823186-61824418(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G002451 Chr04 NC_080390.1:39230317-39230329promoter 内 3695-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 39230623-39236288(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTTTC
SmilChr01G004471 Chr01 NC_080387.1:62805072-62805084promoter 内 3693-3705 bp + 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 62801628-62804776(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr02G003126 Chr02 NC_080388.1:52291479-52291491promoter 内 3618-3630 bp + 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 52291862-52296540(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAAGTCAACGGT
SmilChr01G002760 Chr01 NC_080387.1:46001253-46001265promoter 内 3507-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 46001747-46006775(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G001821 Chr01 NC_080387.1:33150081-33150093promoter 内 3378-3390 bp + 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 33147058-33149470(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G002344 Chr04 NC_080390.1:37802196-37802208promoter 内 3347-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 37802850-37807900(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr04G003131 Chr04 NC_080390.1:47906050-47906062promoter 内 3318-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 47903741-47905379(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr01G002447 Chr01 NC_080387.1:42064077-42064089promoter 内 3260-3272 bp + 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 42058999-42063348(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr04G002097 Chr04 NC_080390.1:33806829-33806841promoter 内 2994-3006 bp + 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 33807836-33814671(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr03G000014 Chr03 NC_080389.1:142568-142580promoter 内 2980-2992 bp + 1009 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 143589-147616(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr04G000158 Chr04 NC_080390.1:1383036-1383048promoter 内 2938-2950 bp + 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 1379306-1381985(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTT
SmilChr03G003355 Chr03 NC_080389.1:51865594-51865606promoter 内 2815-2827 bp - 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 51866780-51873414(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTTTC
SmilChr04G000159 Chr04 NC_080390.1:1383036-1383048promoter 内 2729-2741 bp + 1260 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 1384308-1388081(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACGAT
SmilChr01G000552 Chr01 NC_080387.1:11498198-11498210promoter 内 2532-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 11499667-11501535(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAAGTCAACGGT