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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 42 / 134 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004938 Chr02 NC_080388.1:71341958-71341972promoter 内 3403-3417 bp - 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71342556-71350335(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTAGCAGA
SmilChr01G005788 Chr01 NC_080387.1:73978485-73978499promoter 内 3296-3310 bp + 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73971413-73977794(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATTATTACTTTC
SmilChr02G002663 Chr02 NC_080388.1:46126315-46126329promoter 内 2977-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46127339-46128032(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTTCCATC
SmilChr01G004867 Chr01 NC_080387.1:66794735-66794749promoter 内 2952-2966 bp - 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66790523-66793700(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CATACTAATGATGAG
SmilChr02G002509 Chr02 NC_080388.1:43563698-43563712promoter 内 2876-2890 bp + 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43564823-43564951(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTAATAATGATGGA
SmilChr02G002506 Chr02 NC_080388.1:43542930-43542944promoter 内 2872-2886 bp + 1115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43544059-43544187(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTAATAATGATGGA
SmilChr01G004299 Chr01 NC_080387.1:61175648-61175662promoter 内 2823-2837 bp - 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 61172693-61174484(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAGAATAATGATTAA
SmilChr01G003116 Chr01 NC_080387.1:49963644-49963658promoter 内 2733-2747 bp + 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49959887-49962390(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTCTA
SmilChr03G002152 Chr03 NC_080389.1:33469671-33469685promoter 内 2712-2726 bp - 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 33470960-33473313(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTTCTTTC
SmilChr02G000741 Chr02 NC_080388.1:11991425-11991439promoter 内 2694-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11992732-11993646(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTCCT
SmilChr01G004347 Chr01 NC_080387.1:61614383-61614397promoter 内 2680-2694 bp + 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 61615704-61616943(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAGAAATGATTAC
SmilChr01G003626 Chr01 NC_080387.1:54805270-54805284promoter 内 2585-2599 bp - 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54806686-54807969(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGCTGTC
SmilChr01G006016 Chr01 NC_080387.1:75746480-75746494promoter 内 2517-2531 bp + 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75747964-75750475(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAACTAATGATTAA
SmilChr03G001464 Chr03 NC_080389.1:17503231-17503245promoter 内 2499-2513 bp + 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17499893-17501743(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTATTTAT
SmilChr03G001395 Chr03 NC_080389.1:16548810-16548824promoter 内 2494-2508 bp + 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16545470-16547317(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTATTTAT
SmilChr01G006035 Chr01 NC_080387.1:75870758-75870772promoter 内 2402-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75867731-75869173(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATAATTACTTCT
SmilChr01G001618 Chr01 NC_080387.1:30285250-30285264promoter 内 2280-2294 bp + 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30286971-30294955(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAACTAATGATGGA
SmilChr01G003814 Chr01 NC_080387.1:56523640-56523654promoter 内 2256-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56521142-56521909(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATGTTT
SmilChr01G003852 Chr01 NC_080387.1:56799088-56799102promoter 内 2156-2170 bp - 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56800933-56801689(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATGTTT
SmilChr01G003046 Chr01 NC_080387.1:49441470-49441484promoter 内 2145-2159 bp + 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49443326-49448527(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGATGATGATTAC
SmilChr02G001987 Chr02 NC_080388.1:35887650-35887664promoter 内 2133-2147 bp + 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 35885164-35885796(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACTTTC
SmilChr03G002732 Chr03 NC_080389.1:43419732-43419746promoter 内 2085-2099 bp + 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43414949-43417830(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATCCAT
SmilChr01G000881 Chr01 NC_080387.1:18748317-18748331promoter 内 2058-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18743230-18746388(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACCTAA
SmilChr01G004510 Chr01 NC_080387.1:63191342-63191356promoter 内 2057-2071 bp + 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63184665-63189412(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTCTA
SmilChr03G001042 Chr03 NC_080389.1:12133129-12133143promoter 内 1960-1974 bp - 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12135170-12136301(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATGTCG
SmilChr01G001671 Chr01 NC_080387.1:30817478-30817492promoter 内 1814-1828 bp - 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30819665-30820468(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACTTTC
SmilChr01G003816 Chr01 NC_080387.1:56523640-56523654promoter 内 1635-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56526006-56526977(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACATAATGATTGA
SmilChr02G004082 Chr02 NC_080388.1:63101653-63101667promoter 内 1591-1605 bp + 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63097722-63099257(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGCGGC
SmilChr01G003850 Chr01 NC_080387.1:56799088-56799102promoter 内 1471-1485 bp - 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56795583-56796572(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACATAATGATTGA
SmilChr01G003627 Chr01 NC_080387.1:54805270-54805284promoter 内 1302-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54807969-54815816(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGCTGTC
SmilChr01G004324 Chr01 NC_080387.1:61399819-61399833promoter 内 1235-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 61402585-61404376(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTATACTC
SmilChr01G006066 Chr01 NC_080387.1:76068713-76068727promoter 内 1178-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 76071536-76075726(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAGGTAATGATTGA
SmilChr02G000309 Chr02 NC_080388.1:3891064-3891078promoter 内 1170-1184 bp - 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3893895-3896873(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTAGTTTC
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SmilChr01G001039 Chr01 NC_080387.1:21640513-21640527promoter 内 709-723 bp - 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21635892-21637235(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTATGTGATGATTAT
SmilChr03G003072 Chr03 NC_080389.1:47742500-47742514promoter 内 692-706 bp - 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47738570-47739205(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGAGACAATGATTAT
SmilChr01G006167 Chr01 NC_080387.1:77160750-77160764promoter 内 685-699 bp - 3302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 77164066-77165735(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCAGATTT
SmilChr01G002466 Chr01 NC_080387.1:42345226-42345240promoter 内 577-591 bp + 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 42348650-42358688(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGACTAATGATTAA
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SmilChr03G001228 Chr03 NC_080389.1:14161973-14161987promoter 内 548-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14165426-14166550(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAAATAATGATGAA
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SmilChr03G000661 Chr03 NC_080389.1:7403553-7403567promoter 内 236-250 bp - 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7396237-7399802(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGGATAATGATGAA
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SmilChr01G001056 Chr01 NC_080387.1:21893103-21893117promoter 内 159-173 bp + 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21896945-21899951(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGGATAATGATGAA
SmilChr03G003306 Chr03 NC_080389.1:51250442-51250456promoter 内 135-149 bp + 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51254308-51257295(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGGATAATGATGAA
SmilChr02G004936 Chr02 NC_080388.1:71341958-71341972promoter 内 70-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71335126-71338041(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCTGCTAATGATTAC
SmilChr03G002926 Chr03 NC_080389.1:46012474-46012488promoter 内 62-76 bp + 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46016413-46019380(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGGATAATGATGAA