转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 46 / 134 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001336 Chr02 NC_080388.1:24831046-24831058promoter 内 3534-3546 bp + 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24831513-24832456(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAATGGATAACG
SmilChr02G005130 Chr02 NC_080388.1:72768025-72768037promoter 内 3525-3537 bp - 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 72768501-72771813(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTGAT
SmilChr01G005484 Chr01 NC_080387.1:71799201-71799213promoter 内 3205-3217 bp - 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71799997-71807006(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCAAA
SmilChr01G005172 Chr01 NC_080387.1:69473858-69473870promoter 内 3113-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 69474746-69476712(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTGAT
SmilChr01G003737 Chr01 NC_080387.1:55698350-55698362promoter 内 2983-2995 bp + 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55699368-55701398(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAACA
SmilChr03G001673 Chr03 NC_080389.1:21879832-21879844promoter 内 2852-2864 bp - 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 21877229-21878695(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATACTAGATAAGG
SmilChr02G003014 Chr02 NC_080388.1:50825636-50825648promoter 内 2816-2828 bp - 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 50826821-50828044(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACTAA
SmilChr03G001016 Chr03 NC_080389.1:11675667-11675679promoter 内 2785-2797 bp + 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 11676883-11677709(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAACA
SmilChr01G005238 Chr01 NC_080387.1:69945313-69945325promoter 内 2633-2645 bp + 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 69941803-69943957(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACATT
SmilChr02G004812 Chr02 NC_080388.1:70280587-70280599promoter 内 2587-2599 bp + 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 70282001-70284079(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGTGGATAAGT
SmilChr03G001337 Chr03 NC_080389.1:15607643-15607655promoter 内 2464-2476 bp + 1525 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 15609180-15610408(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGTGGATAAGT
SmilChr02G001518 Chr02 NC_080388.1:28292813-28292825promoter 内 2315-2327 bp - 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 28294499-28302957(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACATT
SmilChr01G001057 Chr01 NC_080387.1:21900329-21900341promoter 内 2314-2326 bp - 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 21902016-21904918(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACTAA
SmilChr01G000946 Chr01 NC_080387.1:20055908-20055920promoter 内 2113-2125 bp - 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 20051545-20054032(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAACA
SmilChr01G005418 Chr01 NC_080387.1:71387067-71387079promoter 内 1960-1972 bp - 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71389108-71390183(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCAATAT
SmilChr01G005240 Chr01 NC_080387.1:69951438-69951450promoter 内 1725-1737 bp + 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 69953714-69954297(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAACA
SmilChr01G004204 Chr01 NC_080387.1:60493469-60493481promoter 内 1697-1709 bp + 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 60495773-60497387(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAACG
SmilChr02G003916 Chr02 NC_080388.1:61253979-61253991promoter 内 1652-1664 bp - 2337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 61250076-61251642(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATCGGATAAGA
SmilChr02G004976 Chr02 NC_080388.1:71647630-71647642promoter 内 1474-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71650157-71655342(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACATT
SmilChr01G005433 Chr01 NC_080387.1:71476481-71476493promoter 内 1433-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71479049-71484760(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATCAGATAAGG
SmilChr01G001773 Chr01 NC_080387.1:32644569-32644581promoter 内 1412-1424 bp + 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 32647158-32649996(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGTGGATAAGT
SmilChr01G001531 Chr01 NC_080387.1:29301845-29301857promoter 内 1397-1409 bp - 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 29304449-29306676(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCATTAT
SmilChr01G005429 Chr01 NC_080387.1:71455724-71455736promoter 内 1073-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71458652-71461641(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATTGGATAAGC
SmilChr02G005103 Chr02 NC_080388.1:72576636-72576648promoter 内 922-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 72570454-72573569(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTGGAGATAAGG
SmilChr02G004555 Chr02 NC_080388.1:68085130-68085142promoter 内 791-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 68078785-68081932(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGTGGATAAGT
SmilChr02G004975 Chr02 NC_080388.1:71641588-71641600promoter 内 730-742 bp - 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71632567-71638329(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAACA
SmilChr02G000482 Chr02 NC_080388.1:6613670-6613682promoter 内 676-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 6599753-6610357(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACATT
SmilChr02G002406 Chr02 NC_080388.1:41970209-41970221promoter 内 596-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41973614-42011446(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACTAA
SmilChr03G001231 Chr03 NC_080389.1:14230538-14230550promoter 内 514-526 bp - 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 14220513-14227063(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAACA
SmilChr01G005507 Chr01 NC_080387.1:71924925-71924937promoter 内 461-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71928465-71932381(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCAGA
SmilChr01G004979 Chr01 NC_080387.1:67840401-67840413promoter 内 371-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 67844031-67848404(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGGAAGATAAGG
SmilChr03G002154 Chr03 NC_080389.1:33505471-33505483promoter 内 209-221 bp - 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 33500480-33501691(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATATGGATAACA
SmilChr01G005711 Chr01 NC_080387.1:73327679-73327691promoter 内 102-114 bp - 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 73331578-73334536(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTGATG
SmilChr01G004381 Chr01 NC_080387.1:61996108-61996120promoter 内 48-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 62000061-62002883(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATCAAGGATAAGG
SmilChr01G004747 Chr01 NC_080387.1:65635475-65635487promoter 内 90-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 5 65639386-65639457(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTCAAA
SmilChr03G001002 Chr03 NC_080389.1:11342617-11342629promoter 内 2769-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 4 11338375-11341397(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGATGGATAAGA
SmilChr01G002767 Chr01 NC_080387.1:46068904-46068916promoter 内 3908-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 46068997-46071935(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTATT
SmilChr01G001140 Chr01 NC_080387.1:23274636-23274648promoter 内 3439-3451 bp - 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 23270547-23274086(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGATGGATAAGA
SmilChr01G003099 Chr01 NC_080387.1:49797135-49797147promoter 内 3423-3435 bp + 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 49797713-49799255(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAATAGATAAGG
SmilChr01G006175 Chr01 NC_080387.1:77261957-77261969promoter 内 3232-3244 bp + 757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 77258619-77261200(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCGAAA
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SmilChr03G000502 Chr03 NC_080389.1:5398459-5398471promoter 内 1749-1761 bp - 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 5400711-5403219(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTGC
SmilChr03G000764 Chr03 NC_080389.1:8735453-8735465promoter 内 1430-1442 bp + 2559 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 8738024-8741270(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTAGGATAAGC
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SmilChr01G002888 Chr01 NC_080387.1:47544136-47544148promoter 内 3164-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 47538029-47543311(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGAACT
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SmilChr01G001331 Chr01 NC_080387.1:26501005-26501017promoter 内 3067-3079 bp - 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 26501939-26502886(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCTAT