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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 30 / 135 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001237 Chr03 NC_080389.1:14275760-14275774promoter 内 955-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 14278806-14279299(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGTTCCTTATCCTT
SmilChr01G003445 Chr01 NC_080387.1:53018628-53018642promoter 内 924-938 bp + 3063 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 53021705-53025410(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTATGCTTATCCAC
SmilChr02G002849 Chr02 NC_080388.1:48665670-48665684promoter 内 697-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 48668974-48673486(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAAAAA
SmilChr01G003506 Chr01 NC_080387.1:53635839-53635853promoter 内 650-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 53639190-53642825(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTATGCTTATCCAC
SmilChr01G003620 Chr01 NC_080387.1:54748810-54748824promoter 内 641-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 54752170-54757040(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTCCTTATCTTT
SmilChr01G000802 Chr01 NC_080387.1:17301998-17302012promoter 内 593-607 bp - 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 17295571-17298604(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCCCTTCTTATCCTT
SmilChr01G000752 Chr01 NC_080387.1:16601821-16601835promoter 内 581-595 bp + 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 16605241-16608282(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCCCTTCTTATCCTT
SmilChr01G001704 Chr01 NC_080387.1:31485102-31485116promoter 内 475-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 31480571-31481590(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAAAAA
SmilChr02G001799 Chr02 NC_080388.1:32844627-32844641promoter 内 314-328 bp + 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32839932-32840954(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGAAATTC
SmilChr01G001307 Chr01 NC_080387.1:26043329-26043343promoter 内 161-175 bp - 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 26033520-26039503(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATATGCCTTATCCAC
SmilChr01G001781 Chr01 NC_080387.1:32687662-32687676promoter 内 109-123 bp - 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32691554-32693498(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGTATAT
SmilChr02G004773 Chr02 NC_080388.1:69895941-69895955promoter 内 3917-3931 bp - 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 69896025-69902499(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATGATA
SmilChr01G002306 Chr01 NC_080387.1:39991209-39991223promoter 内 3193-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 39992017-39993315(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATGATC
SmilChr02G002773 Chr02 NC_080388.1:47804121-47804135promoter 内 2669-2683 bp + 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 47805453-47823024(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCAATCCTTATCATC
SmilChr02G003006 Chr02 NC_080388.1:50695434-50695448promoter 内 2634-2648 bp - 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 50696801-50700421(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATGGGT
SmilChr03G002181 Chr03 NC_080389.1:33889282-33889296promoter 内 2493-2507 bp + 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 33890790-33894444(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATACCTTATCTTT
SmilChr01G001185 Chr01 NC_080387.1:23963794-23963808promoter 内 369-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 23967426-23968862(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGGATAAGGTTCAA
SmilChr03G002180 Chr03 NC_080389.1:33889282-33889296promoter 内 3895-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 33889388-33890394(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATACCTTATCTTT
SmilChr01G001233 Chr01 NC_080387.1:24762155-24762169promoter 内 3863-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 24762293-24763434(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACTATCTTATCCCC
SmilChr02G001709 Chr02 NC_080388.1:31488331-31488345promoter 内 3828-3842 bp + 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 31488504-31493193(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATACCTTATCTTT
SmilChr03G001229 Chr03 NC_080389.1:14169206-14169220promoter 内 3790-3804 bp + 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 14169417-14173721(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATCATCTTATCCTT
SmilChr02G003686 Chr02 NC_080388.1:58224164-58224178promoter 内 3681-3695 bp - 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 58224484-58228396(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAATCAA
SmilChr01G004365 Chr01 NC_080387.1:61839110-61839124promoter 内 3633-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 61839478-61842573(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAAGATCTTATCCTA
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SmilChr01G000633 Chr01 NC_080387.1:14217823-14217837promoter 内 2633-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 14213891-14216469(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGTATAA
SmilChr01G005692 Chr01 NC_080387.1:73199961-73199975promoter 内 2501-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 73197240-73198475(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATCTTATCCAA
SmilChr01G000953 Chr01 NC_080387.1:20170323-20170337promoter 内 2408-2422 bp + 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 20171916-20171987(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACCCACCTTATCTCC
SmilChr03G000784 Chr03 NC_080389.1:8941904-8941918promoter 内 2261-2275 bp - 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8937178-8940178(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGAGACCTTATCCTA
SmilChr02G003005 Chr02 NC_080388.1:50695434-50695448promoter 内 2093-2107 bp - 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 50690724-50693540(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACCCATCTTATCCAA
SmilChr01G005272 Chr01 NC_080387.1:70156625-70156639promoter 内 1918-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 70158708-70159433(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGATAGTA
SmilChr03G000120 Chr03 NC_080389.1:1324937-1324951promoter 内 1551-1565 bp + 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 1302179-1322501(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGAAGACT
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SmilChr01G002900 Chr01 NC_080387.1:47668600-47668614promoter 内 1496-1510 bp - 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 47671105-47672514(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGATTGA
SmilChr02G005024 Chr02 NC_080388.1:71990373-71990387promoter 内 1460-1474 bp - 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 71985741-71987846(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCAACCTTATCAAT
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SmilChr03G002693 Chr03 NC_080389.1:42895404-42895418promoter 内 1214-1228 bp - 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 42898191-42899268(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAGATAAGGTATTT
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SmilChr03G002132 Chr03 NC_080389.1:33215358-33215372promoter 内 1097-1111 bp - 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 33208351-33212468(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACAATCCTTATCAAC
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SmilChr01G000824 Chr01 NC_080387.1:17781835-17781849promoter 内 909-923 bp - 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 17774833-17778757(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTCCTTATCCCT
SmilChr01G004273 Chr01 NC_080387.1:60967807-60967821promoter 内 841-855 bp + 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 60970967-60974633(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAATTCTTATCCTT
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SmilChr02G004810 Chr02 NC_080388.1:70272011-70272025promoter 内 218-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 70266135-70268242(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TACCACCTTATCCGA