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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 3 / 138 下载 TSV

上一页 3 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003130 Chr04 NC_080390.1:47904215-47904229promoter 内 2348-2362 bp - 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 47902505-47902576(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGAGGCGACGTGGCG
SmilChr06G000192 Chr06 NC_080392.1:1332317-1332331promoter 内 2004-2018 bp + 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 1326955-1330334(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCCCCC
SmilChr06G001394 Chr06 NC_080392.1:14581853-14581867promoter 内 1873-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 14583981-14587757(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCGCCCCA
SmilChr02G002920 Chr02 NC_080388.1:49511964-49511978promoter 内 1058-1072 bp + 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 49508532-49509035(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCGCCTTG
SmilChr04G003129 Chr04 NC_080390.1:47904215-47904229promoter 内 583-597 bp - 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 47897872-47900811(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGAGGCGACGTGGCG
SmilChr06G001679 Chr06 NC_080392.1:19065365-19065379promoter 内 3589-3603 bp + 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 19063937-19064967(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGGCCCTC
SmilChr06G001680 Chr06 NC_080392.1:19065365-19065379promoter 内 1249-1263 bp + 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 19068117-19073100(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GAGGGCCACGTGGCG
SmilChr06G002301 Chr06 NC_080392.1:33245400-33245414promoter 内 2753-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 33241591-33244166(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCTCCATT
SmilChr05G002225 Chr05 NC_080391.1:23779693-23779707promoter 内 1562-1576 bp + 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 23782132-23783671(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGGGTGACGTGGCA
SmilChr03G000967 Chr03 NC_080389.1:10938187-10938201promoter 内 1687-1701 bp + 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 10940501-10942103(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATGGAGACGTGGCA
SmilChr03G001651 Chr03 NC_080389.1:21453758-21453772promoter 内 1255-1269 bp + 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 21449896-21451026(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCAGC
SmilChr06G002338 Chr06 NC_080392.1:33971635-33971649promoter 内 150-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 33975486-33976604(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATGGAGACGTGGCA
SmilChr07G000857 Chr07 NC_080393.1:6102969-6102983promoter 内 3228-3242 bp - 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 6103742-6108402(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGACCTAA
SmilChr08G001839 Chr08 NC_080394.1:15777891-15777905promoter 内 2372-2386 bp - 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 15779520-15782000(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCGCCTAG
SmilChr03G002679 Chr03 NC_080389.1:42582969-42582983promoter 内 2256-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 42584714-42588608(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCACCCAT
SmilChr01G000692 Chr01 NC_080387.1:15534497-15534511promoter 内 1424-1438 bp + 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 15537074-15537938(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATGGAGACGTGGCA
SmilChr02G002948 Chr02 NC_080388.1:50010851-50010865promoter 内 940-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 50013912-50014415(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCGCCTAG
SmilChr06G001525 Chr06 NC_080392.1:16440619-16440633promoter 内 365-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 16435999-16436997(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTGGCTGACGTGGCA
SmilChr04G003532 Chr04 NC_080390.1:51671992-51672006promoter 内 38-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 51667972-51668043(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCCAC
SmilChr03G001084 Chr03 NC_080389.1:12548490-12548504promoter 内 2251-2265 bp - 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 5 12550240-12551313(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCACCTTG
SmilChr06G000980 Chr06 NC_080392.1:9562759-9562773promoter 内 3955-3969 bp - 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 4 9561641-9562727(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGAGGTGACGTGGCA
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SmilChr01G004242 Chr01 NC_080387.1:60728019-60728033promoter 内 226-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 4 60723333-60724258(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCGTC
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SmilChr08G003725 Chr08 NC_080394.1:41972255-41972269promoter 内 3699-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 41972557-41977123(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCACCTCG
SmilChr08G003155 Chr08 NC_080394.1:32055820-32055834promoter 内 3538-3552 bp - 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 32053754-32055371(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CAAGGTGACGTGGCA
SmilChr02G003766 Chr02 NC_080388.1:59362142-59362156promoter 内 1246-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 59364897-59366076(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CAAGGTGACGTGGCA
SmilChr03G003733 Chr03 NC_080389.1:56367426-56367440promoter 内 1157-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 56361768-56364596(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCACCTTG
SmilChr02G004221 Chr02 NC_080388.1:64421227-64421241promoter 内 847-861 bp + 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 64424381-64430938(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGGGGAGACGTGGCA
SmilChr08G000551 Chr08 NC_080394.1:4006538-4006552promoter 内 769-783 bp + 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 4001465-4003320(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCGTC
SmilChr01G001646 Chr01 NC_080387.1:30523864-30523878promoter 内 3777-3791 bp - 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 30524088-30530209(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr04G001834 Chr04 NC_080390.1:29892678-29892692promoter 内 3288-3302 bp + 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 29890969-29891979(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr03G000260 Chr03 NC_080389.1:3042969-3042983promoter 内 3219-3233 bp + 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 3038683-3042201(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCACCTCG
SmilChr08G003407 Chr08 NC_080394.1:35995916-35995930promoter 内 1053-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 35990870-35992982(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr02G005026 Chr02 NC_080388.1:71999211-71999225promoter 内 652-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 72002560-72007132(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAAGCTGACGTGGCA
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SmilChr08G004425 Chr08 NC_080394.1:53943593-53943607promoter 内 3713-3727 bp - 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 53941775-53943319(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CAAGGTGACGTGGCA
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SmilChr04G003993 Chr04 NC_080390.1:55322200-55322214promoter 内 3633-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 55322568-55324194(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAAGCTGACGTGGCA
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SmilChr08G002947 Chr08 NC_080394.1:29477471-29477485promoter 内 3166-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 29475026-29476650(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr04G001484 Chr04 NC_080390.1:24270269-24270283promoter 内 3093-3107 bp - 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 24271177-24288406(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAGCCCT
SmilChr08G004334 Chr08 NC_080394.1:52999986-53000000promoter 内 2951-2965 bp - 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 52995227-52998950(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GATGCTGACGTGGCG
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SmilChr05G000929 Chr05 NC_080391.1:7447090-7447104promoter 内 2599-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 7448492-7450287(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr02G002493 Chr02 NC_080388.1:43372431-43372445promoter 内 2495-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 43367254-43370939(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAAGCTGACGTGGCA