转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 35 / 151 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005255 Chr02 NC_080388.1:73666361-73666373promoter 内 967-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 73663258-73663339(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr01G005616 Chr01 NC_080387.1:72676252-72676264promoter 内 772-784 bp + 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 72672952-72673035(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGGTAGGTGCA
SmilChr05G000059 Chr05 NC_080391.1:273621-273633promoter 内 647-659 bp + 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 276975-279943(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCCCC
SmilChr05G000058 Chr05 NC_080391.1:273621-273633promoter 内 3944-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 273678-276275(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCCCC
SmilChr03G003176 Chr03 NC_080389.1:49209602-49209614promoter 内 3942-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 49207948-49209555(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTCC
SmilChr01G001968 Chr01 NC_080387.1:35038298-35038310promoter 内 3927-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35032507-35038236(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr03G001584 Chr03 NC_080389.1:20042845-20042857promoter 内 3896-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20042950-20045827(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr02G005336 Chr02 NC_080388.1:74215680-74215692promoter 内 3879-3891 bp - 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 74204023-74215570(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr04G002516 Chr04 NC_080390.1:40180061-40180073promoter 内 3561-3573 bp - 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40180501-40183327(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAA
SmilChr02G000622 Chr02 NC_080388.1:9217624-9217636promoter 内 3118-3130 bp - 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9212839-9216753(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr01G005973 Chr01 NC_080387.1:75404486-75404498promoter 内 3052-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75400437-75403549(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACAGTAGGTAGA
SmilChr02G003217 Chr02 NC_080388.1:53337874-53337886promoter 内 2936-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 53338939-53349356(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGAT
SmilChr01G004728 Chr01 NC_080387.1:65462416-65462428promoter 内 2935-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 65459020-65461362(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTGCT
SmilChr01G003059 Chr01 NC_080387.1:49482200-49482212promoter 内 2728-2740 bp - 1261 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 49483473-49487851(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGGT
SmilChr05G001926 Chr05 NC_080391.1:19527590-19527602promoter 内 2710-2722 bp + 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19528881-19537029(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATATC
SmilChr03G001231 Chr03 NC_080389.1:14229242-14229254promoter 内 1810-1822 bp + 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14220513-14227063(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGTTAGGTAAG
SmilChr02G002608 Chr02 NC_080388.1:45242071-45242083promoter 内 1719-1731 bp - 2270 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 45237515-45239801(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTGCT
SmilChr01G001361 Chr01 NC_080387.1:26968009-26968021promoter 内 1667-1679 bp - 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26960517-26965687(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCCTC
SmilChr02G000409 Chr02 NC_080388.1:5100663-5100675promoter 内 1648-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 5096352-5098322(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTCC
SmilChr02G001165 Chr02 NC_080388.1:21297784-21297796promoter 内 1635-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 21300150-21300222(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCCCC
SmilChr04G002076 Chr04 NC_080390.1:33502573-33502585promoter 内 1476-1488 bp - 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 33505098-33509447(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACAGTAGGTAGA
SmilChr01G002552 Chr01 NC_080387.1:43614334-43614346promoter 内 1428-1440 bp + 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 43616907-43618214(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTAAA
SmilChr05G001925 Chr05 NC_080391.1:19527590-19527602promoter 内 1376-1388 bp + 2613 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19521808-19524977(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAA
SmilChr01G000218 Chr01 NC_080387.1:3791629-3791641promoter 内 1119-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 3794511-3799399(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGAT
SmilChr02G003215 Chr02 NC_080388.1:53337874-53337886promoter 内 982-994 bp - 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 53333452-53334867(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr01G001121 Chr01 NC_080387.1:22835696-22835708promoter 内 617-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 22831740-22832324(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAA
SmilChr04G003771 Chr04 NC_080390.1:53921718-53921730promoter 内 504-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 53917165-53918233(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTAAG
SmilChr04G002490 Chr04 NC_080390.1:39780174-39780186promoter 内 422-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 39783753-39786583(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAA
SmilChr01G003690 Chr01 NC_080387.1:55266987-55266999promoter 内 398-410 bp + 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 55270590-55273486(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTTC
SmilChr02G003268 Chr02 NC_080388.1:53937204-53937216promoter 内 382-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 53940823-53941464(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTAAG
SmilChr01G001234 Chr01 NC_080387.1:24765857-24765869promoter 内 329-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24769529-24773415(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGTTAGGTAAG
SmilChr01G003057 Chr01 NC_080387.1:49482200-49482212promoter 内 307-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 49477247-49478518(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTTT
SmilChr05G000134 Chr05 NC_080391.1:1080412-1080424promoter 内 239-251 bp - 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1084174-1086413(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACAGTAGGTAGA
SmilChr02G002159 Chr02 NC_080388.1:38823464-38823476promoter 内 127-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 38816497-38819602(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTGTT
SmilChr04G003264 Chr04 NC_080390.1:49358422-49358434promoter 内 62-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 49362361-49365000(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAA
SmilChr05G001730 Chr05 NC_080391.1:16718111-16718123promoter 内 1005-1017 bp - 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 16713460-16715127(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTCT
SmilChr01G003646 Chr01 NC_080387.1:54945824-54945836promoter 内 15-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 54939119-54941850(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGGT
SmilChr01G005032 Chr01 NC_080387.1:68284057-68284069promoter 内 540-552 bp - 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 68278485-68280608(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATACC
SmilChr01G005031 Chr01 NC_080387.1:68278554-68278566promoter 内 533-545 bp - 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 68272982-68275098(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATACC
SmilChr04G004010 Chr04 NC_080390.1:55417313-55417325promoter 内 3492-3504 bp + 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 55417822-55418714(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCACT
SmilChr02G001222 Chr02 NC_080388.1:22438436-22438448promoter 内 3047-3059 bp - 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 22435815-22437494(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTCT
SmilChr05G001608 Chr05 NC_080391.1:14816854-14816866promoter 内 2325-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 14818530-14820152(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAAG
SmilChr03G000626 Chr03 NC_080389.1:6946244-6946256promoter 内 2306-2318 bp - 1683 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 6936230-6944561(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTCTT
SmilChr02G004462 Chr02 NC_080388.1:67039935-67039947promoter 内 1894-1906 bp + 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 67036686-67037840(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGGT
SmilChr03G004462 Chr03 NC_080389.1:62701366-62701378promoter 内 1824-1836 bp - 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 62695383-62699201(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTCT
SmilChr02G003982 Chr02 NC_080388.1:62065119-62065131promoter 内 361-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 62068759-62071888(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAGGTAGGTGCC
SmilChr02G003113 Chr02 NC_080388.1:52114566-52114578promoter 内 288-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 52118279-52132077(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAAG
SmilChr01G003647 Chr01 NC_080387.1:54945824-54945836promoter 内 182-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 54949643-54949781(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCATT
SmilChr01G002748 Chr01 NC_080387.1:45807678-45807690promoter 内 150-162 bp - 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 45802255-45803839(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCATT
SmilChr02G003035 Chr02 NC_080388.1:51057382-51057394promoter 内 3942-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 51057441-51058186(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGAGTAGGTAAC