转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 43 / 164 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001048 Chr06 NC_080392.1:10345339-10345353promoter 内 486-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 10348854-10350723(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCCAGAC
SmilChr02G001644 Chr02 NC_080388.1:30510682-30510696promoter 内 440-454 bp + 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 30514243-30517005(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAATGGTAGGTTGG
SmilChr07G002061 Chr07 NC_080393.1:18744851-18744865promoter 内 204-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 18748648-18749553(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAATTAGTAGGTGGA
SmilChr02G001625 Chr02 NC_080388.1:30168229-30168243promoter 内 117-131 bp + 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 30172113-30174698(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAATGGTAGGTTGG
SmilChr03G001911 Chr03 NC_080389.1:26733022-26733036promoter 内 94-108 bp - 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 26736929-26737921(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAACAATCT
SmilChr02G004167 Chr02 NC_080388.1:63983514-63983528promoter 内 44-58 bp + 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 63976250-63979571(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTCTT
SmilChr03G004497 Chr03 NC_080389.1:63083753-63083767promoter 内 27-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 63087727-63089470(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTTAGGTAGGTAAA
SmilChr04G000115 Chr04 NC_080390.1:998014-998028promoter 内 1667-1681 bp + 2320 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 1000348-1003600(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGAATGGTAGGTGTA
SmilChr07G000880 Chr07 NC_080393.1:6291324-6291338promoter 内 782-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 6294543-6298210(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTAACCTACCAAACA
SmilChr04G002068 Chr04 NC_080390.1:33433082-33433096promoter 内 3766-3780 bp - 221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 33433317-33435846(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G001162 Chr01 NC_080387.1:23614453-23614467promoter 内 3679-3693 bp - 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 23614775-23616980(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCCACCA
SmilChr03G003549 Chr03 NC_080389.1:54119878-54119892promoter 内 3370-3384 bp + 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 54115533-54119261(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr04G000298 Chr04 NC_080390.1:2770678-2770692promoter 内 2813-2827 bp + 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 2771866-2772876(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G004697 Chr03 NC_080389.1:64308509-64308523promoter 内 2525-2539 bp - 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 64305673-64307047(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G003737 Chr05 NC_080391.1:50452397-50452411promoter 内 2256-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 50445181-50450666(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr05G003738 Chr05 NC_080391.1:50453063-50453077promoter 内 1161-1175 bp + 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 50455903-50457360(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr07G001000 Chr07 NC_080393.1:7269316-7269330promoter 内 1006-1020 bp + 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 7272311-7277037(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTAAGGTAGGTGAA
SmilChr05G003583 Chr05 NC_080391.1:47863159-47863173promoter 内 912-926 bp + 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 47866248-47869132(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATTTGGTAGTTGAG
SmilChr06G001260 Chr06 NC_080392.1:13123010-13123024promoter 内 3891-3905 bp + 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 13123120-13129487(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGTGGGTAGGTGAT
SmilChr07G002076 Chr07 NC_080393.1:18884168-18884182promoter 内 3779-3793 bp + 208 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 18880329-18883960(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr05G002759 Chr05 NC_080391.1:31938461-31938475promoter 内 3680-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 31938782-31944492(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G002897 Chr02 NC_080388.1:49247222-49247236promoter 内 3626-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 49243032-49246861(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G005383 Chr01 NC_080387.1:71077481-71077495promoter 内 3358-3372 bp - 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 71070234-71076852(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G000224 Chr02 NC_080388.1:2904273-2904287promoter 内 3254-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 2900591-2903540(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr08G000507 Chr08 NC_080394.1:3706617-3706631promoter 内 3248-3262 bp - 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 3707370-3709422(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr08G002008 Chr08 NC_080394.1:17852941-17852955promoter 内 3224-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 17850233-17852178(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr06G002179 Chr06 NC_080392.1:30039334-30039348promoter 内 3115-3129 bp + 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 30040220-30041879(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTATTAGTAGGTGGA
SmilChr07G001856 Chr07 NC_080393.1:16091747-16091761promoter 内 2920-2934 bp - 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 16088024-16090680(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr06G002649 Chr06 NC_080392.1:38279633-38279647promoter 内 2919-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 38280715-38281494(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G004487 Chr01 NC_080387.1:63005399-63005413promoter 内 2915-2929 bp - 1072 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 63006485-63009676(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G000735 Chr01 NC_080387.1:16308836-16308850promoter 内 2796-2810 bp - 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 16307539-16307645(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTAGGGGTAGGTAGA
SmilChr02G005484 Chr02 NC_080388.1:75044129-75044143promoter 内 2707-2721 bp + 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 75039542-75042849(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCCACCA
SmilChr08G001862 Chr08 NC_080394.1:15985813-15985827promoter 内 2579-2593 bp - 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 15982735-15984405(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G002235 Chr03 NC_080389.1:35246141-35246155promoter 内 2554-2568 bp - 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 35247588-35248905(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr04G002698 Chr04 NC_080390.1:42477436-42477450promoter 内 1936-1950 bp - 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 42479501-42481258(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr07G004267 Chr07 NC_080393.1:55081485-55081499promoter 内 1761-1775 bp + 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 55083725-55087397(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G001018 Chr05 NC_080391.1:8335717-8335731promoter 内 1681-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 8338037-8340830(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G001419 Chr04 NC_080390.1:23050351-23050365promoter 内 1428-1442 bp + 2559 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 23040339-23047792(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr07G001108 Chr07 NC_080393.1:8184024-8184038promoter 内 1337-1351 bp - 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 8179331-8181374(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTATGGGTAGGTGAA
SmilChr04G002067 Chr04 NC_080390.1:33433082-33433096promoter 内 925-939 bp - 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 33425626-33430020(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G003974 Chr04 NC_080390.1:55212826-55212840promoter 内 674-688 bp - 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 55216153-55218288(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCCACCA
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SmilChr05G003839 Chr05 NC_080391.1:51837644-51837658promoter 内 446-460 bp + 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 51841199-51845766(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTTTGGTAGGTGAT
SmilChr06G001285 Chr06 NC_080392.1:13434816-13434830promoter 内 353-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 13426213-13431182(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCTAATA
SmilChr03G001009 Chr03 NC_080389.1:11568562-11568576promoter 内 211-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 11572352-11573228(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTCAG
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SmilChr01G004495 Chr01 NC_080387.1:63072670-63072684promoter 内 3932-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 63069932-63072615(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTCTTGGTAGTTGGG
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SmilChr02G005173 Chr02 NC_080388.1:73035893-73035907promoter 内 3888-3902 bp - 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 73031943-73035794(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAATAGTAGGTGGG