转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 46 / 164 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002980 Chr03 NC_080389.1:46631586-46631600promoter 内 2215-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 46626245-46629814(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G002474 Chr01 NC_080387.1:42482654-42482668promoter 内 2209-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 42484446-42486418(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G001042 Chr08 NC_080394.1:7953357-7953371promoter 内 2208-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 7955150-7960735(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G002260 Chr01 NC_080387.1:39398222-39398236promoter 内 2152-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 39392484-39396387(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr07G000077 Chr07 NC_080393.1:359672-359686promoter 内 2140-2154 bp - 1847 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 361533-362094(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAACAAATT
SmilChr03G000908 Chr03 NC_080389.1:10404002-10404016promoter 内 2125-2139 bp - 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 10405878-10409933(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr03G003936 Chr03 NC_080389.1:58425502-58425516promoter 内 2111-2125 bp - 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 58422533-58423626(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTAAAGTAGGTGGG
SmilChr01G000439 Chr01 NC_080387.1:8802773-8802787promoter 内 2101-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8800797-8800887(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G003728 Chr03 NC_080389.1:56305735-56305749promoter 内 2101-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 56300804-56303849(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G003183 Chr05 NC_080391.1:40738940-40738954promoter 内 2087-2101 bp - 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 40740854-40741900(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTACCTACCATTGT
SmilChr04G001930 Chr04 NC_080390.1:31409289-31409303promoter 内 2078-2092 bp + 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 31404416-31407380(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCAGAGT
SmilChr03G000907 Chr03 NC_080389.1:10404002-10404016promoter 内 2073-2087 bp - 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 10399492-10402088(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G001190 Chr08 NC_080394.1:9530451-9530465promoter 内 2064-2078 bp + 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9532388-9533765(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G000360 Chr08 NC_080394.1:2475420-2475434promoter 内 2057-2071 bp + 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2477364-2482582(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr07G000230 Chr07 NC_080393.1:1490207-1490221promoter 内 1995-2009 bp - 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1492213-1495701(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCAACTACCAAATT
SmilChr07G000454 Chr07 NC_080393.1:3208876-3208890promoter 内 1946-1960 bp - 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3202805-3206835(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTGCAGGTAGGTGAA
SmilChr01G002144 Chr01 NC_080387.1:37428216-37428230promoter 内 1943-1957 bp + 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 37430274-37436163(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G002219 Chr01 NC_080387.1:38527669-38527683promoter 内 1841-1855 bp + 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 38529829-38534249(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACTCTGGTAGGTGAA
SmilChr01G002761 Chr01 NC_080387.1:46015134-46015148promoter 内 1841-1855 bp - 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 46007200-46012988(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACTCTGGTAGGTGAA
SmilChr02G002589 Chr02 NC_080388.1:45011230-45011244promoter 内 1841-1855 bp - 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 45004944-45009084(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACTCTGGTAGGTGAA
SmilChr07G001772 Chr07 NC_080393.1:15012902-15012916promoter 内 1834-1848 bp + 2153 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 15015069-15023070(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G002574 Chr01 NC_080387.1:43828575-43828589promoter 内 1828-1842 bp - 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 43821872-43826416(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G003896 Chr02 NC_080388.1:61055502-61055516promoter 内 1827-1841 bp + 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 61050395-61053342(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr03G004462 Chr03 NC_080389.1:62701364-62701378promoter 内 1824-1838 bp + 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 62695383-62699201(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCTCTCA
SmilChr07G000595 Chr07 NC_080393.1:4068431-4068445promoter 内 1798-1812 bp - 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 4060608-4066242(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G004015 Chr05 NC_080391.1:54115089-54115103promoter 内 1749-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 54111903-54112851(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G001969 Chr05 NC_080391.1:20327398-20327412promoter 内 1673-1687 bp - 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 20322994-20325084(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G003087 Chr01 NC_080387.1:49706262-49706276promoter 内 1621-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 49701859-49703896(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCTATTC
SmilChr06G000527 Chr06 NC_080392.1:4338603-4338617promoter 内 1611-1625 bp + 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 4335056-4336227(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCAAACA
SmilChr02G004114 Chr02 NC_080388.1:63437936-63437950promoter 内 1592-1606 bp - 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 63440345-63441890(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G001257 Chr01 NC_080387.1:25235939-25235953promoter 内 1542-1556 bp + 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 25230481-25233494(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr03G002076 Chr03 NC_080389.1:31748707-31748721promoter 内 1538-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 31733993-31746258(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr07G003517 Chr07 NC_080393.1:40254363-40254377promoter 内 1520-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 40256844-40273096(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACACCTACCCACCC
SmilChr07G000961 Chr07 NC_080393.1:6929877-6929891promoter 内 1339-1353 bp - 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 6932539-6935238(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr06G002180 Chr06 NC_080392.1:30039334-30039348promoter 内 1312-1326 bp + 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 30042023-30043574(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTATTAGTAGGTGGA
SmilChr02G003718 Chr02 NC_080388.1:58800748-58800762promoter 内 1298-1312 bp - 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 58803451-58803524(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTACCTACCATTGT
SmilChr01G005699 Chr01 NC_080387.1:73255606-73255620promoter 内 1268-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 73247640-73252887(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr04G001169 Chr04 NC_080390.1:17481680-17481694promoter 内 1255-1269 bp - 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 17484426-17485847(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTCAG
SmilChr01G004042 Chr01 NC_080387.1:58834502-58834516promoter 内 1220-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 58828095-58831735(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr06G000271 Chr06 NC_080392.1:1828102-1828116promoter 内 1167-1181 bp + 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1830936-1842636(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTGTGGTAGGTACG
SmilChr07G003310 Chr07 NC_080393.1:35113405-35113419promoter 内 1164-1178 bp - 2823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 35107084-35110582(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTAGGGGTAGGTAGA
SmilChr06G000486 Chr06 NC_080392.1:3986501-3986515promoter 内 1150-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3989352-3992943(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G000010 Chr01 NC_080387.1:228272-228286promoter 内 1129-1143 bp + 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 221140-225414(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr07G002077 Chr07 NC_080393.1:18884168-18884182promoter 内 1105-1119 bp + 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 18887064-18887669(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA
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SmilChr03G003715 Chr03 NC_080389.1:56115525-56115539promoter 内 951-965 bp - 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 56118575-56123142(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCAACTACCAAATT
SmilChr08G001368 Chr08 NC_080394.1:10901746-10901760promoter 内 913-927 bp - 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 10904834-10906922(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr05G003562 Chr05 NC_080391.1:47548700-47548714promoter 内 903-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 47551798-47555975(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATGTTGGTAGGTTAA
SmilChr03G004554 Chr03 NC_080389.1:63513262-63513276promoter 内 902-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 63516361-63526829(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G003311 Chr01 NC_080387.1:51796677-51796691promoter 内 850-864 bp - 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51791498-51793540(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTAGGTAGGTGTA