转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 3 / 143 下载 TSV

上一页 3 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005291 Chr01 NC_080387.1:70231170-70231181promoter 内 3290-3301 bp + 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 70231881-70234315(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTC
SmilChr07G003771 Chr07 NC_080393.1:46135271-46135282promoter 内 3000-3011 bp - 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 46136272-46148760(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAA
SmilChr08G000198 Chr08 NC_080394.1:1329533-1329544promoter 内 2773-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 1327129-1328316(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGA
SmilChr02G001373 Chr02 NC_080388.1:25976897-25976908promoter 内 2621-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 25972695-25975528(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAG
SmilChr01G003170 Chr01 NC_080387.1:50505297-50505308promoter 内 2587-2598 bp + 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 50497360-50503894(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAT
SmilChr05G000482 Chr05 NC_080391.1:3776731-3776742promoter 内 2278-2289 bp - 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 3771787-3775019(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGA
SmilChr04G000840 Chr04 NC_080390.1:10615272-10615283promoter 内 1884-1895 bp - 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 10612622-10613166(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTC
SmilChr03G002582 Chr03 NC_080389.1:41082095-41082106promoter 内 1746-1757 bp - 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 41084350-41090165(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAT
SmilChr02G004817 Chr02 NC_080388.1:70307604-70307615promoter 内 1274-1285 bp - 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 70310331-70311582(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAT
SmilChr03G003226 Chr03 NC_080389.1:49935272-49935283promoter 内 1138-1149 bp - 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 49938135-49940369(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAG
SmilChr01G002453 Chr01 NC_080387.1:42141983-42141994promoter 内 1076-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 42133849-42139069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCGC
SmilChr08G000197 Chr08 NC_080394.1:1329533-1329544promoter 内 712-723 bp - 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 1325100-1326255(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGA
SmilChr03G004053 Chr03 NC_080389.1:59492102-59492113promoter 内 562-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 59483245-59488674(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAT
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28412172-28412183promoter 内 218-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 28415955-28416551(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAG
SmilChr02G001554 Chr02 NC_080388.1:28831603-28831614promoter 内 2624-2635 bp + 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 5 28829675-28830237(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr03G003723 Chr03 NC_080389.1:56251614-56251625promoter 内 3271-3282 bp - 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 4 56248694-56250895(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGA
SmilChr08G003256 Chr08 NC_080394.1:33512403-33512414promoter 内 2623-2634 bp - 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 4 33513781-33519706(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAT
SmilChr03G002474 Chr03 NC_080389.1:39203674-39203685promoter 内 1202-1213 bp - 2788 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 4 39195515-39200886(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTA
SmilChr02G000045 Chr02 NC_080388.1:614194-614205promoter 内 3851-3862 bp - 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 611725-614055(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGA
SmilChr07G001023 Chr07 NC_080393.1:7438526-7438537promoter 内 3801-3812 bp + 189 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 7436791-7438337(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAT
SmilChr03G004330 Chr03 NC_080389.1:61654288-61654299promoter 内 3231-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 61645624-61653529(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr03G000717 Chr03 NC_080389.1:7958298-7958309promoter 内 2761-2772 bp - 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 7959538-7962296(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAT
SmilChr02G000991 Chr02 NC_080388.1:17434626-17434637promoter 内 1184-1195 bp + 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 17430722-17431820(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAC
SmilChr03G000716 Chr03 NC_080389.1:7958298-7958309promoter 内 308-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 7953867-7954616(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGA
SmilChr01G003271 Chr01 NC_080387.1:51423094-51423105promoter 内 3872-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 51423223-51427377(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr06G001401 Chr06 NC_080392.1:14662478-14662489promoter 内 3763-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 14662716-14664472(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr06G001364 Chr06 NC_080392.1:14221925-14221936promoter 内 3575-3586 bp - 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 14222351-14223919(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr08G000809 Chr08 NC_080394.1:5961419-5961430promoter 内 3245-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 5962175-5964349(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTA
SmilChr01G003187 Chr01 NC_080387.1:50621509-50621520promoter 内 3207-3218 bp - 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 50614422-50620726(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGA
SmilChr08G000808 Chr08 NC_080394.1:5961419-5961430promoter 内 3200-3211 bp + 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 5954832-5960629(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr01G003731 Chr01 NC_080387.1:55607707-55607718promoter 内 2747-2758 bp - 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 55603656-55606464(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTA
SmilChr07G003509 Chr07 NC_080393.1:40004294-40004305promoter 内 2460-2471 bp + 1530 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 40001321-40002764(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr06G000133 Chr06 NC_080392.1:938143-938154promoter 内 2010-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 935045-936163(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAT
SmilChr04G000957 Chr04 NC_080390.1:12672452-12672463promoter 内 1852-1863 bp - 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 12674601-12675732(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr08G002033 Chr08 NC_080394.1:18118558-18118569promoter 内 1718-1729 bp + 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 18114874-18116286(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAA
SmilChr05G003022 Chr05 NC_080391.1:37757817-37757828promoter 内 1693-1704 bp - 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 37760125-37763087(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAT
SmilChr08G000810 Chr08 NC_080394.1:5961419-5961430promoter 内 287-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 5965133-5969214(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTA
SmilChr07G002130 Chr07 NC_080393.1:19476047-19476058promoter 内 2158-2169 bp + 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 19469141-19474215(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAC
SmilChr07G002131 Chr07 NC_080393.1:19476047-19476058promoter 内 951-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 19479097-19485668(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGG
SmilChr03G001241 Chr03 NC_080389.1:14298713-14298724promoter 内 3126-3137 bp - 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 3 14296983-14297849(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTA
SmilChr05G000867 Chr05 NC_080391.1:6864334-6864345promoter 内 2849-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 3 6865486-6866897(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAC
SmilChr05G002535 Chr05 NC_080391.1:28308269-28308280promoter 内 309-320 bp + 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 3 28281760-28304588(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAT
SmilChr05G003322 Chr05 NC_080391.1:43522745-43522756promoter 内 3978-3989 bp + 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 43521927-43522733(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAC
SmilChr03G001524 Chr03 NC_080389.1:18763887-18763898promoter 内 3701-3712 bp - 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 18756055-18763598(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTA
SmilChr01G001737 Chr01 NC_080387.1:31975625-31975636promoter 内 3429-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 31973353-31975064(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTA
SmilChr01G002246 Chr01 NC_080387.1:39063487-39063498promoter 内 3408-3419 bp - 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 39064080-39065250(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAC
SmilChr01G002247 Chr01 NC_080387.1:39076873-39076884promoter 内 3408-3419 bp - 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 39077466-39078636(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAC
SmilChr02G002778 Chr02 NC_080388.1:47876048-47876059promoter 内 2394-2405 bp + 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 47873738-47874452(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAC
SmilChr01G003163 Chr01 NC_080387.1:50439338-50439349promoter 内 1914-1925 bp + 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 50441425-50448394(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTA
SmilChr02G003326 Chr02 NC_080388.1:54528522-54528533promoter 内 1605-1616 bp - 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 54523480-54526137(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGT