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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 44 / 134 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003046 Chr03 NC_080389.1:47362064-47362078promoter 内 3327-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47362738-47373446(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTAACAATGATTAT
SmilChr02G002863 Chr02 NC_080388.1:48803794-48803808promoter 内 3285-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48796898-48803092(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTTCATTA
SmilChr02G004591 Chr02 NC_080388.1:68420175-68420189promoter 内 3172-3186 bp - 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 68405219-68419360(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTACATAATGATGAT
SmilChr02G005477 Chr02 NC_080388.1:75001333-75001347promoter 内 3033-3047 bp + 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 75002301-75004018(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTACATAATGATGAT
SmilChr01G004844 Chr01 NC_080387.1:66583396-66583410promoter 内 2756-2770 bp + 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 66584641-66588933(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAATTAATGATTAC
SmilChr03G002277 Chr03 NC_080389.1:35933786-35933800promoter 内 2616-2630 bp - 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35928546-35932415(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAATCTAATGATTAA
SmilChr02G001175 Chr02 NC_080388.1:21583509-21583523promoter 内 2475-2489 bp + 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21579250-21581997(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATTGTA
SmilChr02G001171 Chr02 NC_080388.1:21537549-21537563promoter 内 2451-2465 bp + 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21533955-21536013(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTAGAAAT
SmilChr01G005533 Chr01 NC_080387.1:72175247-72175261promoter 内 2345-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72171487-72173605(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AACTCTAATGATTAT
SmilChr02G004489 Chr02 NC_080388.1:67398366-67398380promoter 内 2292-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 67400075-67403466(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGTTAATGATGAT
SmilChr01G005109 Chr01 NC_080387.1:68887615-68887629promoter 内 2105-2119 bp - 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 68889511-68891477(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAGAAAT
SmilChr01G000740 Chr01 NC_080387.1:16397096-16397110promoter 内 1723-1737 bp - 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16399374-16400258(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAG
SmilChr03G000836 Chr03 NC_080389.1:9576176-9576190promoter 内 1615-1629 bp + 2372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9578562-9582344(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CGAAATAATGATGAA
SmilChr02G001768 Chr02 NC_080388.1:32432175-32432189promoter 内 1587-1601 bp + 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 32427898-32429775(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATAATT
SmilChr03G002265 Chr03 NC_080389.1:35650655-35650669promoter 内 1437-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35647641-35648105(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATCTCC
SmilChr03G002266 Chr03 NC_080389.1:35697250-35697264promoter 内 1296-1310 bp + 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35694486-35694559(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATATAA
SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8641937-8641951promoter 内 1272-1286 bp - 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8644666-8646235(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTACTGTA
SmilChr02G000282 Chr02 NC_080388.1:3619944-3619958promoter 内 1270-1284 bp + 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 3615066-3617227(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATCACTCAC
SmilChr01G005534 Chr01 NC_080387.1:72175247-72175261promoter 内 1210-1224 bp - 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72178038-72180187(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAGAGTT
SmilChr03G002223 Chr03 NC_080389.1:35049380-35049394promoter 内 955-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35042421-35046348(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGCGACC
SmilChr01G006019 Chr01 NC_080387.1:75777744-75777758promoter 内 903-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 75780842-75781189(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAAGTAATCATGAT
SmilChr01G003106 Chr01 NC_080387.1:49867623-49867637promoter 内 893-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 49870731-49874718(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTATCATTACACTT
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SmilChr02G001878 Chr02 NC_080388.1:34084905-34084919promoter 内 862-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 34088044-34090623(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAACTAATGATGAA
SmilChr01G002617 Chr01 NC_080387.1:44458098-44458112promoter 内 742-756 bp + 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44448117-44454853(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATCTCC
SmilChr01G001042 Chr01 NC_080387.1:21652672-21652686promoter 内 680-694 bp - 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21649024-21649365(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAC
SmilChr02G002491 Chr02 NC_080388.1:43346188-43346202promoter 内 674-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 43336395-43342875(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTTTTA
SmilChr02G001090 Chr02 NC_080388.1:19614617-19614631promoter 内 626-640 bp + 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19610036-19611256(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATTAAA
SmilChr03G003314 Chr03 NC_080389.1:51378457-51378471promoter 内 580-594 bp - 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51372765-51375050(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGTTAATGATTAT
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SmilChr03G002719 Chr03 NC_080389.1:43210888-43210902promoter 内 543-557 bp - 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 43214346-43215872(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATTTCG
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SmilChr01G004203 Chr01 NC_080387.1:60487867-60487881promoter 内 435-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 60491433-60494035(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTCCGATGATTAC
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SmilChr01G001633 Chr01 NC_080387.1:30387687-30387701promoter 内 196-210 bp - 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 30391492-30392433(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATCTCC
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SmilChr01G005051 Chr01 NC_080387.1:68459085-68459099promoter 内 261-275 bp - 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 6 68451266-68455359(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATAATTAT
SmilChr01G001838 Chr01 NC_080387.1:33321924-33321938promoter 内 3044-3058 bp - 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 4 33316125-33320981(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAAGTAATAATTAC
SmilChr03G002578 Chr03 NC_080389.1:40996868-40996882promoter 内 2962-2976 bp + 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 4 40997907-40999995(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATAATTAT
SmilChr01G000886 Chr01 NC_080387.1:18924914-18924928promoter 内 2188-2202 bp - 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 4 18926727-18927868(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATTATTACTTTT
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SmilChr01G003342 Chr01 NC_080387.1:52203170-52203184promoter 内 2315-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 52204856-52207135(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATAATTAT