转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 35 / 130 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000800 Chr01 NC_080387.1:17279375-17279387promoter 内 2001-2013 bp + 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 17281375-17287044(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTTAGAATATACC
SmilChr01G000754 Chr01 NC_080387.1:16625174-16625186promoter 内 1995-2007 bp - 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 16616861-16623180(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTTAGAATATACC
SmilChr01G002448 Chr01 NC_080387.1:42068721-42068733promoter 内 1839-1851 bp + 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 42070883-42073649(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATGAGAATATTCA
SmilChr03G001137 Chr03 NC_080389.1:13093159-13093171promoter 内 1403-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 13095757-13096290(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATTAC
SmilChr03G000273 Chr03 NC_080389.1:3121499-3121511promoter 内 1138-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 3115970-3118648(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTTAT
SmilChr01G005833 Chr01 NC_080387.1:74348631-74348643promoter 内 971-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 74340341-74345613(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAATATTCTAAA
SmilChr01G004037 Chr01 NC_080387.1:58787248-58787260promoter 内 788-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 58779106-58784047(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAATATTCTAAA
SmilChr01G005027 Chr01 NC_080387.1:68224530-68224542promoter 内 721-733 bp + 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 68227810-68231451(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATACT
SmilChr02G005342 Chr02 NC_080388.1:74248056-74248068promoter 内 555-567 bp + 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 74251502-74251948(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATTAC
SmilChr02G003808 Chr02 NC_080388.1:59717166-59717178promoter 内 546-558 bp + 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 59712965-59713723(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCGCAT
SmilChr02G001149 Chr02 NC_080388.1:20915097-20915109promoter 内 229-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 20918869-20924304(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTTAGAATATACC
SmilChr02G002228 Chr02 NC_080388.1:39631304-39631316promoter 内 3688-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39625323-39631003(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTCAT
SmilChr01G004146 Chr01 NC_080387.1:59983283-59983295promoter 内 3403-3415 bp - 586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59983881-59989552(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTTAT
SmilChr02G003290 Chr02 NC_080388.1:54180973-54180985promoter 内 3344-3356 bp - 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54181630-54183611(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCTTTT
SmilChr02G002408 Chr02 NC_080388.1:42039655-42039667promoter 内 3319-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 42040337-42042488(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATTAC
SmilChr02G004216 Chr02 NC_080388.1:64396252-64396264promoter 内 3314-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 64391702-64395577(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCTTTT
SmilChr01G004445 Chr01 NC_080387.1:62569612-62569624promoter 内 3185-3197 bp + 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 62564470-62568808(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCCTCA
SmilChr02G000378 Chr02 NC_080388.1:4762918-4762930promoter 内 2961-2973 bp + 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4763958-4767482(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAAGAATATACT
SmilChr01G005672 Chr01 NC_080387.1:72992990-72993002promoter 内 2953-2965 bp + 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72994038-72995363(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATGAGAATATTCA
SmilChr01G000254 Chr01 NC_080387.1:4818822-4818834promoter 内 2873-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4819950-4827593(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCAGAATATGCC
SmilChr01G003813 Chr01 NC_080387.1:56515816-56515828promoter 内 2568-2580 bp + 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 56517249-56520956(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATGAGAATATTCA
SmilChr02G001960 Chr02 NC_080388.1:35388870-35388882promoter 内 2545-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35386959-35387426(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGAGAATATGCC
SmilChr01G001164 Chr01 NC_080387.1:23640758-23640770promoter 内 2161-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 23637805-23638930(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTGAA
SmilChr03G000160 Chr03 NC_080389.1:1768679-1768691promoter 内 2024-2036 bp + 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1770656-1771579(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGGGAATATTTC
SmilChr03G001281 Chr03 NC_080389.1:14991121-14991133promoter 内 2009-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14986288-14989141(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACCACA
SmilChr01G005069 Chr01 NC_080387.1:68578580-68578592promoter 内 1757-1769 bp - 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 68580824-68582934(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCCTCA
SmilChr02G002191 Chr02 NC_080388.1:39142389-39142401promoter 内 1444-1456 bp + 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39136070-39139844(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCTTTT
SmilChr03G000336 Chr03 NC_080389.1:3813282-3813294promoter 内 1444-1456 bp + 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 3815839-3818373(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATTAC
SmilChr01G005587 Chr01 NC_080387.1:72551899-72551911promoter 内 1298-1310 bp - 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72554602-72554722(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCTTC
SmilChr01G004707 Chr01 NC_080387.1:65174248-65174260promoter 内 1247-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 65177002-65181214(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTGAA
SmilChr03G001723 Chr03 NC_080389.1:23137733-23137745promoter 内 825-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 23133489-23134569(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATTTC
SmilChr02G004073 Chr02 NC_080388.1:63012976-63012988promoter 内 624-636 bp + 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63016353-63020836(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTCAGAATATACC
SmilChr02G003700 Chr02 NC_080388.1:58460786-58460798promoter 内 187-199 bp + 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 58464600-58468207(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATGAGAATATTCA
SmilChr01G004839 Chr01 NC_080387.1:66528594-66528606promoter 内 66-78 bp + 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 66523337-66524671(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCTTTT
SmilChr01G000796 Chr01 NC_080387.1:17233765-17233777promoter 内 3207-3219 bp - 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 4 17234559-17235347(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCATATTCTGTT
SmilChr01G001095 Chr01 NC_080387.1:22422507-22422519promoter 内 3680-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 22419061-22422198(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TACAGAATATACT
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