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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00009551-RA_Salv SmilChr02G003399 ERF XP_057793859.1 MP00240 CCACCTCCACCGCCA

可能结合的靶基因

9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 37 / 128 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003708 Chr04 NC_080390.1:53395381-53395395promoter 内 89-103 bp - 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 53399293-53401585(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGTGGCGT
SmilChr02G002877 Chr02 NC_080388.1:49038581-49038595promoter 内 3894-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 49038688-49045424(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr03G003399 Chr03 NC_080389.1:52375277-52375291promoter 内 3461-3475 bp - 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52375817-52378031(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGAGGACG
SmilChr01G004337 Chr01 NC_080387.1:61492894-61492908promoter 内 3379-3393 bp + 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 61489743-61492286(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGGAGA
SmilChr04G002084 Chr04 NC_080390.1:33601357-33601371promoter 内 3275-3289 bp + 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 33598622-33600645(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr03G004646 Chr03 NC_080389.1:64020785-64020799promoter 内 3271-3285 bp + 716 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 64019175-64020069(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGATGTGG
SmilChr04G001793 Chr04 NC_080390.1:29362370-29362384promoter 内 3257-3271 bp - 730 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 29357166-29361640(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CACCCTCCACCGCCT
SmilChr04G000534 Chr04 NC_080390.1:5924297-5924311promoter 内 3232-3246 bp - 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 5925066-5927924(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr01G004517 Chr01 NC_080387.1:63299610-63299624promoter 内 3183-3197 bp - 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 63300428-63304872(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr01G003103 Chr01 NC_080387.1:49836253-49836267promoter 内 3148-3162 bp - 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 49837106-49840176(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr04G002046 Chr04 NC_080390.1:33198356-33198370promoter 内 3098-3112 bp - 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 33190550-33197467(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr08G000202 Chr08 NC_080394.1:1374640-1374654promoter 内 3071-3085 bp + 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1375570-1382145(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGACCTCCACCGCCT
SmilChr05G003920 Chr05 NC_080391.1:52962175-52962189promoter 内 3068-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52957964-52961256(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCTCCTCCACCGCCT
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SmilChr08G000411 Chr08 NC_080394.1:2903674-2903688promoter 内 2722-2736 bp - 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2904953-2910765(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGATGAGG
SmilChr03G002800 Chr03 NC_080389.1:44481317-44481331promoter 内 2711-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 44482607-44483331(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCCCCACCACCGCCC
SmilChr05G002138 Chr05 NC_080391.1:22512242-22512256promoter 内 2576-2590 bp + 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 22513667-22517670(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CACCCTCCACCGCCT
SmilChr06G001212 Chr06 NC_080392.1:12420808-12420822promoter 内 2574-2588 bp + 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 12422235-12428048(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CACCCTCCACCGCCT
SmilChr03G002179 Chr03 NC_080389.1:33868773-33868787promoter 内 2492-2506 bp - 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 33863274-33867278(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CTACCACCACCGCCA
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SmilChr08G001598 Chr08 NC_080394.1:13202678-13202692promoter 内 1736-1750 bp - 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 13199096-13200427(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAACCACCACCGCCA
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SmilChr05G003993 Chr05 NC_080391.1:53769691-53769705promoter 内 1431-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 53763692-53767135(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr01G005003 Chr01 NC_080387.1:68073886-68073900promoter 内 1396-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 68076491-68103913(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr04G002981 Chr04 NC_080390.1:46235723-46235737promoter 内 1336-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 46238388-46242612(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr06G000474 Chr06 NC_080392.1:3861589-3861603promoter 内 1180-1194 bp + 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3854849-3858782(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTCGCGG
SmilChr04G003956 Chr04 NC_080390.1:55101873-55101887promoter 内 1124-1138 bp + 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 55104750-55107189(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 ACCCCTCCACCGCCG
SmilChr03G000411 Chr03 NC_080389.1:4444977-4444991promoter 内 1096-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4441547-4442086(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr02G001324 Chr02 NC_080388.1:24727708-24727722promoter 内 1082-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 24730627-24732489(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCATCCACCGCCG
SmilChr01G000304 Chr01 NC_080387.1:5945820-5945834promoter 内 858-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 5942008-5942691(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTGCTCCACCGCCT
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SmilChr05G000767 Chr05 NC_080391.1:5967021-5967035promoter 内 710-724 bp - 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 5962653-5963744(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr07G003989 Chr07 NC_080393.1:50942358-50942372promoter 内 709-723 bp + 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 50938962-50939080(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGCAGG
SmilChr08G001599 Chr08 NC_080394.1:13202678-13202692promoter 内 554-568 bp - 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 13206125-13207127(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGTGGTTG
SmilChr03G003398 Chr03 NC_080389.1:52375277-52375291promoter 内 548-562 bp - 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52369776-52371838(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGTCCTCCACCGCCG
SmilChr06G001225 Chr06 NC_080392.1:12662078-12662092promoter 内 393-407 bp - 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 12657750-12658484(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAACCACCACCGCCA
SmilChr03G000410 Chr03 NC_080389.1:4444977-4444991promoter 内 380-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4440018-4441370(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr03G004287 Chr03 NC_080389.1:61283619-61283633promoter 内 376-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 61278212-61280008(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGGAGA
SmilChr02G003516 Chr02 NC_080388.1:56349067-56349081promoter 内 214-228 bp + 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 56352854-56354315(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr08G000201 Chr08 NC_080394.1:1374640-1374654promoter 内 146-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1367512-1370799(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGGTCG
SmilChr03G003461 Chr03 NC_080389.1:53000721-53000735promoter 内 93-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52988123-52996827(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGACCACCGCCG
SmilChr03G000634 Chr03 NC_080389.1:6983298-6983312promoter 内 3455-3469 bp + 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 5 6981635-6982766(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGACGGTGGAGGAGG
SmilChr03G001161 Chr03 NC_080389.1:13386719-13386733promoter 内 3454-3468 bp - 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 5 13387266-13388270(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGACGGTGGAGGAGG
SmilChr03G000635 Chr03 NC_080389.1:6983298-6983312promoter 内 304-318 bp + 3683 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 5 6986995-6988006(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCTCCACCGTCT
SmilChr04G001141 Chr04 NC_080390.1:16815330-16815344promoter 内 2207-2221 bp + 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 16808700-16813550(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGACGGTGG
SmilChr05G003175 Chr05 NC_080391.1:40672427-40672441promoter 内 3083-3097 bp - 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 40673345-40683654(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCGGCTA