转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 49 / 135 下载 TSV

上一页 49 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002798 Chr01 NC_080387.1:46462710-46462724promoter 内 3641-3655 bp + 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46463070-46469602(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCCCACCTTATCAAT
SmilChr02G004778 Chr02 NC_080388.1:69949923-69949937promoter 内 3412-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69950512-69956552(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGAATTCTTATCCAT
SmilChr02G003943 Chr02 NC_080388.1:61576081-61576095promoter 内 3309-3323 bp + 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 61576773-61582490(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAATTCCTTATCCAG
SmilChr02G004592 Chr02 NC_080388.1:68433822-68433836promoter 内 3272-3286 bp - 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 68420941-68433107(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTACCTTATCTCA
SmilChr01G003326 Chr01 NC_080387.1:51938721-51938735promoter 内 3070-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51939652-51942423(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGAATCTTATCCCA
SmilChr02G002537 Chr02 NC_080388.1:44158146-44158160promoter 内 3028-3042 bp - 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44154115-44157187(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGTCCTTATCCGT
SmilChr02G001196 Chr02 NC_080388.1:22005906-22005920promoter 内 2883-2897 bp + 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 22007024-22012627(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAAATCTTATCCGT
SmilChr01G002797 Chr01 NC_080387.1:46462710-46462724promoter 内 2745-2759 bp + 1242 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46458193-46461468(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTGATAAGGTGGGG
SmilChr02G002736 Chr02 NC_080388.1:47298425-47298439promoter 内 2715-2729 bp - 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 47299711-47301460(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGATAAAT
SmilChr02G003924 Chr02 NC_080388.1:61317252-61317266promoter 内 2642-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 61318611-61324376(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATTTCCTTATCTCT
SmilChr02G002538 Chr02 NC_080388.1:44158146-44158160promoter 内 2240-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44159907-44165662(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGGATAAGGACATT
SmilChr02G002261 Chr02 NC_080388.1:40053252-40053266promoter 内 2174-2188 bp + 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40049104-40051439(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGGATAAGGAATGT
SmilChr01G004153 Chr01 NC_080387.1:60055274-60055288promoter 内 1987-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 60051287-60053274(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGATAAGGTTGCT
SmilChr02G001774 Chr02 NC_080388.1:32513337-32513351promoter 内 1951-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 32508661-32511301(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACCCCCTTATCCTA
SmilChr01G003831 Chr01 NC_080387.1:56642492-56642506promoter 内 1739-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56637261-56640244(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGCAACCTTATCATT
SmilChr02G005472 Chr02 NC_080388.1:74979384-74979398promoter 内 1642-1656 bp - 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 74981743-74983403(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGAGGAA
SmilChr03G000771 Chr03 NC_080389.1:8806533-8806547promoter 内 1383-1397 bp + 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8809151-8810054(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGTTCTTATCCAA
SmilChr02G003543 Chr02 NC_080388.1:56591522-56591536promoter 内 1340-1354 bp + 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56594183-56600988(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATTCCTTATCTAT
SmilChr02G003602 Chr02 NC_080388.1:57257969-57257983promoter 内 1312-1326 bp + 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57260658-57267304(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATTCCTTATCTAT
SmilChr01G005130 Chr01 NC_080387.1:69100503-69100517promoter 内 1244-1258 bp - 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69096784-69097760(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGGACCTTATCCAG
SmilChr01G000693 Chr01 NC_080387.1:15577102-15577116promoter 内 1080-1094 bp - 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 15565832-15574195(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGACATTATCCTC
SmilChr02G003683 Chr02 NC_080388.1:58197062-58197076promoter 内 812-826 bp + 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 58188716-58193887(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGTCTTA
SmilChr02G002590 Chr02 NC_080388.1:45016005-45016019promoter 内 750-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 45019256-45020461(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAATTT
SmilChr03G002635 Chr03 NC_080389.1:41913321-41913335promoter 内 698-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 41916624-41920663(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGATGTGA
SmilChr01G000266 Chr01 NC_080387.1:5129071-5129085promoter 内 669-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5132403-5133228(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAATTT
SmilChr03G000665 Chr03 NC_080389.1:7448864-7448878promoter 内 374-388 bp + 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7444379-7445251(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGGACTCT
SmilChr02G004428 Chr02 NC_080388.1:66632799-66632813promoter 内 350-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 66636450-66640662(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGAGATAAGGTAGAA
SmilChr02G003484 Chr02 NC_080388.1:56108832-56108846promoter 内 336-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56105110-56105181(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGACCCTTATCCTA
SmilChr01G005921 Chr01 NC_080387.1:75039144-75039158promoter 内 188-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 75032688-75035345(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTTTCCTTATCAAT
SmilChr01G003034 Chr01 NC_080387.1:49362922-49362936promoter 内 138-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49366785-49371200(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCAAACCTTATCAAT
SmilChr02G000756 Chr02 NC_080388.1:12339092-12339106promoter 内 2442-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 12333233-12337547(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGATAAGGTAAAA
SmilChr03G002955 Chr03 NC_080389.1:46301698-46301712promoter 内 1406-1420 bp + 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 46304293-46307288(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGCTTCCTTATCTAA
SmilChr03G000708 Chr03 NC_080389.1:7877551-7877565promoter 内 1224-1238 bp + 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 7870485-7874788(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGAATCTG
SmilChr01G003324 Chr01 NC_080387.1:51930355-51930369promoter 内 1148-1162 bp + 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 51933208-51936060(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTAGCCTTATCTGC
SmilChr01G003727 Chr01 NC_080387.1:55595406-55595420promoter 内 475-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 55588948-55591894(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAATATTATC
SmilChr01G004932 Chr01 NC_080387.1:67376409-67376423promoter 内 3717-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 67372644-67376139(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTACCTTATCTCT
SmilChr01G003412 Chr01 NC_080387.1:52779159-52779173promoter 内 3307-3321 bp - 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 52779853-52783945(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGAGATAAGGATTCG
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SmilChr02G002298 Chr02 NC_080388.1:40559041-40559055promoter 内 3233-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 40559809-40561749(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATAAGGATCTG
SmilChr01G000286 Chr01 NC_080387.1:5640965-5640979promoter 内 3161-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 5636395-5640139(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGAGATAAGGATTCG
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SmilChr03G001736 Chr03 NC_080389.1:23369558-23369572promoter 内 1878-1892 bp + 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 23363616-23367449(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGAGAGAG
SmilChr01G004198 Chr01 NC_080387.1:60450550-60450564promoter 内 1674-1688 bp - 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 60452877-60464940(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGAGATAAGGTAATT
SmilChr01G000328 Chr01 NC_080387.1:6697096-6697110promoter 内 1663-1677 bp + 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 6699434-6701465(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTACCTTATCATT
SmilChr02G002263 Chr02 NC_080388.1:40086197-40086211promoter 内 1448-1462 bp + 2539 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 40081593-40083658(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGTGGCT