转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 30 / 149 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003362 Chr03 NC_080389.1:51964980-51964994promoter 内 3980-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51963163-51964973(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAATTC
SmilChr02G000687 Chr02 NC_080388.1:10875382-10875396promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10875440-10876560(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTAGATAAGGTG
SmilChr01G004777 Chr01 NC_080387.1:65952400-65952414promoter 内 3931-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 65947874-65952344(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr04G001030 Chr04 NC_080390.1:14572048-14572062promoter 内 3900-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14572149-14573445(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCAATTT
SmilChr03G004049 Chr03 NC_080389.1:59462029-59462043promoter 内 3805-3819 bp + 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59462225-59464669(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr03G000958 Chr03 NC_080389.1:10828576-10828590promoter 内 3782-3796 bp - 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10828795-10831314(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATATTGGATAAGAAA
SmilChr01G003363 Chr01 NC_080387.1:52378035-52378049promoter 内 3724-3738 bp - 263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52376428-52377772(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT
SmilChr04G000126 Chr04 NC_080390.1:1071248-1071262promoter 内 3696-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1067777-1070957(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGATTGGATAATGTA
SmilChr01G004025 Chr01 NC_080387.1:58657874-58657888promoter 内 3691-3705 bp - 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 58656647-58657578(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT
SmilChr03G002525 Chr03 NC_080389.1:40253021-40253035promoter 内 3650-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40253372-40253490(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAATTC
SmilChr02G000600 Chr02 NC_080388.1:8669663-8669677promoter 内 3639-3653 bp - 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8665607-8669315(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAATTC
SmilChr02G005457 Chr02 NC_080388.1:74888982-74888996promoter 内 3574-3588 bp + 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 74889409-74896486(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAATTC
SmilChr04G001602 Chr04 NC_080390.1:26712922-26712936promoter 内 3547-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 26708275-26712482(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAACTGGATAATGTT
SmilChr03G000760 Chr03 NC_080389.1:8688282-8688296promoter 内 3475-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8688808-8713050(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATAAA
SmilChr02G003195 Chr02 NC_080388.1:53113033-53113047promoter 内 3427-3441 bp - 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53109246-53112473(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCACATT
SmilChr03G004039 Chr03 NC_080389.1:59392392-59392406promoter 内 3415-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59392978-59400855(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCTTTAAG
SmilChr04G000981 Chr04 NC_080390.1:13222338-13222352promoter 内 3292-3306 bp - 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 13215837-13221643(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT
SmilChr02G003369 Chr02 NC_080388.1:54819044-54819058promoter 内 3222-3236 bp - 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54812407-54818279(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TCCCTTATCCACTAA
SmilChr03G001962 Chr03 NC_080389.1:28110746-28110760promoter 内 3127-3141 bp - 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28111620-28116633(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAAGTGGATAATGCT
SmilChr03G002526 Chr03 NC_080389.1:40253021-40253035promoter 内 3118-3132 bp + 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40253904-40254022(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAATTC
SmilChr02G002520 Chr02 NC_080388.1:43779749-43779763promoter 内 3059-3073 bp - 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 43776311-43778821(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr01G003737 Chr01 NC_080387.1:55698350-55698364promoter 内 2983-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 55699368-55701398(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTGGATAACATT
SmilChr02G002046 Chr02 NC_080388.1:36864474-36864488promoter 内 2828-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 36865647-36866610(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr03G001016 Chr03 NC_080389.1:11675667-11675681promoter 内 2785-2799 bp - 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 11676883-11677709(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTGGATAACATT
SmilChr02G003705 Chr02 NC_080388.1:58579030-58579044promoter 内 2701-2715 bp - 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 58576139-58577744(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACTCTTATCCATAAT
SmilChr02G001238 Chr02 NC_080388.1:22749014-22749028promoter 内 2685-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 22750330-22751232(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTGAGGATAAGAAT
SmilChr01G005238 Chr01 NC_080387.1:69945313-69945327promoter 内 2631-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69941803-69943957(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT
SmilChr02G004942 Chr02 NC_080388.1:71365449-71365463promoter 内 2609-2623 bp - 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 71366841-71374911(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATAACACT
SmilChr02G000108 Chr02 NC_080388.1:1381811-1381825promoter 内 2481-2495 bp - 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1377569-1380305(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCACATG
SmilChr04G002808 Chr04 NC_080390.1:44008094-44008108promoter 内 2426-2440 bp + 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44009669-44011722(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr02G001711 Chr02 NC_080388.1:31505289-31505303promoter 内 2394-2408 bp - 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 31506896-31507943(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAATAGGATAAGGAA
SmilChr03G003378 Chr03 NC_080389.1:52120118-52120132promoter 内 2374-2388 bp - 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52121745-52127255(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGTGGATAATGAA
SmilChr02G001518 Chr02 NC_080388.1:28292811-28292825promoter 内 2313-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28294499-28302957(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT
SmilChr04G001356 Chr04 NC_080390.1:22045986-22046000promoter 内 2183-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 22040387-22044182(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT
SmilChr03G003179 Chr03 NC_080389.1:49249266-49249280promoter 内 2163-2177 bp - 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49251104-49254743(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAAAATT
SmilChr01G000946 Chr01 NC_080387.1:20055906-20055920promoter 内 2113-2127 bp + 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 20051545-20054032(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTGGATAACATT
SmilChr02G003952 Chr02 NC_080388.1:61684424-61684438promoter 内 2083-2097 bp + 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 61681594-61682520(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATAAAGTC
SmilChr01G006135 Chr01 NC_080387.1:76862572-76862586promoter 内 2039-2053 bp + 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 76864534-76865619(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCATTATCCACAAC
SmilChr02G002321 Chr02 NC_080388.1:40882587-40882601promoter 内 2032-2046 bp - 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40878014-40880632(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATATA
SmilChr01G001563 Chr01 NC_080387.1:29634180-29634194promoter 内 1823-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29636358-29637532(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCTATTG
SmilChr02G005602 Chr02 NC_080388.1:75737637-75737651promoter 内 1794-1808 bp - 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 75732133-75735444(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTTATCCTGAAC
SmilChr01G005240 Chr01 NC_080387.1:69951438-69951452promoter 内 1725-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69953714-69954297(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTGGATAACATT
SmilChr04G000257 Chr04 NC_080390.1:2344930-2344944promoter 内 1665-1679 bp - 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2341092-2342608(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr02G002165 Chr02 NC_080388.1:38865251-38865265promoter 内 1618-1632 bp - 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 38861903-38862882(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCTATTG
SmilChr02G003953 Chr02 NC_080388.1:61684424-61684438promoter 内 1617-1631 bp + 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 61686808-61689207(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACTTTATCCATATT
SmilChr02G002047 Chr02 NC_080388.1:36864474-36864488promoter 内 1586-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 36866889-36867572(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATAAC
SmilChr04G003885 Chr04 NC_080390.1:54680268-54680282promoter 内 1552-1566 bp - 2435 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54674283-54677833(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCACTAA
SmilChr02G002322 Chr02 NC_080388.1:40882587-40882601promoter 内 1538-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40885050-40888334(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAAAATT
SmilChr03G002176 Chr03 NC_080389.1:33821765-33821779promoter 内 1474-1488 bp - 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33815935-33819252(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATAAA
SmilChr02G004976 Chr02 NC_080388.1:71647628-71647642promoter 内 1472-1486 bp + 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 71650157-71655342(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACATT