转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 44 / 148 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004044 Chr04 NC_080390.1:55664655-55664668promoter 内 2228-2241 bp - 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 55666428-55667638(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACACCTA
SmilChr01G006172 Chr01 NC_080387.1:77237154-77237167promoter 内 1182-1195 bp - 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 77239973-77247195(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGCGCG
SmilChr04G004043 Chr04 NC_080390.1:55664655-55664668promoter 内 1137-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 55655543-55661804(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGGTGTCACGTGC
SmilChr06G000332 Chr06 NC_080392.1:2481777-2481790promoter 内 3747-3760 bp - 241 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2482031-2484034(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTCAAG
SmilChr07G002014 Chr07 NC_080393.1:17968100-17968113promoter 内 3257-3270 bp + 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 17965898-17967369(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACAAT
SmilChr07G002023 Chr07 NC_080393.1:18182846-18182859promoter 内 3257-3270 bp + 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 18179962-18182115(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACAAT
SmilChr04G000064 Chr04 NC_080390.1:575649-575662promoter 内 3179-3192 bp - 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 576471-586022(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCGACA
SmilChr03G004295 Chr03 NC_080389.1:61354879-61354892promoter 内 2787-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 61356093-61361591(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCACATCACGTGG
SmilChr07G001355 Chr07 NC_080393.1:10505467-10505480promoter 内 2648-2661 bp - 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 10506820-10510239(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCATTGCC
SmilChr05G002338 Chr05 NC_080391.1:25322151-25322164promoter 内 2447-2460 bp - 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 25319550-25320610(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGATGACACGTGG
SmilChr07G004330 Chr07 NC_080393.1:55860797-55860810promoter 内 2433-2446 bp - 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 55862365-55863222(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACATGAC
SmilChr01G002449 Chr01 NC_080387.1:42088445-42088458promoter 内 1807-1820 bp - 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 42081671-42086264(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGACTCCACGTGG
SmilChr05G004169 Chr05 NC_080391.1:55626329-55626342promoter 内 1061-1074 bp + 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 55629269-55630128(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAATGCCACGTGG
SmilChr01G000825 Chr01 NC_080387.1:17795233-17795246promoter 内 807-820 bp + 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 17789722-17792052(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGCCCAC
SmilChr07G001110 Chr07 NC_080393.1:8189853-8189866promoter 内 205-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8193649-8196702(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATAGGGCACGTGG
SmilChr07G002761 Chr07 NC_080393.1:27456675-27456688promoter 内 3904-3917 bp - 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 27455068-27456591(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCAATGCACGTGG
SmilChr03G003314 Chr03 NC_080389.1:51375137-51375150promoter 内 3901-3914 bp - 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 51372765-51375050(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGTCACGTGC
SmilChr06G000875 Chr06 NC_080392.1:8280306-8280319promoter 内 3899-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8277932-8280217(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGTCACGTGC
SmilChr06G002231 Chr06 NC_080392.1:31520662-31520675promoter 内 3898-3911 bp + 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31520765-31521523(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGTCACGTGC
SmilChr01G003603 Chr01 NC_080387.1:54579340-54579353promoter 内 3785-3798 bp - 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54579556-54580784(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTTCC
SmilChr03G001068 Chr03 NC_080389.1:12386920-12386933promoter 内 3754-3767 bp + 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12387167-12387756(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGTCACGTGC
SmilChr03G002597 Chr03 NC_080389.1:41272502-41272515promoter 内 3692-3705 bp - 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 41262782-41272206(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATATGGTCACGTGG
SmilChr02G003002 Chr02 NC_080388.1:50683193-50683206promoter 内 3477-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 50681784-50682682(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTTCC
SmilChr02G001958 Chr02 NC_080388.1:35342880-35342893promoter 内 3449-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 35343432-35344730(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAGCTC
SmilChr01G005324 Chr01 NC_080387.1:70458012-70458025promoter 内 3245-3258 bp + 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 70458768-70466254(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGCTGCACGTGG
SmilChr05G001836 Chr05 NC_080391.1:18387795-18387808promoter 内 3088-3101 bp + 900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18384961-18386895(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAA
SmilChr07G004329 Chr07 NC_080393.1:55860797-55860810promoter 内 3080-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 55857972-55859889(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCATGTCACGTGT
SmilChr07G000497 Chr07 NC_080393.1:3462362-3462375promoter 内 3057-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 3463306-3471702(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGACTCACGTGC
SmilChr06G002549 Chr06 NC_080392.1:36597727-36597740promoter 内 2854-2867 bp - 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 36595597-36596593(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAACTTCACGTGG
SmilChr02G000902 Chr02 NC_080388.1:15484802-15484815promoter 内 2801-2814 bp - 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15482008-15483615(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGACTCCACGTGG
SmilChr01G002350 Chr01 NC_080387.1:40641186-40641199promoter 内 2666-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40642521-40642628(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTTCTG
SmilChr01G003611 Chr01 NC_080387.1:54658902-54658915promoter 内 2636-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54660267-54661448(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCAAAC
SmilChr04G004181 Chr04 NC_080390.1:56383913-56383926promoter 内 2507-2520 bp - 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56385407-56394503(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGACCAT
SmilChr05G000417 Chr05 NC_080391.1:3150775-3150788promoter 内 2102-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 3152674-3154758(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGCCTCACGTGC
SmilChr05G002010 Chr05 NC_080391.1:20807405-20807418promoter 内 2067-2080 bp - 1921 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 20809339-20811790(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGGCCCT
SmilChr06G001493 Chr06 NC_080392.1:15954580-15954593promoter 内 1812-1825 bp + 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15956769-15957740(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAATTCACGTGG
SmilChr06G003063 Chr06 NC_080392.1:43535765-43535778promoter 内 1769-1782 bp - 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43532847-43533546(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACATGACACGTGG
SmilChr07G004101 Chr07 NC_080393.1:52566364-52566377promoter 内 1757-1770 bp - 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 52568608-52570452(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGTCCT
SmilChr06G000876 Chr06 NC_080392.1:8280306-8280319promoter 内 1632-1645 bp - 2356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8282675-8288911(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATAAC
SmilChr08G001020 Chr08 NC_080394.1:7730960-7730973promoter 内 1511-1524 bp - 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7725085-7728483(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAAGTCACGTGA
SmilChr02G000285 Chr02 NC_080388.1:3649079-3649092promoter 内 1482-1495 bp - 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 3641492-3646573(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAACCTCACGTGA
SmilChr03G003238 Chr03 NC_080389.1:50280245-50280258promoter 内 1330-1343 bp + 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 50282916-50286115(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGAAGACACGTGG
SmilChr07G002762 Chr07 NC_080393.1:27456675-27456688promoter 内 1211-1224 bp - 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 27459465-27462906(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCATTGCC
SmilChr05G002339 Chr05 NC_080391.1:25324431-25324444promoter 内 1017-1030 bp - 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 25327415-25333624(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTG
SmilChr07G001377 Chr07 NC_080393.1:10683489-10683502promoter 内 737-750 bp - 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 10686753-10687763(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACCAGTC
SmilChr06G001919 Chr06 NC_080392.1:23205394-23205407promoter 内 725-738 bp - 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 23200078-23202131(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTGTGACACGTGG
SmilChr01G002794 Chr01 NC_080387.1:46449594-46449607promoter 内 689-702 bp - 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 46443274-46446295(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCTGCTCACGTGC
SmilChr01G001038 Chr01 NC_080387.1:21603952-21603965promoter 内 622-635 bp + 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 21607331-21608758(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGATGTCACGTGC
SmilChr08G000556 Chr08 NC_080394.1:4049500-4049513promoter 内 550-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4033742-4046062(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCTCGTCACGTGG
SmilChr06G002232 Chr06 NC_080392.1:31520662-31520675promoter 内 494-507 bp + 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31524169-31524903(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGTCACGTGC